Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06239
• Subject: XM_006527823.3
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1341
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGATAATCACACAAACAAGTCACTGTTACATGACCAGCCTTGGGATTCTTTTCCTGATTAATATTCTCCCTGG  74
            ||||||||||||||||...|.||||.|||..|||||||..|||...|||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAATCACACAAATGTGGCACTTTTATGTGACCAGAGTTGTACTTCTTCTCCTGATTAGTATTCTCCCTGG  74

Query   75  AACCACTGGTCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCCGGGGACTTTGTGAAGCAGGACATTGGCGGGCTGTCTC  148
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||
Sbjct   75  AACCACTAGCCAAGGGGAATCAAGACGACAAGAACCTGGGGACTTTGTGAAACAAGATATTGGAGGACTCTCTC  148

Query  149  CTAAGCATGCCCCAGATATTCCTGATGACAGCACTGACAACATCACTATCTTCACCAGAATCTTGGATCGTCTT  222
            |.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CCAAGCATGCCCCAGATATTCCTGACGATAGTACAGATAATATCACTATCTTCACTAGAATCTTGGATCGGCTT  222

Query  223  CTGGACGGCTATGACAACCGGCTGCGACCTGGGCTTGGAGATGCAGTGACTGAAGTGAAGACTGACATCTACGT  296
            .||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  TTGGATGGCTATGATAACCGGCTTCGACCTGGACTTGGAGATGCAGTGACTGAAGTGAAGACAGACATCTATGT  296

Query  297  GACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGACATGGAGTACACTATTGATGTATTTTTTCGGCAGACATGGCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  297  GACCAGTTTTGGCCCTGTGTCAGACACTGATATGGAATATACTATTGATGTATTTTTTAGACAGACATGGCATG  370

Query  371  ATGAAAGACTGAAATTTGATGGCCCCATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTCCTGGCTAGTAAGATCTGGACA  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  371  ATGAAAGACTGAAATTTGATGGACCAATGAAGATCCTTCCACTGAACAATCTTCTGGCTAGTAAGATATGGACT  444

Query  445  CCGGACACCTTCTTCCACAATGGCAAGAAATCAGTGGCTCATAACATGACCACGCCCAACAAGCTGCTCAGATT  518
            ||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct  445  CCTGATACCTTCTTCCACAATGGTAAAAAATCAGTGGCTCACAATATGACCACACCCAACAAGCTGCTCAGACT  518

Query  519  GGTGGACAACGGAACCCTCCCCTATACAATGAGGTTAACAATTCATGCTGAGTGTCCCATGCATTTGGAAGATT  592
            |||.||.||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTAGATAATGGGACCCTCCTCTATACAATGAGGTTAACAATACACGCTGAATGCCCCATGCATTTGGAAGATT  592

Query  593  TTCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACAACAGCTGAAGTGGTTTATTCT  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||..||||||||
Sbjct  593  TCCCCATGGATGTGCATGCCTGCCCACTGAAGTTTGGAAGCTATGCCTATACCAAAGCTGAAGTAATTTATTCT  666

Query  667  TGGACTCTCGGAAAGAACAAATCCGTGGAAGTGGCACAGGATGGTTCTCGCTTGAACCAGTATGACCTTTTGGG  740
            ||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||.||||.|||||||||.|..|.||
Sbjct  667  TGGACTCTTGGGAAGAACAAATCTGTGGAAGTAGCACAGGATGGCTCACGCCTGAATCAGTATGACTTGCTTGG  740

Query  741  CCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATGACAACCCACTTCCATCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  CCATGTTGTTGGGACAGAGATAATCCGGTCTAGTACAGGAGAATATGTCGTCATGACAACCCACTTTCATCTGA  814

Query  815  AGCGAAAAATTGGCTACTTTGTGATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGTCATTCTGTCACAAGTGTCG  888
            ||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  AGAGAAAAATTGGCTACTTTGTCATCCAGACCTACTTGCCATGTATCATGACTGTCATTCTGTCACAAGTGTCT  888

Query  889  TTCTGGCTCAACAGAGAGTCTGTTCCTGCCCGTACAGTCTTTGGTGTCACCACTGTGCTTACCATGACCACCTT  962
            ||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  889  TTCTGGCTTAATAGAGAATCTGTCCCTGCCCGCACAGTCTTTGGTGTCACCACTGTTCTCACCATGACCACCTT  962

Query  963  GAGTATCAGTGCCAGAAATTCCTTACCTAAAGTGGCATATGCGACGGCCATGGACTGGTTCATAGCCGTCTGTT  1036
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGTATCAGTGCCAGAAACTCTTTACCTAAAGTGGCATACGCGACGGCCATGGACTGGTTCATAGCCGTCTGTT  1036

Query 1037  ATGCCTTTGTATTTTCTGCACTGATTGAATTTGCCACTGTCAACTATTTCACCAAGCGGAGTTGGGCTTGGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGCCTTTGTATTTTCTGCACTGATTGAATTTGCTACTGTCAACTACTTCACCAAGCGGAGTTGGGCTTGGGAA  1110

Query 1111  GGCAAGAAGGTGCCAGAGGCCCTGGAGATGAAGAAGAAAACACCAGCAGCCCCAGCAAAGAAAACCAGCACTAC  1184
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||   |.|||.||
Sbjct 1111  GGCAAGAAGGTACCAGAGGCCCTGGAGATGAAGAAGAAAACACCAGCAGCTCCAACAAAGAAA---AACACCAC  1181

Query 1185  CTTCAACATCGTGGGGACCACCTATCCCATCAACCTGGCCAAGGACACTGAATTTTCCACCATCTCCAAG---G  1255
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||   |
Sbjct 1182  CTTCAACATAGTGGGTACCACCTATCCTATCAATCTGGCCAAGGATACTGAGTTCTCCACCATCTCCAAGTCTG  1255

Query 1256  GCGCTGCTCCCAGTGCCTCCTCAACCCCAACAATCATTGCTTCACCCAAGGCCACCTACGTGCAGGACAGCCCG  1329
            ..||||||||||||||.||.|||||.||||||...|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1256  CTGCTGCTCCCAGTGCTTCTTCAACTCCAACAGCGATTGCTTCACCCAAGGCTACTTATGTGCAAGACAGTCCT  1329

Query 1330  ACTGAGACCAAGACCTACAACAGTGTCAGCAAGGTTGACAAAATTTCCCGCATCATCTTTCCTGTGCTCTTTGC  1403
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1330  GCTGAGACCAAGACCTACAACAGTGTCAGCAAGGTTGACAAAATTTCCCGCATCATCTTCCCTGTGCTCTTTGC  1403

Query 1404  CATATTCAATCTGGTCTATTGGGCCACATATGTCAACCGGGAGTCAGCTATCAAGGGCATGATCCGCAAACAG  1476
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CATATTCAATCTTGTCTATTGGGCTACATATGTGAACCGGGAATCAGCTATCAAGGGCATGATCCGCAAACAG  1476