Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06169
• Subject: NM_001288629.2
• Aligned Length: 998
• Identities: 993
• Gaps: 5

Alignment

Query   1  MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISGLDENYTPIRTYQVC  74
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Sbjct   1  MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISGLDENYTPIRTYQVC  74

Query  75  QVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCKETFNLYYYETDYDTGRNIRENLYVKIDT  148
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Sbjct  75  QVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCKETFNLYYYETDYDTGRNIRENLYVKIDT  148

Query 149  IAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGS  222
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Sbjct 149  IAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGS  222

Query 223  EFSSLVEVRGTCVSSAEEEAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCSRC  296
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Sbjct 223  EFSSLVEVRGTCVSSAEEEAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCSRC  296

Query 297  PTHSFSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPPADNGGRNDVTYRILCK  370
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Sbjct 297  PTHSFSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPPADNGGRNDVTYRILCK  370

Query 371  RCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFEVEAVNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPS  444
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Sbjct 371  RCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFEVEAVNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPS  444

Query 445  QVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAF  518
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Sbjct 445  QVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAF  518

Query 519  TAAGYGNYSPRLDVATLEEATGKMFEATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEG  592
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Sbjct 519  TAAGYGNYSPRLDVATLEEAT-----ATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEG  587

Query 593  DEELYFHFKFPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDVAVAIKT  666
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Sbjct 588  DEELYFHFKFPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDVAVAIKT  661

Query 667  LKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALDAFLRKHDGQFTVIQLVGMLR  740
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Sbjct 662  LKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALDAFLRKHDGQFTVIQLVGMLR  735

Query 741  GIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFT  814
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Sbjct 736  GIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFT  809

Query 815  SASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVG  888
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Sbjct 810  SASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVG  883

Query 889  ILDKMIRNPNSLKTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTIED  962
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Sbjct 884  ILDKMIRNPNSLKTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTIED  957

Query 963  VMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV  998
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Sbjct 958  VMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV  993