Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06167
- Subject:
- NM_023580.4
- Aligned Length:
- 2949
- Identities:
- 2532
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCT---AGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCG 71
|||||||||||||||||||||||||| |..||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCTTGCATTGCTGCTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCG 74
Query 72 CGCCAAGGAAGTTACTCTGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAG 145
||||.|||||||.|||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||||||||| |.||
Sbjct 75 CGCCGAGGAAGTCACTCTAATGGACACAAGCACAGCACAAGGAGAGCTGGGCTGGCTTCTGGATCCCCC-AGAG 147
Query 146 A-TGGGTGGAGTGAACAGCAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGG 218
| ||||||||||||...||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|.
Sbjct 148 ACTGGGTGGAGTGAGGTGCAACAAATGCTAAACGGGACACCCCTGTACATGTACCAAGACTGCCCAATACAGGA 221
Query 219 ACGCAGAGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGG 292
|.|..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||.||||||
Sbjct 222 AGGTGGGGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGAGAGGAAGCTTCACGCATCTACGTGG 295
Query 293 AGCTGCAGTTCACCGTGCGGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTC 366
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 296 AGCTGCAGTTCACCGTGCGGGACTGTAAGAGTTTCCCAGGGGGAGCTGGGCCTCTGGGATGCAAAGAGACCTTC 369
Query 367 AACCTTCTGTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCAC 440
||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 370 AACCTTTTCTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGACCTTTGTTCCAAAAGGTAACAAC 443
Query 441 GGTGGCTGCAGACCAGAGCTTCACCATTCGAGACCTTGCGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCT 514
.|||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 444 TGTGGCAGCAGACCAGAGCTTCACCATCAGAGACCTGGCATCTGGCTCTGTAAAGCTGAATGTAGAACGCTGCT 517
Query 515 CTCTGGGCCGCCTGACCCGCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCT 588
|..||||||.|||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct 518 CGTTGGGCCACCTCACCCGCCGTGGCCTCTACTTAGCTTTCCACAACCCGGGTTCCTGTGTGGCGCTAGTGTCT 591
Query 589 GTCCGGGTCTTCTACCAGCGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCC 662
||..||||.|||||||||||||||.|.||||||.||.|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 592 GTAAGGGTGTTCTACCAGCGCTGTGCCGAGACCGTGCATGGCTTGGCCCACTTCCCTGACACTCTCCCTGGACC 665
Query 663 CGCTGGGTTGGTGGAAGTGGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCC 736
.|..||||||||.|||||.||.||.||.|||.|..||||.||.|.|..||||....||.||||||||.||||.|
Sbjct 666 TGGAGGGTTGGTTGAAGTAGCTGGAACGTGCCTCTCCCATGCACAGATCAGCTTGGGGTCCTCAGGTACACCAC 739
Query 737 GCATGCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAA 810
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 740 GAATGCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTGGGTCAGTGCCAGTGCGAGCCTGGCTATGAAGAA 813
Query 811 GGTGGCAGTGGCGAAGCATGTG-------TTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCC 877
.|||||| ||| ||||| .||||||.||||..||.|.|||.||..||||||||.|.||||.||
Sbjct 814 ---AGCAGTG--GAA--ATGTGGGATGCACTGCCTGTCCTACTGGTTTCTATCGAGTGGACATGAATACACTCC 880
Query 878 ATTGTCTCACGTGCCCCCAGCAGAGCACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCAT 951
.||||||||.|||||||||.||.||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||.|||
Sbjct 881 GTTGTCTCAAGTGCCCCCAACATAGCATAGCAGAGTCTGAGGGGTCTACCATCTGTACCTGTGAGAATGGACAT 954
Query 952 TACAGAGCTCCCGGGGAGGGCCCCCAGGTGGCATGCACAGGTCCCCCCTCGGCCCCCCGAAACCTGAGCTTCTC 1025
||..||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||||.|||.|||||||||||
Sbjct 955 TATCGAGCCCCTGGGGAGGGTCCCCAGGTAGCATGCACACGTCCCCCATCGGCTCCCCAAAATCTGAGCTTCTC 1028
