Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06246
• Subject: NM_177408.6
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1272
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT  74
            ||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGAGTTCGCCAAATACATGGAGCATTGGAAGCTCAGTCTACT---CTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGCT  71

Query   75  GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG  148
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct   72  GTGGATTCTGCTCCTGCTATCGCTCTACCCAGGCTTCACAAGCCAAAAGTCAGATGATGACTATGAAGATTACG  145

Query  149  CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  222
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  CTTCTAATAAAACATGGGTGTTGACTCCAAAAGTTCCAGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  219

Query  223  GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA  296
            |||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  220  GAAGGGTATGACAACAAACTTCGACCTGACATCGGAGTGAAACCAACATTAATTCATACAGATATGTATGTGAA  293

Query  297  TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA  370
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  294  CAGCATTGGTCCAGTGAATGCTATCAATATGGAATATACAATTGATATTTTTTTTGCCCAAACCTGGTATGACA  367

Query  371  GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  GACGTTTGAAATTTAACAGTACCATTAAAGTTCTCCGGTTGAATAGCAATATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  441

Query  445  GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  518
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GACACTTTCTTCAGGAACTCCAAAAAGGCTGATGCTCACTGGATCACCACTCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  515

Query  519  GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAATTTTC  592
            |||||||||||||||.|||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  516  GAATGATGGTCGAGTTCTCTACACCTTAAGGCTAACAATTGATGCTGAGTGCCAGTTGCAATTACACAACTTCC  589

Query  593  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  666
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCCTGGAGTTCTCCAGTTATGGATATCCTCGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  663

Query  667  AAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACACAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAA  740
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||.||
Sbjct  664  AAGCGCAGTTCTGTTGAAGTGGGTGACACAAGATCATGGAGGCTGTATCAATTTTCCTTTGTTGGATTGAGGAA  737

Query  741  TACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCCGGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAA  814
            |||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  738  TACAACTGAAGTAGTGAAGACAACTTCTGGTGACTATGTGGTGATGTCTGTGTACTTCGATCTGAGCAGAAGAA  811

Query  815  TGGGATACTTTACCATCCAGACCTATATCCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATC  888
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  812  TGGGCTACTTCACCATCCAGACTTACATTCCCTGCACACTCATCGTGGTCCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATC  885

Query  889  AATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACATCTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCAT  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||..|.||||||||
Sbjct  886  AATAAGGATGCTGTTCCTGCCAGAACATCTTTAGGAATCACTACTGTCCTGACCATGACAACTTTAAGCACCAT  959

Query  963  TGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTG  1036
            .|||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  960  AGCCAGAAAATCTCTGCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCAATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGCTTCATCTTTG  1033

Query 1037  TCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCACCTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGAT  1110
            |.||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1034  TGTTTTCTGCTTTGGTGGAGTATGGCACCCTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAGCCAAGCAAGGATAAAGAC  1107

Query 1111  AAAAAGAAGAAAAACCCTGCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGCAACCATTCAAATGAATAATGCTAC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1108  AAAAAGAAGAAAAACCCTGCCCCTACCATTGATATTCGTCCCAGATCAGCAACCATTCAAATGAACAATGCCAC  1181

Query 1185  ACACCTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCAAGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCT  1258
            |||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1182  ACACCTTCAAGAGAGGGATGAAGAATATGGCTATGAGTGTTTGGATGGCAAGGACTGTGCCAGTTTCTTCTGCT  1255

Query 1259  GTTTTGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATCCGCATTGCCAAAATGGACTCCTAT  1332
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  GTTTTGAAGATTGCCGAACAGGAGCCTGGAGACATGGGAGGATACATATTCGCATTGCCAAAATGGACTCCTAT  1329

Query 1333  GCTCGGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTGGGTCTCCTACCTCTACCTG  1401
            |||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1330  GCTCGGATCTTCTTCCCTACCGCCTTTTGCTTGTTCAATCTTGTTTACTGGGTCTCCTATCTTTATCTG  1398