Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06154
- Subject:
- NM_001163399.1
- Aligned Length:
- 1113
- Identities:
- 1033
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ----------ATGGTT-----ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC 59
||||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTGGAATGGCTTGAAGATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATAC 74
Query 60 AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||
Sbjct 75 AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCA 148
Query 134 AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATT 222
Query 208 GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA 281
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA 296
Query 282 TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG 370
Query 356 TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG 429
|.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 TGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATG 444
Query 430 ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT 503
|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||
Sbjct 445 ACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGT 518
Query 504 CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC 577
||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 CACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGAC 592
Query 578 TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC 651
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC 666
Query 652 AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA 725
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 667 AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCA 740
Query 726 GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA 799
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 741 AAGATTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGA 814
Query 800 TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC 873
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 815 TGACAAGTCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCC 888
Query 874 CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG 947
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 889 CCTGATTCTGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCG 962
Query 948 TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 963 TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCA 1036
Query 1022 TCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG 1095
||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 TCGCCAGCCTCAATGGCTATCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAA 1110
Query 1096 TCC 1098
|||
Sbjct 1111 TCC 1113