Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06154
Subject:
NM_001294348.2
Aligned Length:
1113
Identities:
1093
Gaps:
15

Alignment

Query    1  ----------ATGGTT-----ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  59
                      ||||.|     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTGGAATGGCTTGAAGATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  74

Query   60  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  148

Query  134  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  222

Query  208  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  296

Query  282  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  370

Query  356  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  429
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCTGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  444

Query  430  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT  503
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  445  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGATCAAGT  518

Query  504  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  592

Query  578  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  666

Query  652  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  725
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCCAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  740

Query  726  GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA  814

Query  800  TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC  888

Query  874  CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG  962

Query  948  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA  1036

Query 1022  TCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG  1095
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGCCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG  1110

Query 1096  TCC  1098
            |||
Sbjct 1111  TCC  1113