Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06183
- Subject:
- NM_001283062.1
- Aligned Length:
- 1865
- Identities:
- 966
- Gaps:
- 814
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA 296
||||||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct 223 ACTGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATATGGCACTGGGACTTATGA 296
Query 297 TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT 370
.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 297 CAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCATATGGCACCCAGCCTGCCT 370
Query 371 ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT 444
|.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||||
Sbjct 371 ACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGTAACAAGCCTGCTGAGACT 444
Query 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC 518
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGCTATCC 518
Query 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA 592
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTCCTACCAGCTACTCCTCTT 592
Query 593 CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG 666
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 593 CACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAGCCGAGCAGCTATGGACAA 666
Query 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCCCCCTCAGACTGGATCCTA 740
Query 741 CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC 814
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC 814
Query 815 CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 815 CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCTTGAGTGGC 888
Query 889 CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGAC- 961
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| ...||.||.|||
Sbjct 889 CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGAT----CCCGATGAAGACT 958
Query 962 ------GCGGTGTAAT---------GGGGTT-----ACAAAGTGA---------------GAGCCTTGTATA-- 998
.|.|||.||| .||.|| ||||.|||| .||.|||.|.||
Sbjct 959 CTGACAACAGTGCAATTTATGTGCAAGGATTAAATGACAATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAG 1032
Query 999 CACT---------TCAATACTTAAAAAG----------TACCCGTACTCAGTACTC-AGCCGGCAGCATAATGA 1052
||.| ||||.| |.||.||| .||||.|..||..|| || |.|.|| ||||.||
Sbjct 1033 CAGTGTGGGGTTGTCAAGA-TGAACAAGAGAACTGGACAACCCATGATCCATA-TCTACCTGG----ATAAGGA 1100
Query 1053 -------------AAAGTGGGAC--------------------------------------------------- 1062
|||| |||||
Sbjct 1101 GACAGGAAAGCCTAAAG-GGGACGCCACAGTGTCCTATGAAGATCCACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGG 1173
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1174 TTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGCAAACTTAAAGTGTCTCTTGCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCAT 1247
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1248 GCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGGCAGGGGGATGCCACCACCACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAG 1321
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1322 GCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGACAGAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGA 1395
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1396 GGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGAGGAAATGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGG 1469
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1470 CTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAGAACAGAATGCAACCAGTGTAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCC 1543
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1544 CGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTGATCGTGGACGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGA 1617
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1618 CTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGAATGTTCAGAGGTGGCAGAGGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGG 1691
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1692 CCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGTCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGG 1765
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1766 AACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGACGTGGAGGACCTGGGAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAACGC 1839
Query 1063 --------------- 1062
Sbjct 1840 AGAGACCGGCCCTAC 1854