Query 1026 TGCCTCAGGGACTCAGCTCTCCCTGCGTTGGGA-ACCCCCAGCAGATACGGGGGGACGCCAGGATGTCAGATAC 1098
..|.|||||||||||.|||||||||||.||||| .||||||| ||||||.|||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1029 CACATCAGGGACTCAACTCTCCCTGCGCTGGGAGCCCCCCAG-AGATACAGGGGGACGCCATGATATCAGATAC 1101
Query 1099 AGTGTGAGGTGTTCCCAGTGTCAGGGCACAGCACAGGACGGGGGGCCCTGCCAGCCCTGTGG----GGTGGGCG 1168
||.|||..|||.|..|||||||.|||||..||||||||.|||||.||||||||.|||||||| ||| |
Sbjct 1102 AGCGTGGAGTGCTTGCAGTGTCGGGGCATTGCACAGGATGGGGGTCCCTGCCAACCCTGTGGAAAAGGT----G 1171
Query 1169 TGCACTTCTCGCCGGGGGC--CCGGGGGCTCACCACACCTGCAGTGCATGT-CAATGGCCTTGAACCTTATGCC 1239
|||||||.||.||||..|| || ||||||||||||.||.|.|||||.|| ||| |||||.||.|||||.|||
Sbjct 1172 TGCACTTTTCCCCGGCTGCTTCC--GGGCTCACCACATCTACCGTGCAAGTGCAA-GGCCTCGAGCCTTACGCC 1242
Query 1240 AACTACACCTTTAATGTGGAAGCCCAAAATGGAGTGTCAGGGCTGGGCAGCTCTGGCCATGCCAGCACCTCAGT 1313
||||||||.||||..||..||.|||||||..||||||||||.||||.|||.||..|||.|..||||.||||..|
Sbjct 1243 AACTACACATTTACCGTCAAATCCCAAAACAGAGTGTCAGGACTGGACAGTTCCAGCCCTAGCAGCGCCTCCCT 1316
Query 1314 CAGCATCAGCATGGGGCATGCAGAGTCACTGTCAGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAAC 1387
|||.||||.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1317 CAGTATCAACATGGGGCACGCAGAGTCACTCTCTGGCCTGTCACTGAAGCTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAGC 1390
Query 1388 TAGAGCTGACCTGGGCGGGGTCCCGGCCCCGAAGCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAAC 1461
|.||||||||.|||||.||||||||.|||||||..|||||.|.|||.||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1391 TGGAGCTGACTTGGGCAGGGTCCCGACCCCGAAATCCTGGAGGGAATCTGAGCTATGAGCTGCACGTGCTGAAT 1464
Query 1462 CAGGATGAAGAACGGTACCAGATGGTTCTAGAACCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATA 1535
|||||.||||||.||.||||||||||..|.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1465 CAGGACGAAGAATGGCACCAGATGGTGTTGGAACCCAGGGTCTTGCTGACAAAACTTCAGCCAGATACCACATA 1538
Query 1536 CATCGTCAGAGTCCGAATGCTGACCCCACTGGGTCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCC 1609
|||.||||||||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1539 CATTGTCAGAGTGCGAACACTGACCCCACTGGGGCCTGGCCCTTTCTCCCCTGACCATGAGTTTCGGACAAGCC 1612
Query 1610 CACCAGTGTCCAGGGGCCTGACTGGAGGAGAGATTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTG 1683
|||||||.|||||..|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||...|||..||
Sbjct 1613 CACCAGTTTCCAGAAGCCTGACCGGAGGAGAGATTGTGGCCGTCATCTTTGGATTGCTGCTTGGAATAGCTCTG 1686
Query 1684 CTGCTTGGGATTCTCGTTTTCCGGTCCAGGAGAGCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCAC 1757
|||.|.||||||...||.|||||.||.|||||||.||||.|.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1687 CTGATCGGGATTTATGTCTTCCGTTCAAGGAGAGGCCAGAGACAGAGACAGCAGAGGCAGCGTGAACGCACCAC 1760
Query 1758 CGATGTGGATCGAGAGGACAAGCTGTGGCTGAAGCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGG 1831
|.||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1761 CAATGTCGATCGAGAGGACAAGCTGTGGCTAAAACCCTATGTGGACCTCCAGGCCTATGAGGACCCTGCACAGG 1834
Query 1832 GAGCCTTGGACTTTACCCGGGAGCTTGATCCAGCGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTT 1905
|||||||.||||||.|||.|||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1835 GAGCCTTAGACTTTGCCCAGGAACTGGACCCAGCCTGGCTGATTGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGGGAGTTT 1908
Query 1906 GGGGAAGTGTATCGAGGGA-CCCTGAGGCTCCCCAGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAG 1978
||.||||||||||| |||| |||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1909 GGTGAAGTGTATCG-GGGAGCCCTGAGACTCCCCAGCCAAGATTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTGAAAG 1981
Query 1979 ACACATCCCCAGGTGGCCAGTGGTGGAACTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCAT 2052
|.||||||||||.||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||.
