Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06233
• Subject: NM_018594.2
• Aligned Length: 2517
• Identities: 2348
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ------------------------------ATGGCGAAATATAACACGGGGGGCAACCCGACAGAGGATGTCTC  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGGAAAGGCAGATGTAAAGTCCCTCATGGCGAAATATAACACGGGGGGCAACCCGACAGAGGATGTCTC  74

Query   45  AGTCAATAGCCGACCCTTCAGAGTCACAGGGCCAAACTCATCTTCAGGAATACAAGCAAGAAAGAACTTATTCA  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCAATAGCCGACCCTTCAGAGTCACAGGGCCAAACTCATCTTCAGGAATACAAGCAAGAAAGAACTTATTCA  148

Query  119  ACAACCAAGGAAATGCCAGCCCTCCTGCAGGACCCAGCAATGTACCTAAGTTTGGGTCCCCAAAGCCACCTGTG  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAACCAAGGAAATGCCAGCCCTCCTGCAGGACCCAGCAATGTACCTAAGTTTGGGTCCCCAAAGCCACCTGTG  222

Query  193  GCAGTCAAACCTTCTTCTGAGGAAAAGCCTGACAAGGAACCCAAGCCCCCGTTTCTAAAGCCCACTGGAGCAGG  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGTCAAACCTTCTTCTGAGGAAAAGCCTGACAAGGAACCCAAGCCCCCGTTTCTAAAGCCCACTGGAGCAGG  296

Query  267  CCAAAGATTCGGAACACCAGCCAGCTTGACCACCAGAGACCCCGAGGCGAAAGTGGGATTTCTGAAACCTGTAG  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAAAGATTCGGAACACCAGCCAGCTTGACCACCAGAGACCCCGAGGCGAAAGTGGGATTTCTGAAACCTGTAG  370

Query  341  GCCCCAAGCCCATCAACTTGCCCAAAGAAGATTCCAAACCTACATTTCCCTGGCCTCCTGGAAACAAGCCATCT  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCCCAAGCCCATCAACTTGCCCAAAGAAGATTCCAAACCTACATTTCCCTGGCCTCCTGGAAACAAGCCATCT  444

Query  415  CTTCACAGTGTAAACCAAGACCATGACTTAAAGCCACTAGGCCCGAAATCTGGGCCTACTCCTCCAACCTCAGA  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTCACAGTGTAAACCAAGACCATGACTTAAAGCCACTAGGCCCGAAATCTGGGCCTACTCCTCCAACCTCAGA  518

Query  489  AAATGAACAGAAGCAAGCGTTTCCCAAATTGACTGGGGTTAAAGGGAAATTTATGTCAGCATCACAAGATCTTG  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGAACAGAAGCAAGCGTTTCCCAAATTGACTGGGGTTAAAGGGAAATTTATGTCAGCATCACAAGATCTTG  592

Query  563  AACCCAAGCCCCTCTTCCCCAAACCCGCCTTTGGCCAGAAGCCGCCCCTAAGTACCGAGAACTCCCATGAAGAC  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCCAAGCCCCTCTTCCCCAAACCCGCCTTTGGCCAGAAGCCGCCCCTAAGTACCGAGAACTCCCATGAAGAC  666

Query  637  GAAAGCCCCATGAAGAATGTGTCTTCATCAAAAGGGTCCCCAGCTCCCCTGGGAGTCAGGTCCAAAAGCGGCCC  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAAGCCCCATGAAGAATGTGTCTTCATCAAAAGGGTCCCCAGCTCCCCTGGGAGTCAGGTCCAAAAGCGGCCC  740

Query  711  TTTAAAACCAGCAAGGGAAGACTCAGAAAATAAAGACCATGCAGGGGAGATTTCAAGTTTGCCCTTTCCTGGAG  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTAAAACCAGCAAGGGAAGACTCAGAAAATAAAGACCATGCAGGGGAGATTTCAAGTTTGCCCTTTCCTGGAG  814

