Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06154
- Subject:
- NM_001324209.2
- Aligned Length:
- 1098
- Identities:
- 1052
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGGTTATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTC 74
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATG---ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTC 71
Query 75 CAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 CAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCG 145
Query 149 TCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 TCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCC 219
Query 223 TGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 TGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGA 293
Query 297 TGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 TGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTC 367
Query 371 CGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTG 444
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 CGAGCTCTGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTG 441
Query 445 GAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 442 GAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGAGTGTCCAG 515
Query 519 AGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 AGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGC 589
Query 593 CCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 CCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTC 663
Query 667 TCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGA 740
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 TCCCAGCTCTACCAGTCCCCCAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTC-------- 729
Query 741 CAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 -------------------------------AGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGG 772
Query 815 GAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 GAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAG 846
Query 889 AGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 AGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAA 920
Query 963 CAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 921 CAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAACG 994
Query 1037 GGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 GGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC 1056