Sbjct 1982 ATACATCCCCAGATGGCTACTGGTGGAATTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTCAACCACCCACAC 2055
Query 2053 ATTCTGCATCTGGAAGGCGTCGTCACAAAGCGAAAGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGC 2126
|||||.|..||.|||||.|||.|||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2056 ATTCTACGCCTAGAAGGTGTCATCACAAAAAGAAAGCCCATCATGATCATCACAGAATTTATGGAAAATGGAGC 2129
Query 2127 CCTGGATGCCTTCCTGAGGGAGCGGGAGGACCAGCTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAG 2200
||||||||||||.||||.|||.|||||||||||.||.|..|||||.|||||||||||.|||||.|.||||||||
Sbjct 2130 CCTGGATGCCTTTCTGAAGGAACGGGAGGACCAACTAGCTCCTGGTCAGCTAGTGGCTATGCTACTGGGCATAG 2203
Query 2201 CATCTGGCATGAACTACCTCAGTAATCACAATTATGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAAT 2274
||||.||||||||||.|||||||...||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2204 CATCAGGCATGAACTGCCTCAGTGGCCACAATTATGTCCATAGAGACCTGGCTGCCAGGAACATCTTGGTGAAT 2277
Query 2275 CAAAACCTGTGCTGCAAGGTGTCTGACTTTGGCCTGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAAC 2348
||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 2278 CAGAACCTGTGCTGCAAGGTGTCTGACTTTGGCTTGACCCGCCTCCTGGATGACTTTGACGGCACCTATGAAAC 2351
Query 2349 CCAGGGAGGAAAGATCCCTATCCGTTGGACAGCCCCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCG 2422
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2352 CCAGGGAGGAAAGATCCCCATCCGATGGACAGCCCCAGAAGCTATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGTG 2425
Query 2423 ATGTGTGGAGCTTTGGGATTGTGATGTGGGAGGTGCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAAT 2496
||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2426 ATGTGTGGAGCTTTGGGATTGTAATGTGGGAGGTGTTGAGTTTTGGCGACAAACCCTATGGGGAGATGAGCAAC 2499
Query 2497 CAGGAGGTTATGAAGAGCATTGAGGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGA 2570
||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2500 CAAGAGGTAATGAAAAGCATTGAAGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGTCCTGCCCCTCTCTATGA 2573
Query 2571 GCTCATGAAGAACTGCTGGGCATATGACCGTGCCCGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGC 2644
.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||...||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2574 ACTCATGAAGAACTGCTGGGCTTACGATCGTGCCCGTCGACCCCACTTCCTCCAGCTGCAGGCACATCTGGAAC 2647
Query 2645 AACTGCTTGCCAACCCCCACTCCCTGCGGACCATTGCCAACTTTGACCCCAGGGTGACTCTT-CGCCTGCCCAG 2717
|..|||||.|..|||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.|||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2648 AGTTGCTTACTGACCCCCATTCCCTAAGGACAATTGCCAACTTTGACCCTAGGGTGAC-CTTACGCCTGCCCAG 2720
Query 2718 CCTGAGTGGCTCAGATGGGATCCCGTATCGAACCGTCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACA 2791
||||||||||||.|||||||||||.|||||||..||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2721 CCTGAGTGGCTCTGATGGGATCCCTTATCGAAGTGTCTCTGAGTGGCTTGAATCCATACGCATGAAGCGCTACA 2794
Query 2792 TCCTGCACTTCCACTCGGCTGGGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAG 2865
||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2795 TCCTGCACTTCCGTTCGGCTGGGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACGGCTGAGGACCTGACGCAG 2868
Query 2866 ATGGGAATCACACTGCCCGGGCACCAGAAGCGCATTCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGAC 2928
||||||||.||..||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2869 ATGGGAATAACGTTGCCAGGGCACCAGAAACGAATTCTCTGCAGTATTCAAGGATTTAAGGAC 2931