Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06246
- Subject:
- NM_008073.3
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1272
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT 74
||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGAGTTCGCCAAATACATGGAGCATTGGAAGCTCAGTCTACT---CTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGCT 71
Query 75 GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG 148
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 72 GTGGATTCTGCTCCTGCTATCGCTCTACCCAGGCTTCACAAGCCAAAAGTCAGATGATGACTATGAAGATTACG 145
Query 149 CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG 222
|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 CTTCTAATAAAACATGGGTGTTGACTCCAAAAGTTCCAGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG 219
Query 223 GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA 296
|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 220 GAAGGGTATGACAACAAACTTCGACCTGACATCGGAGTGAAACCAACATTAATTCATACAGATATGTATGTGAA 293
Query 297 TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA 370
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 294 CAGCATTGGTCCAGTGAATGCTATCAATATGGAATATACAATTGATATTTTTTTTGCCCAAACCTGGTATGACA 367
Query 371 GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA 444
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 GACGTTTGAAATTTAACAGTACCATTAAAGTTCTCCGGTTGAATAGCAATATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA 441
Query 445 GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG 518
||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 GACACTTTCTTCAGGAACTCCAAAAAGGCTGATGCTCACTGGATCACCACTCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG 515
Query 519 GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAATTTTC 592
|||||||||||||||.|||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 516 GAATGATGGTCGAGTTCTCTACACCTTAAGGCTAACAATTGATGCTGAGTGCCAGTTGCAATTACACAACTTCC 589
Query 593 CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG 666
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 CAATGGATGAACACTCCTGCCCCCTGGAGTTCTCCAGTTATGGATATCCTCGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG 663
Query 667 AAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACACAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAA 740
|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||.||
Sbjct 664 AAGCGCAGTTCTGTTGAAGTGGGTGACACAAGATCATGGAGGCTGTATCAATTTTCCTTTGTTGGATTGAGGAA 737
Query 741 TACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCCGGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAA 814
|||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 738 TACAACTGAAGTAGTGAAGACAACTTCTGGTGACTATGTGGTGATGTCTGTGTACTTCGATCTGAGCAGAAGAA 811
Query 815 TGGGATACTTTACCATCCAGACCTATATCCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATC 888
||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 812 TGGGCTACTTCACCATCCAGACTTACATTCCCTGCACACTCATCGTGGTCCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATC 885
Query 889 AATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACATCTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCAT 962
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||..|.||||||||
Sbjct 886 AATAAGGATGCTGTTCCTGCCAGAACATCTTTAGGAATCACTACTGTCCTGACCATGACAACTTTAAGCACCAT 959
Query 963 TGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTG 1036
.|||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 960 AGCCAGAAAATCTCTGCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCAATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGCTTCATCTTTG 1033
Query 1037 TCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCACCTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGAT 1110
|.||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1034 TGTTTTCTGCTTTGGTGGAGTATGGCACCCTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAGCCAAGCAAGGATAAAGAC 1107
Query 1111 AAAAAGAAGAAAAACCCT------------------------GCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGC 1160
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1108 AAAAAGAAGAAAAACCCTCTTCTTCGGATGTTTTCCTTCAAGGCCCCTACCATTGATATTCGTCCCAGATCAGC 1181
Query 1161 AACCATTCAAATGAATAATGCTACACACCTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCA 1234
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1182 AACCATTCAAATGAACAATGCCACACACCTTCAAGAGAGGGATGAAGAATATGGCTATGAGTGTTTGGATGGCA 1255
Query 1235 AGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTTTGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATC 1308
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1256 AGGACTGTGCCAGTTTCTTCTGCTGTTTTGAAGATTGCCGAACAGGAGCCTGGAGACATGGGAGGATACATATT 1329
Query 1309 CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTG 1382
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1330 CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCTACCGCCTTTTGCTTGTTCAATCTTGTTTACTG 1403
Query 1383 GGTCTCCTACCTCTACCTG 1401
|||||||||.||.||.|||
Sbjct 1404 GGTCTCCTATCTTTATCTG 1422