Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06149
- Subject:
- NM_001330654.2
- Aligned Length:
- 1833
- Identities:
- 1714
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG 74
Query 75 GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG 148
Query 149 ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC 222
Query 223 ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT 296
Query 297 TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAAT---------- 360
Query 371 TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT 444
Sbjct 361 -------------------------------------------------------------------------- 360
Query 445 TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ---------------------------------TCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA 401
Query 519 AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG 475
Query 593 ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC 549
Query 667 AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG 623
Query 741 GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624 GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT 697
Query 815 CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698 CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC 771
Query 889 CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA 845
Query 963 TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG 919
Query 1037 ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 920 ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT 993
Query 1111 GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 994 GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA 1067
Query 1185 ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA 1141
Query 1259 CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAAATGCACGAAGGAGAGAGAGTGAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAAATGCACGAAGGAGAGAGAGTGAGAAG 1215
Query 1333 TCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACCTCCCAAACCTGATCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 TCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACCTCCCAAACCTGATCA 1289
Query 1407 GCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTTCTAACCCTCCTGCTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 GCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTTCTAACCCTCCTGCTC 1363
Query 1481 GATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCTCCAGCTCAACCATCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364 GATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCTCCAGCTCAACCATCT 1437
Query 1555 GAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGGCCAAACTGGGAACTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGGCCAAACTGGGAACTC 1511
Query 1629 TAGCCGTGGTCCAGGAGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAGATGGCAAAAAGGATC 1702
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512 TAGCCGTGGTCCAGGCGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAGATGGCAAAAAGGATC 1585
Query 1703 AAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCTAAGTTCAGTTCTGCAAGCAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 AAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCCAAGTTCAGTTCTGCAAGCAAG 1659
Query 1777 TATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA 1833
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 TATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA 1716