Query  785  TGGTTTTGAAACCTGCTGCGAGCAGGGGAGGCCCAGGTCTCTCCAAAAATGGTGAAGAAAAAAAGGAAGATAGG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTTTTGAAACCTGCTGCGAGCAGGGGAGGCCCAGGTCTCTCCAAAAATGGTGAAGAAAAAAAGGAAGATAGG  888

Query  859  AAGATAGATGCTGCTAAGAACACCTTCCAGAGCAAAATAAATCAGGAAGAGTTGGCCTCAGGGACTCCTCCTGC  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGATAGATGCTGCTAAGAACACCTTCCAGAGCAAAATAAATCAGGAAGAGTTGGCCTCAGGGACTCCTCCTGC  962

Query  933  CAGGTTCCCTAAGGCCCCTTCTAAGCTGACAGTGGGGGGGCCATGGGGCCAAAGTCAGGAAAAGGAAAAGGGAG  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGGTTCCCTAAGGCCCCTTCTAAGCTGACAGTGGGGGGGCCATGGGGCCAAAGTCAGGAAAAGGAAAAGGGAG  1036

Query 1007  ACAAGAATTCAGCCACCCCGAAACAGAAGCCATTGCCTCCCTTGTTTACCTTGGGTCCACCTCCACCAAAACCC  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAAGAATTCAGCCACCCCGAAACAGAAGCCATTGCCTCCCTTGTTTACCTTGGGTCCACCTCCACCAAAACCC  1110

Query 1081  AACAGACCACCAAATGTTGACCTGACGAAATTCCACAAAACCTCTTCTGGAAACAGTACTAGCAAAGGCCAGAC  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACAGACCACCAAATGTTGACCTGACGAAATTCCACAAAACCTCTTCTGGAAACAGTACTAGCAAAGGCCAGAC  1184

Query 1155  GTCTTACTCAACAACTTCCCTGCCACCACCTCCACCATCCCATCCGGCCAGCCAACCACCATTGCCAGCATCTC  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCTTACTCAACAACTTCCCTGCCACCACCTCCACCATCCCATCCGGCCAGCCAACCACCATTGCCAGCATCTC  1258

Query 1229  ACCCATCACAACCACCAGTCCCAAGCCTACCTCCCAGAAACATTAAACCTCCGTTTGACCTAAAAAGCCCTGTC  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCCATCACAACCACCAGTCCCAAGCCTACCTCCCAGAAACATTAAACCTCCGTTTGACCTAAAAAGCCCTGTC  1332

Query 1303  AATGAAGACAATCAAGATGGTGTCACGCACTCTGATGGTGCTGGAAATCTAGATGAGGAACAAGACAGTGAAGG  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATGAAGACAATCAAGATGGTGTCACGCACTCTGATGGTGCTGGAAATCTAGATGAGGAACAAGACAGTGAAGG  1406

Query 1377  AGAAACATATGAAGACATAGAAGCATCCAAAGAAAGAGAGAAGAAAAGGGAAAAGGAAGAAAAGAAGAGGTTAG  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAAACATATGAAGACATAGAAGCATCCAAAGAAAGAGAGAAGAAAAGGGAAAAGGAAGAAAAGAAGAGGTTAG  1480

Query 1451  AGCTGGAGAAAAAGGAACAGAAAGAGAAAGAAAAGAAAGAACAAGAAATAAAGAAGAAATTTAAACTAACAGGC  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCTGGAGAAAAAGGAACAGAAAGAGAAAGAAAAGAAAGAACAAGAAATAAAGAAGAAATTTAAACTAACAGGC  1554

Query 1525  CCTATTCAAGTCATCCATCTTGCAAAAGCTTGTTGTGATGTCAAAGGAGGAAAGAATGAACTGAGCTTCAAGCA  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTATTCAAGTCATCCATCTTGCAAAAGCTTGTTGTGATGTCAAAGGAGGAAAGAATGAACTGAGCTTCAAGCA  1628

Query 1599  AGGAGAGCAAATTGAAATCATCCGCATCACAGACAACCCAGAAGGAAAATGGTTGGGCAGAACAGCAAGGGGTT  1672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGAGAGCAAATTGAAATCATCCGCATCACAGACAACCCAGAAGGAAAATGGTTGGGCAGAACAGCAAGGGGTT  1702

