Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06095
- Subject:
- NM_001320136.2
- Aligned Length:
- 1025
- Identities:
- 802
- Gaps:
- 214
Alignment
Query 1 ATGCTCCAGAAGCCCAAGAGCGTGAAGCTGCGGGCCCTGCGCAGCCCGAGGAAGTTCGGCGTGGCTGGCCGGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTGCCAGGAGGTGCTGCGCAAGGGCTGTCTCCGCTTCCAGCTCCCTGAGCGCGGTTCCCGGCTGTGCCTGTACG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGATGGCACGGAGCTGACGGAAGATTACTTCCCCA---GTGTTCCCGACAACGCCGAGCTGGTGCTGCTCACC 219
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Sbjct 1 -----------------------------------ATGTGTCTTC------------TGCTGGACCGG--CACC 25
Query 220 ------TTGGGCCA--GGCCTGGCAGGGCTATGTGAGCGACATCAGGCGCTTCCTCAGTGCATTTCACGAGCCA 285
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Sbjct 26 TTTTGTTTGTCCCATTGG--TGGCAG----ATGTGAGCGACATCAGGCGCTTCCTCAGTGCATTTCACGAGCCA 93
Query 286 CAGGTGGGGCTCATCCAGGCCGCCCAGCAGCTGCTGTGTGATGAGCAGGCCCCACAGAGGCAGAGGCTGCTGGC 359
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Sbjct 94 CAGGTGGGGCTCATCCAGGCCGCCCAGCAGCTGCTGTGTGATGAGCAGGCCCCACAGAGGCAGAGGCTGCTGGC 167
Query 360 TGACCTCCTGCACAACGTCAGCCAGAACATCGCGGCCGAGACCCGGGCTGAGGACCCGCCGTGGTTTGAAGGCT 433
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Sbjct 168 TGACCTCCTGCACAACGTCAGCCAGAACATCGCGGCCGAGACCCGGGCTGAGGACCCGCCGTGGTTTGAAGGCT 241
Query 434 TGGAGTCCCGATTTCAGAGCAAGTCTGGCTATCTGAGATACAGCTGTGAGAGCCGGATCCGGAGTTACCTGAGG 507
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Sbjct 242 TGGAGTCCCGATTTCAGAGCAAGTCTGGCTATCTGAGATACAGCTGTGAGAGCCGGATCCGGAGTTACCTGAGG 315
Query 508 GAGGTGAGCTCCTACCCCTCCACAGTGGGTGCGGAGGCTCAGGAGGAATTCCTGCGGGTCCTCGGCTCCATGTG 581
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Sbjct 316 GAGGTGAGCTCCTACCCCTCCACGGTGGGTGCGGAGGCTCAGGAGGAATTCCTGCGGGTCCTCGGCTCCATGTG 389
Query 582 CCAGAGGCTCCGGTCCATGCAGTACAATGGCAGCTACTTCGACAGAGGAGCCAAGGGCGGCAGCCGCCTCTGCA 655
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Sbjct 390 CCAGAGGCTCCGGTCCATGCAGTACAATGGCAGCTACTTCGACAGAGGAGCCAAGGGCGGCAGCCGCCTCTGCA 463
Query 656 CACCGGAAGGCTGGTTCTCCTGCCAGGGTCCCTTTGACATGGACAGCTGCTTATCAAGACACTCCATCAACCCC 729
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Sbjct 464 CACCGGAAGGCTGGTTCTCCTGCCAGGGTCCCTTTGACATGGACAGCTGCTTATCAAGACACTCCATCAACCCC 537
Query 730 TACAGTAACAGGGAGAGCAGGATCCTCTTCAGCACCTGGAACCTGGATCACATAATAGAAAAGAAACGCACCAT 803
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Sbjct 538 TACAGTAACAGGGAGAGCAGGATCCTCTTCAGCACCTGGAACCTGGATCACATAATAGAAAAGAAACGCACCAT 611
Query 804 CATTCCTACACTGGTGGAAGCAATTAAGGAACAAGATGGAAGAGAAGTGGACTGGGAGTATTTTTATGGCCTGC 877
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Sbjct 612 CATTCCTACACTGGTGGAAGCAATTAAGGAACAAGATGGAAGAGAAGTGGACTGGGAGTATTTTTATGGCCTGC 685
Query 878 TTTTTACCTCAGAGAACCTAAAACTAGTGCACATTGTCTGCCATAAGAAAACCACCCACAAGCTCAACTGTGAC 951
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Sbjct 686 TTTTTACCTCAGAGAACCTAAAACTAGTGCACATTGTCTGCCATAAGAAAACCACCCACAAGCTCAACTGTGAC 759
Query 952 CCGAGCAGAATCTACAAACCCCAGACAAGGTTGAAGCGGAAGCAGCCTGTGCGGAAACGCCAG 1014
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Sbjct 760 CCAAGCAGAATCTACAAACCCCAGACAAGGTTGAAGCGGAAGCAGCCTGTGCGGAAACGCCAG 822