Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06246
• Subject: XM_006532200.2
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1218
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGAGTTCGCCAAATATATGGAGCACAGGAAGCTCAGTCTACTCGACTCCTGTATTTTCACAGAAAATGACGGT  74
                                                                 ||       ||||||||||.|
Sbjct    1  -----------------------------------------------------AT-------GAAAATGACGCT  14

Query   75  GTGGATTCTGCTCCTGCTGTCGCTCTACCCTGGCTTCACTAGCCAGAAATCTGATGATGACTATGAAGATTATG  148
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct   15  GTGGATTCTGCTCCTGCTATCGCTCTACCCAGGCTTCACAAGCCAAAAGTCAGATGATGACTATGAAGATTACG  88

Query  149  CTTCTAACAAAACATGGGTCTTGACTCCAAAAGTTCCTGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  222
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   89  CTTCTAATAAAACATGGGTGTTGACTCCAAAAGTTCCAGAGGGTGATGTCACTGTCATCTTAAACAACCTGCTG  162

Query  223  GAAGGATATGACAATAAACTTCGGCCTGATATAGGAGTGAAGCCAACGTTAATTCACACAGACATGTATGTGAA  296
            |||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  163  GAAGGGTATGACAACAAACTTCGACCTGACATCGGAGTGAAACCAACATTAATTCATACAGATATGTATGTGAA  236

Query  297  TAGCATTGGTCCAGTGAACGCTATCAATATGGAATACACTATTGATATATTTTTTGCGCAAACGTGGTATGACA  370
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  237  CAGCATTGGTCCAGTGAATGCTATCAATATGGAATATACAATTGATATTTTTTTTGCCCAAACCTGGTATGACA  310

Query  371  GACGTTTGAAATTTAACAGCACCATTAAAGTCCTCCGATTGAACAGCAACATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  GACGTTTGAAATTTAACAGTACCATTAAAGTTCTCCGGTTGAATAGCAATATGGTGGGGAAAATCTGGATTCCA  384

Query  445  GACACTTTCTTCAGAAATTCCAAAAAAGCTGATGCACACTGGATCACCACCCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  518
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  GACACTTTCTTCAGGAACTCCAAAAAGGCTGATGCTCACTGGATCACCACTCCCAACAGGATGCTGAGAATTTG  458

Query  519  GAATGATGGTCGAGTGCTCTACACCCTAAGGTTGACAATTGATGCTGAGTGCCAATTACAATTGCACAATTTTC  592
            |||||||||||||||.|||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  459  GAATGATGGTCGAGTTCTCTACACCTTAAGGCTAACAATTGATGCTGAGTGCCAGTTGCAATTACACAACTTCC  532

Query  593  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCTTGGAGTTCTCCAGTTATGGCTATCCACGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  666
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  533  CAATGGATGAACACTCCTGCCCCCTGGAGTTCTCCAGTTATGGATATCCTCGTGAAGAAATTGTTTATCAATGG  606

Query  667  AAGCGAAGTTCTGTTGAAGTGGGCGACACAAGATCCTGGAGGCTTTATCAATTCTCATTTGTTGGTCTAAGAAA  740
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||.||
Sbjct  607  AAGCGCAGTTCTGTTGAAGTGGGTGACACAAGATCATGGAGGCTGTATCAATTTTCCTTTGTTGGATTGAGGAA  680

Query  741  TACCACCGAAGTAGTGAAGACAACTTCCGGAGATTATGTGGTCATGTCTGTCTACTTTGATCTGAGCAGAAGAA  814
            |||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  681  TACAACTGAAGTAGTGAAGACAACTTCTGGTGACTATGTGGTGATGTCTGTGTACTTCGATCTGAGCAGAAGAA  754

Query  815  TGGGATACTTTACCATCCAGACCTATATCCCCTGCACACTCATTGTCGTCCTATCCTGGGTGTCTTTCTGGATC  888
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  755  TGGGCTACTTCACCATCCAGACTTACATTCCCTGCACACTCATCGTGGTCCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATC  828

Query  889  AATAAGGATGCTGTTCCAGCCAGAACATCTTTAGGTATCACCACTGTCCTGACAATGACCACCCTCAGCACCAT  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||..|.||||||||
Sbjct  829  AATAAGGATGCTGTTCCTGCCAGAACATCTTTAGGAATCACTACTGTCCTGACCATGACAACTTTAAGCACCAT  902

Query  963  TGCCCGGAAATCGCTCCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCGATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGTTTCATCTTTG  1036
            .|||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  903  AGCCAGAAAATCTCTGCCCAAGGTCTCCTATGTCACAGCAATGGATCTCTTTGTATCTGTTTGCTTCATCTTTG  976

Query 1037  TCTTCTCTGCTCTGGTGGAGTATGGCACCTTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAACCAAGCAAGGACAAAGAT  1110
            |.||.||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  977  TGTTTTCTGCTTTGGTGGAGTATGGCACCCTGCATTATTTTGTCAGCAACCGGAAGCCAAGCAAGGATAAAGAC  1050

Query 1111  AAAAAGAAGAAAAACCCT------------------------GCCCCTACCATTGATATCCGCCCAAGATCAGC  1160
            ||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1051  AAAAAGAAGAAAAACCCTCTTCTTCGGATGTTTTCCTTCAAGGCCCCTACCATTGATATTCGTCCCAGATCAGC  1124

Query 1161  AACCATTCAAATGAATAATGCTACACACCTTCAAGAGAGAGATGAAGAGTACGGCTATGAGTGTCTGGACGGCA  1234
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1125  AACCATTCAAATGAACAATGCCACACACCTTCAAGAGAGGGATGAAGAATATGGCTATGAGTGTTTGGATGGCA  1198

Query 1235  AGGACTGTGCCAGTTTTTTCTGCTGTTTTGAAGATTGTCGAACAGGAGCTTGGAGACATGGGAGGATACATATC  1308
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1199  AGGACTGTGCCAGTTTCTTCTGCTGTTTTGAAGATTGCCGAACAGGAGCCTGGAGACATGGGAGGATACATATT  1272

Query 1309  CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCCACTGCCTTCTGCCTGTTTAATCTGGTCTATTG  1382
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1273  CGCATTGCCAAAATGGACTCCTATGCTCGGATCTTCTTCCCTACCGCCTTTTGCTTGTTCAATCTTGTTTACTG  1346

Query 1383  GGTCTCCTACCTCTACCTG  1401
            |||||||||.||.||.|||
Sbjct 1347  GGTCTCCTATCTTTATCTG  1365