Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06246
- Subject:
- XM_006532199.1
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1219
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT 74
.||.|| |||||||||.|
Sbjct 1 -------------------------------------------------ATGAAT--------AAAATGACGCT 17
Query 75 GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG 148
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 18 GTGGATTCTGCTCCTGCTATCGCTCTACCCAGGCTTCACAAGCCAAAAGTCAGATGATGACTATGAAGATTACG 91
Query 149 CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG 222
|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 CTTCTAATAAAACATGGGTGTTGACTCCAAAAGTTCCAGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG 165
Query 223 GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA 296
|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 166 GAAGGGTATGACAACAAACTTCGACCTGACATCGGAGTGAAACCAACATTAATTCATACAGATATGTATGTGAA 239
Query 297 TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA 370
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 240 CAGCATTGGTCCAGTGAATGCTATCAATATGGAATATACAATTGATATTTTTTTTGCCCAAACCTGGTATGACA 313
Query 371 GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA 444
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 GACGTTTGAAATTTAACAGTACCATTAAAGTTCTCCGGTTGAATAGCAATATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA 387
Query 445 GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG 518
||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 GACACTTTCTTCAGGAACTCCAAAAAGGCTGATGCTCACTGGATCACCACTCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG 461
Query 519 GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAATTTTC 592
|||||||||||||||.|||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 462 GAATGATGGTCGAGTTCTCTACACCTTAAGGCTAACAATTGATGCTGAGTGCCAGTTGCAATTACACAACTTCC 535
Query 593 CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG 666
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 CAATGGATGAACACTCCTGCCCCCTGGAGTTCTCCAGTTATGGATATCCTCGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG 609
Query 667 AAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACACAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAA 740
|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||.||
Sbjct 610 AAGCGCAGTTCTGTTGAAGTGGGTGACACAAGATCATGGAGGCTGTATCAATTTTCCTTTGTTGGATTGAGGAA 683
Query 741 TACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCCGGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAA 814
|||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 684 TACAACTGAAGTAGTGAAGACAACTTCTGGTGACTATGTGGTGATGTCTGTGTACTTCGATCTGAGCAGAAGAA 757
Query 815 TGGGATACTTTACCATCCAGACCTATATCCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATC 888
||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 758 TGGGCTACTTCACCATCCAGACTTACATTCCCTGCACACTCATCGTGGTCCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATC 831
Query 889 AATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACATCTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCAT 962
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||..|.||||||||
Sbjct 832 AATAAGGATGCTGTTCCTGCCAGAACATCTTTAGGAATCACTACTGTCCTGACCATGACAACTTTAAGCACCAT 905
Query 963 TGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTG 1036
.|||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 906 AGCCAGAAAATCTCTGCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCAATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGCTTCATCTTTG 979
Query 1037 TCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCACCTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGAT 1110
|.||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 980 TGTTTTCTGCTTTGGTGGAGTATGGCACCCTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAGCCAAGCAAGGATAAAGAC 1053
Query 1111 AAAAAGAAGAAAAACCCT------------------------GCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGC 1160
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1054 AAAAAGAAGAAAAACCCTCTTCTTCGGATGTTTTCCTTCAAGGCCCCTACCATTGATATTCGTCCCAGATCAGC 1127
Query 1161 AACCATTCAAATGAATAATGCTACACACCTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCA 1234
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1128 AACCATTCAAATGAACAATGCCACACACCTTCAAGAGAGGGATGAAGAATATGGCTATGAGTGTTTGGATGGCA 1201
Query 1235 AGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTTTGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATC 1308
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1202 AGGACTGTGCCAGTTTCTTCTGCTGTTTTGAAGATTGCCGAACAGGAGCCTGGAGACATGGGAGGATACATATT 1275
Query 1309 CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTG 1382
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1276 CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCTACCGCCTTTTGCTTGTTCAATCTTGTTTACTG 1349
Query 1383 GGTCTCCTACCTCTACCTG 1401
|||||||||.||.||.|||
Sbjct 1350 GGTCTCCTATCTTTATCTG 1368