Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06154
• Subject: XM_011540890.2
• Aligned Length: 1208
• Identities: 1053
• Gaps: 151

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGAGATATCTGCAACCTTTGGGATGTGTGCATGGTGGCAAGGGGCTGACTGATATGAGATTACTTCTTTT  74

Query    1  ------------------------------------ATGGTTATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTC  38
                                                ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGGGAAATTGTCATTAATGAGTCAAGAAACTGCTCAT--TTATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTC  146

Query   39  AAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAG  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  AAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAG  220

Query  113  GGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTC  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  GGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTC  294

Query  187  AGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTT  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  AGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTT  368

Query  261  AGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGAC  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  AGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGAC  442

Query  335  TCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTT  408
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  TCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCTGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTT  516

Query  409  AGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTC  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  AGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTC  590

Query  483  ACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGG  556
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  ACGAATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGG  664

Query  557  CAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCC  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  CAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCC  738

Query  631  AACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGG  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  739  AACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCCAACCGGCGCTACCCAGG  812

Query  705  TCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCT  778
            ||||||||||||||||||||||||||||                                       |||||||
Sbjct  813  TCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTC---------------------------------------AGGTTCT  847

Query  779  CCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGC  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  CCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGC  921

Query  853  ATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGT  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  ATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGT  995

Query  927  GAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACT  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  GAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACT  1069

Query 1001  ATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTT  1074
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070  ATGATGAGGCGGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTT  1143

Query 1075  AAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144  AAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1167