Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06154
- Subject:
- NM_001324215.2
- Aligned Length:
- 1113
- Identities:
- 1054
- Gaps:
- 54
Alignment
Query 1 ----------ATGGTT-----ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC 59
||||.| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTGGAATGGCTTGAAGATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC 74
Query 60 AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA 148
Query 134 AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT 222
Query 208 GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA 296
Query 282 TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG 370
Query 356 TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG 429
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCTGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG 444
Query 430 ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT 503
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 445 ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGATCAAGT 518
Query 504 CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC 592
Query 578 TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC 666
Query 652 AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA 725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCCAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA 740
Query 726 GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA 799
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGGTTC---------------------------------------AGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA 775
Query 800 TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC 849
Query 874 CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG 923
Query 948 TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA 997
Query 1022 TCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG 1095
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TCGCCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG 1071
Query 1096 TCC 1098
|||
Sbjct 1072 TCC 1074