Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06169
- Subject:
- XM_005248669.3
- Aligned Length:
- 2994
- Identities:
- 2980
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTGGCTGCTCCGCTTTGCACACACAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTGGCTGCTCCGCTTTGCACACACAGG 74
Query 75 GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGGATTTCCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGGATTTCCT 148
Query 149 CTCCACCCAATGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCCACCCAATGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGC 222
Query 223 CAAGTCATGGAGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAATGCACAAAGGATTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGTCATGGAGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAATGCACAAAGGATTTT 296
Query 297 TGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAGTCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAGTCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTA 370
Query 371 ATTTGTACTATTATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTAAAAATAGACACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTGTACTATTATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTAAAAATAGACACC 444
Query 445 ATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGA 518
Query 519 GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCTTTGGTTTCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCTTTGGTTTCTG 592
Query 593 TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAACTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAACTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCA 666
Query 667 GAATTTTCCTCTTTAGTCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAATTTTCCTCTTTAGTCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAG 740
Query 741 GATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGGAAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGGAAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAA 814
Query 815 AAGGAGACACTTGTGAACCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTTCAGTGCTCTCGTTGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGGAGACACTTGTGAACCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTTCAGTGCTCTCGTTGT 888
Query 889 CCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTCCAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTCCAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATC 962
Query 963 TGACCCACCATACGTTGCATGCACAAGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTCATTTTCAACATCAACCAAACCA 1036
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGACCCACCATACGTTGCGTGCACAAGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTCATTTTCAACATCAACCAAACCA 1036
Query 1037 CAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGCAGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGCAGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAG 1110
Query 1111 CGGTGCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACTGGATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGTGCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACTGGATT 1184
Query 1185 AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTGCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTGCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATG 1258
Query 1259 GAGTTTCTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACTGGTCAAGCAGCTCCCTCG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGTTTCTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACTGGTCAAGCAGCTCCCTCG 1332
Query 1333 CAAGTGAGCGGAGTAATGAAGGAGAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATCC 1406
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAAGTGAGTGGAGTAATGAAGGAGAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATCC 1406
Query 1407 CAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAA 1480
Query 1481 AAACCAAGTCTACTTCAGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTCGGGCTTTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAACCAAGTCTACTTCAGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTCGGGCTTTT 1554
