Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06254
• Subject: NR_073535.1
• Aligned Length: 1367
• Identities: 845
• Gaps: 391

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGGAGGAACTCTTCAGGAGAGGAGACTTAACCAAGGAGCTTACCCGTCTGCTTCCAGCTCTGACCCTGAGCGAG  74

Query    1  ----------------------------------------------ATGGGGAAGGTGAAGGTCGGAGTCAACG  28
                                                          ||      |.||||||||.|.||.|||.
Sbjct   75  ACAGCCCCATCTTCTTGTGCAGTGCCAGCCTTGTCCCGTAGACAAAAT------GATGAAGGTCAGTGTGAACT  142

Query   29  GATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGG-------GCTGCTTTTAACTCTGGTAAAGTGGATATTGTTGC  95
            |||||||.|||||||||.|||||||.||||||       .|||||.|..||| ||| ||||||||.||||||||
Sbjct  143  GATTTGGCCGTATTGGGTGCCTGGTTACCAGGACTGCCATCTGCTCTCCACT-TGG-AAAGTGGAGATTGTTGC  214

Query   96  CATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACTACATGGTTTACATGTTCCAATATGATTCCACCCATGGCAAATTCC  169
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  215  CATCAACGACCCCTCCATTGACCTCAACTACATGGTCTACATGTTCCAGTATGACTCCACCCATGGCAAATTCA  288

Query  170  ATGGCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAGCTTGTCATCAATGGAAATCCCATCACCATCTTCCAGGAGCGAGAT  243
            |||.|||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  289  ATGACACAGTCAAGACTGAGAATGGGAAGCTTGTCATCAACGAGAAGCCCATCACCATCTTCCAGGAGTGAGAC  362

Query  244  CCCTCCAAAATCAAGTGGGG------CGATGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCAC  311
            |||.|.||.|||||.|||||      .|.||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||.|||||||||.
Sbjct  363  CCCGCTAACATCAAATGGGGTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGAGTATGTTGTGGAATCTACTGGCATCTTCACCAT  436

Query  312  CATGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCCCCTCTGCTGACGCCC  385
            |.||||||||||..|||||||.|||.|.||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||..||.||||
Sbjct  437  CTTGGAGAAGGCCAGGGCTCACTTGAATGGTGGATCCAAAAGGGTCATCATCTCGGCCCCTTCTGTGGATGCCC  510

Query  386  CCATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTATGACAA--CAGCCTCAAGATCATCAGCAATGCCTCCTGCA  457
            |||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||  ||  ||||||||..||||.|||||.|||||||
Sbjct  511  CCATGTTTGTGATGGGTGTGAACCACGAGAAGTATGACAATTCA--CTCAAGATTGTCAGTAATGCATCCTGCA  582

Query  458  CCACCAACTGCTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGTATCGTGGAAGGACTCATGACCACA  531
            |||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||||..
Sbjct  583  CCACCAACTGCTTAGATTCCCTGGCCAAGGTCATCCATGACAACTTTAGCATTGTGGAAGGGCTCATGACCATG  656

Query  532  GTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTGATGGCCGCGGGGC  605
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|.||.||||||.||||||||.||     
Sbjct  657  GTCCATGCCATCACTGCCACTCAGAAGACTGTGGATGGTCCCTCTAGAAAGCTGTGGTGTGATGGCTGC-----  725

Query  606  TCTCCAGAACAT------CATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCTGAGCTGA  673
               |||||||||      ||.|.||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  726  ---CCAGAACATCTTGTCCAGCACTGCATCCACTAGTGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATTCCAGAGCTGA  796

Query  674  ACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAACGTGT-CAGTGGTGGACCTGACCTGCCGTCT  746
            ||.||||||||.|||||||.||||||.||||.||.||..|.||.||.| ||.| |||||.|||||.|||||.||
Sbjct  797  ACAGGAAGCTCTCTGGCATAGCCTTCTGTGTTCCTACCCCAAATGTATCCACT-GTGGATCTGACATGCCGCCT  869

Query  747  AGAAAAACCTGCCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCGTCGGAGGGCCCCCTCAAGGGCATCC  820
            .||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||.|||.||.||||||||||
Sbjct  870  GGAGAAACCTGCCAAGTATGATGACATCAAAAAGGTGGTGAAGCAGGCATCTGAGGACCCACTGAAGGGCATCC  943

Query  821  TGGGCTACACTGAGCACCAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTCCACCTTCGACGCTGGG  894
            |||.||||||||||.||||.||.|||||||.||||||||          |||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct  944  TGGTCTACACTGAGGACCAAGTTGTCTCCTGTGACTTCA----------CCATTCTTCCACCTTTGATGCTGGG  1007

Query  895  GCTGGCATTGCCCTCAACGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAACGAATTTGGCTACAGCAACAG  968
            .||||||||||.|||||.|.|.|..||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||
Sbjct 1008  ACTGGCATTGCTCTCAATGGCAATGTTGTCAAGCTCATTTCCTGGTATGACAATGAATATGACTACAGCAACAG  1081

Query  969  GGTGGTGGACCTCATGGCCCACATGGCCTCCAAGGAG-------------------------------------  1005
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||                                     
Sbjct 1082  GGTGGTGGACCTCATGGCCTACATGGCCTCCAAGGAGTAAGAAACCGTGGACCACCCACCCCAGCAAGGACACT  1155

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1156  GAGAGCAAGAGAGAGGCGCTCGTTTGCTGAGGGGTCCCTATCCCAACATGGCCCCCCTACACTGAGCATCTCCC  1229

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1230  TCACAATTTCCATCCCAGACCCCCCATAATAACAGAAGGGGCCTAGGGAGCCCTCCCTACTCTCTTGAATGCCA  1303

Query 1006  -----------------------------------  1005
                                               
Sbjct 1304  TCAATAAAGTTCACTGCACCCCAAAAAAAAAAAAA  1338