Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06169
• Subject: XM_005248671.3
• Aligned Length: 2996
• Identities: 1819
• Gaps: 1168

Alignment

Query    1  ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTGGCTGCTCCGCTTTGCACACACAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTGGCTGCTCCGCTTTGCACACACAGG  74

Query   75  GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGGATTTCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGGATTTCCT  148

Query  149  CTCCACCCAATGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCACCCAATGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGC  222

Query  223  CAAGTCATGGAGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAATGCACAAAGGATTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGTCATGGAGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAATGCACAAAGGATTTT  296

Query  297  TGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAGTCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAGTCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTA  370

Query  371  ATTTGTACTATTATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTAAAAATAGACACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTTGTACTATTATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTAAAAATAGACACC  444

Query  445  ATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGA  518

Query  519  GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCTTTGGTTTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCTTTGGTTTCTG  592

Query  593  TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAACTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAACTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCA  666

Query  667  GAATTTTCCTCTTTAGTCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATTTTCCTCTTTAGTCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAG  740

Query  741  GATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGGAAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGGAAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAA  814

Query  815  AAGGAGACACTTGTGAACCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTTCAGTGCTCTCGTTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGAGACACTTGTGAACCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTTCAGTGCTCTCGTTGT  888

Query  889  CCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTCCAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTCCAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATC  962

Query  963  TGACCCACCATACGTTGCATGCACAAGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTCATTTTCAACATCAACCAAACCA  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACCCACCATACGTTGCGTGCACAAGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTCATTTTCAACATCAACCAAACCA  1036

Query 1037  CAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGCAGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGCAGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAG  1110

Query 1111  CGGTGCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACTGGATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGTGCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACTGGATT  1184

Query 1185  AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTGCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTGCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATG  1258

Query 1259  GAGTTTCTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACTGGTCAAGCAGCTCCCTCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGTTTCTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACTGGTCAAGCAGCTCCCTCG  1332

Query 1333  CAAGTGAGCGGAGTAATGAAGGAGAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATCC  1406
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAAGTGAGTGGAGTAATGAAGGAGAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATCC  1406

Query 1407  CAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAA  1480

Query 1481  AAACCAAGTCTACTTCAGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTCGGGCTTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAACCAAGTCTACTTCAGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTCGGGCTTTT  1554

Query 1555  ACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTTGCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTAAAATGTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTTGCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTAAAATGTT  1628

Query 1629  TGAAGCTACAGCTGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAAGCTACAGCTGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA  1702

Query 1703  TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGC  1776

Query 1777  GATGAAGAGCTTTACTTTCAT--TTTAAATTTCCAGGCACCAAAACCTACATTGACCCTGAAACCTATGAGGAC  1848
            |||||||||||||||||||||  ||||                                |.|||..|||||   
Sbjct 1777  GATGAAGAGCTTTACTTTCATTCTTTA--------------------------------GTAACAAATGAG---  1815

Query 1849  CCAAATAGAGCTGTCCATCAATTCGCCAAGGAGCTAGATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGC  1922
                   .|.||||                              |.||.|||                      
Sbjct 1816  -------CATCTGT------------------------------CAGTTTTA----------------------  1830

Query 1923  AGGAGAATTCGGTGAAGTCTGCAGTGGCCGTTTGAAACTTCCAGGGAAAAGAGATGTTGCAGTAGCCATAAAAA  1996
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 1997  CCCTGAAAGTTGGTTACACAGAAAAACAAAGGAGAGACTTTTTGTGTGAAGCAAGCATCATGGGGCAGTTTGAC  2070
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2071  CACCCGAATGTTGTCCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAGGGAAACCAGTCATGATAGTAATAGAGTTCATGGA  2144
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2145  AAATGGAGCCCTAGATGCATTTCTCAGGAAACATGATGGGCAATTTACAGTCATTCAGTTAGTAGGAATGCTGA  2218
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2219  GAGGAATTGCTGCTGGAATGAGATATTTGGCTGATATGGGATATGTTCACAGGGACCTTGCAGCTCGCAATATT  2292
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2293  CTTGTCAACAGCAATCTCGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTGTCCCGAGTTATAGAGGATGATCCAGAAGC  2366
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2367  TGTCTATACAACTACTGGTGGAAAAATTCCAGTAAGGTGGACAGCACCCGAAGCCATCCAGTACCGGAAATTCA  2440
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2441  CATCAGCCAGTGATGTATGGAGCTATGGAATAGTCATGTGGGAAGTTATGTCTTATGGAGAAAGACCTTATTGG  2514
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2515  GACATGTCAAATCAAGATGTTATAAAAGCAATAGAAGAAGGTTATCGTTTACCAGCACCCATGGACTGCCCAGC  2588
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2589  TGGCCTTCACCAGCTAATGTTGGATTGTTGGCAAAAGGAGCGTGCTGAAAGGCCAAAATTTGAACAGATAGTTG  2662
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2663  GAATTCTAGACAAAATGATTCGAAACCCAAATAGTCTGAAAACTCCCCTGGGAACTTGTAGTAGGCCAATAAGC  2736
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2737  CCTCTTCTGGATCAAAACACTCCTGATTTCACTACCTTTTGTTCAGTTGGAGAATGGCTACAAGCTATTAAGAT  2810
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2811  GGAAAGATATAAAGATAATTTCACGGCAGCTGGCTACAATTCCCTTGAATCAGTAGCCAGGATGACTATTGAGG  2884
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2885  ATGTGATGAGTTTAGGGATCACACTGGTTGGTCATCAAAAGAAAATCATGAGCAGCATTCAGACTATGAGAGCA  2958
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2959  CAAATGCTACATTTACATGGAACTGGCATTCAAGTG  2994
                                                
Sbjct 1831  ------------------------------------  1830