Query 1673  CATATGGCTATATTAAAACAACTGCTGTAGAGATTGACTATGATTCTTTGAAACTGAAAAAAGACTCTCTTGGT  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATATGGCTATATTAAAACAACTGCTGTAGAGATTGACTATGATTCTTTGAAACTGAAAAAAGACTCTCTTGGT  1776

Query 1747  GCCCCTTCAAGACCTATTGAAGATGACCAAGAAGTATATGATGATGTTGCAGAGCAGGATGATATTAGCAGCCA  1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCCCTTCAAGACCTATTGAAGATGACCAAGAAGTATATGATGATGTTGCAGAGCAGGATGATATTAGCAGCCA  1850

Query 1821  CAGTCAGAGTGGAAGTGGAGGGATATTCCCTCCACCACCAGATGATGACATTTATGATGGGATTGAAGAGGAAG  1894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGTCAGAGTGGAAGTGGAGGGATATTCCCTCCACCACCAGATGATGACATTTATGATGGGATTGAAGAGGAAG  1924

Query 1895  ATGCTGATGATGGCTCCACACTACAGGTTCAAGAGAAGAGTAATACGTGGTCCTGGGGGATTTTGAAGATGTTA  1968
            |||||||||||||                                                             
Sbjct 1925  ATGCTGATGATGG-------------------------------------------------------------  1937

Query 1969  AAGGGAAAAGATGACAGAAAGAAAAGTATACGAGAGAAACCTAAAGTCTCTGACTCAGACAATAATGAAGGTTC  2042
                                                                                      
Sbjct 1938  --------------------------------------------------------------------------  1937

Query 2043  ATCTTTCCCTGCTCCTCCTAAACAATTGGACATGGGAGATGAAGTTTACGATGATGTGGATACCTCTGATTTCC  2116
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1938  ---TTTCCCTGCTCCTCCTAAACAATTGGACATGGGAGATGAAGTTTACGATGATGTGGATACCTCTGATTTCC  2008

Query 2117  CTGTTTCATCAGCAGAGATGAGTCAAGGAACTAATTTTGGAAAAGCTAAGACAGAAGAAAAGGACCTTAAGAAG  2190
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009  CTGTTTCATCAGCAGAGATGAGTCAAGGAACTAATGTTGGAAAAGCTAAGACAGAAGAAAAGGACCTTAAGAAG  2082

Query 2191  CTAAAAAAGCAGGAAAAAGAAGAAAAAGACTTCAGGAAAAAATTTAAATATGATGGTGAAATTAGAGTCCTATA  2264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083  CTAAAAAAGCAGGAAAAAGAAGAAAAAGACTTCAGGAAAAAATTTAAATATGATGGTGAAATTAGAGTCCTATA  2156

Query 2265  TTCAACTAAAGTTACAACTTCCATAACTTCTAAAAAGTGGGGAACCAGAGATCTACAGGTAAAACCTGGTGAAT  2338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157  TTCAACTAAAGTTACAACTTCCATAACTTCTAAAAAGTGGGGAACCAGAGATCTACAGGTAAAACCTGGTGAAT  2230

Query 2339  CTCTAGAAGTTATACAAACCACAGATGACACAAAAGTTCTCTGCAGAAATGAAGAAGGGAAATATGGTTATGTC  2412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2231  CTCTAGAAGTTATACAAACCACAGATGACACAAAAGTTCTCTGCAGAAATGAAGAAGGGAAATATGGTTATGTC  2304

Query 2413  CTTCGGAGTTACCTAGCGGACAATGATGGAGAGATCTATGATGATATTGCTGATGGCTGCATCTATGACAATGA  2486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2305  CTTCGGAGTTACCTAGCGGACAATGATGGAGAGATCTATGATGATATTGCTGATGGCTGCATCTATGACAATGA  2378

Query 2487  C  2487
            |
Sbjct 2379  C  2379