Query 1555 ACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTTGCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTAAAATGTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTTGCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTAAAATGTT 1628
Query 1629 TGAAGCTACAGCTGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGAAGCTACAGCTGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA 1702
Query 1703 TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGC 1776
Query 1777 GATGAAGAGCTTTACTTTCATTTTAAATTTCCAGGCACCAAAACCTACATTGACCCTGAAACCTATGAGGACCC 1850
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GATGAAGAGCTTTACTTTCATT------------GCACCAAAACCTACATTGACCCTGAAACCTATGAGGACCC 1838
Query 1851 AAATAGAGCTGTCCATCAATTCGCCAAGGAGCTAGATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 AAATAGAGCTGTCCATCAATTCGCCAAGGAGCTAGATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGCAG 1912
Query 1925 GAGAATTCGGTGAAGTCTGCAGTGGCCGTTTGAAACTTCCAGGGAAAAGAGATGTTGCAGTAGCCATAAAAACC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 GAGAATTCGGTGAAGTCTGCAGTGGCCGTTTGAAACTTCCAGGGAAAAGAGATGTTGCAGTAGCCATAAAAACC 1986
Query 1999 CTGAAAGTTGGTTACACAGAAAAACAAAGGAGAGACTTTTTGTGTGAAGCAAGCATCATGGGGCAGTTTGACCA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 CTGAAAGTTGGTTACACAGAAAAACAAAGGAGAGACTTTTTGTGTGAAGCAAGCATCATGGGGCAGTTTGACCA 2060
Query 2073 CCCGAATGTTGTCCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAGGGAAACCAGTCATGATAGTAATAGAGTTCATGGAAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 CCCGAATGTTGTCCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAGGGAAACCAGTCATGATAGTAATAGAGTTCATGGAAA 2134
Query 2147 ATGGAGCCCTAGATGCATTTCTCAGGAAACATGATGGGCAATTTACAGTCATTCAGTTAGTAGGAATGCTGAGA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 ATGGAGCCCTAGATGCATTTCTCAGGAAACATGATGGGCAATTTACAGTCATTCAGTTAGTAGGAATGCTGAGA 2208
Query 2221 GGAATTGCTGCTGGAATGAGATATTTGGCTGATATGGGATATGTTCACAGGGACCTTGCAGCTCGCAATATTCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 GGAATTGCTGCTGGAATGAGATATTTGGCTGATATGGGATATGTTCACAGGGACCTTGCAGCTCGCAATATTCT 2282
Query 2295 TGTCAACAGCAATCTCGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTGTCCCGAGTTATAGAGGATGATCCAGAAGCTG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 TGTCAACAGCAATCTCGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTGTCCCGAGTTATAGAGGATGATCCAGAAGCTG 2356
Query 2369 TCTATACAACTACTGGTGGAAAAATTCCAGTAAGGTGGACAGCACCCGAAGCCATCCAGTACCGGAAATTCACA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357 TCTATACAACTACTGGTGGAAAAATTCCAGTAAGGTGGACAGCACCCGAAGCCATCCAGTACCGGAAATTCACA 2430
Query 2443 TCAGCCAGTGATGTATGGAGCTATGGAATAGTCATGTGGGAAGTTATGTCTTATGGAGAAAGACCTTATTGGGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431 TCAGCCAGTGATGTATGGAGCTATGGAATAGTCATGTGGGAAGTTATGTCTTATGGAGAAAGACCTTATTGGGA 2504
Query 2517 CATGTCAAATCAAGATGTTATAAAAGCAATAGAAGAAGGTTATCGTTTACCAGCACCCATGGACTGCCCAGCTG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 CATGTCAAATCAAGATGTTATAAAAGCAATAGAAGAAGGTTATCGTTTACCAGCACCCATGGACTGCCCAGCTG 2578
Query 2591 GCCTTCACCAGCTAATGTTGGATTGTTGGCAAAAGGAGCGTGCTGAAAGGCCAAAATTTGAACAGATAGTTGGA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 GCCTTCACCAGCTAATGTTGGATTGTTGGCAAAAGGAGCGTGCTGAAAGGCCAAAATTTGAACAGATAGTTGGA 2652
Query 2665 ATTCTAGACAAAATGATTCGAAACCCAAATAGTCTGAAAACTCCCCTGGGAACTTGTAGTAGGCCAATAAGCCC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 ATTCTAGACAAAATGATTCGAAACCCAAATAGTCTGAAAACTCCCCTGGGAACTTGTAGTAGGCCAATAAGCCC 2726
Query 2739 TCTTCTGGATCAAAACACTCCTGATTTCACTACCTTTTGTTCAGTTGGAGAATGGCTACAAGCTATTAAGATGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727 TCTTCTGGATCAAAACACTCCTGATTTCACTACCTTTTGTTCAGTTGGAGAATGGCTACAAGCTATTAAGATGG 2800
Query 2813 AAAGATATAAAGATAATTTCACGGCAGCTGGCTACAATTCCCTTGAATCAGTAGCCAGGATGACTATTGAGGAT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2801 AAAGATATAAAGATAATTTCACGGCAGCTGGCTACAATTCCCTTGAATCAGTAGCCAGGATGACTATTGAGGAT 2874
Query 2887 GTGATGAGTTTAGGGATCACACTGGTTGGTCATCAAAAGAAAATCATGAGCAGCATTCAGACTATGAGAGCACA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 GTGATGAGTTTAGGGATCACACTGGTTGGTCATCAAAAGAAAATCATGAGCAGCATTCAGACTATGAGAGCACA 2948
Query 2961 AATGCTACATTTACATGGAACTGGCATTCAAGTG 2994
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 AATGCTACATTTACATGGAACTGGCATTCAAGTG 2982