Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06257
• Subject: NM_001145662.1
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1395
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGGCGCCGGAGCAGCCGCGCTGGATGGCGCACCCGGCCGTGCTGAATGCGCAGCACCCCGACTCACA  74
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Sbjct    1  ATGGAGGTGGCGCCCGAGCAGCCGCGCTGGATGGCGCACCCGGCCGTGCTGAATGCGCAGCACCCCGACTCACA  74

Query   75  CCACCCGGGCCTGGCGCACAACTACATGGAACCCGCGCAGCTGCTGCCTCCAGACGAGGTGGACGTCTTCTTCA  148
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Sbjct   75  CCACCCGGGCCTGGCGCACAACTACATGGAACCCGCGCAGCTGCTGCCTCCAGACGAGGTGGACGTCTTCTTCA  148

Query  149  ATCACCTCGACTCGCAGGGCAACCCCTACTATGCCAACCCCGCTCACGCGCGGGCGCGCGTCTCCTACAGCCCC  222
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Sbjct  149  ATCACCTCGACTCGCAGGGCAACCCCTACTATGCCAACCCCGCTCACGCGCGGGCGCGCGTCTCCTACAGCCCC  222

Query  223  GCGCACGCCCGCCTGACCGGAGGCCAGATGTGCCGCCCACACTTGTTGCACAGCCCGGGTTTGCCCTGGCTGGA  296
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Sbjct  223  GCGCACGCCCGCCTGACCGGAGGCCAGATGTGCCGCCCACACTTGTTGCACAGCCCGGGTTTGCCCTGGCTGGA  296

Query  297  CGGGGGCAAAGCAGCCCTCTCTGCCGCTGCGGCCCACCACCACAACCCCTGGACCGTGAGCCCCTTCTCCAAGA  370
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Sbjct  297  CGGGGGCAAAGCAGCCCTCTCTGCCGCTGCGGCCCACCACCACAACCCCTGGACCGTGAGCCCCTTCTCCAAGA  370

Query  371  CGCCACTGCACCCCTCAGCTGCTGGAGGCCCTGGAGGCCCACTCTCTGTGTACCCAGGGGCTGGGGGTGGGAGC  444
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Sbjct  371  CGCCACTGCACCCCTCAGCTGCTGGAGGCCCTGGAGGCCCACTCTCTGTGTACCCAGGGGCTGGGGGTGGGAGC  444

Query  445  GGGGGAGGCAGCGGGAGCTCAGTGGCCTCCCTCACCCCTACAGCAACCCACTCTGGCTCCCACCTTTTCGGCTT  518
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Sbjct  445  GGGGGAGGCAGCGGGAGCTCAGTGGCCTCCCTCACCCCTACAGCAGCCCACTCTGGCTCCCACCTTTTCGGCTT  518

Query  519  CCCACCCACGCCACCCAAAGAAGTGTCTCCTGACCCTAGCACCACGGGGGCTGCGTCTCCAGCCTCATCTTCCG  592
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Sbjct  519  CCCACCCACGCCACCCAAAGAAGTGTCTCCTGACCCTAGCACCACGGGGGCTGCGTCTCCAGCCTCATCTTCCG  592

Query  593  CGGGGGGTAGTGCAGCCCGAGGAGAGGACAAGGACGGCGTCAAGTACCAGGTGTCACTGACGGAGAGCATGAAG  666
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Sbjct  593  CGGGGGGTAGTGCAGCCCGAGGAGAGGACAAGGACGGCGTCAAGTACCAGGTGTCACTGACGGAGAGCATGAAG  666

Query  667  ATGGAAAGTGGCAGTCCCCTGCGCCCAGGCCTAGCTACTATGGGCACCCAGCCTGCTACACACCACCCCATCCC  740
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Sbjct  667  ATGGAAAGTGGCAGTCCCCTGCGCCCAGGCCTAGCTACTATGGGCACCCAGCCTGCTACACACCACCCCATCCC  740

Query  741  CACCTACCCCTCCTATGTGCCGGCGGCTGCCCACGACTACAGCAGCGGACTCTTCCACCCCGGAGGCTTCCTGG  814
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Sbjct  741  CACCTACCCCTCCTATGTGCCGGCGGCTGCCCACGACTACAGCAGCGGACTCTTCCACCCCGGAGGCTTCCTGG  814

Query  815  GGGGACCGGCCTCCAGCTTCACCCCTAAGCAGCGCAGCAAGGCTCGTTCCTGTTCAGAAGGCCGGGAGTGTGTC  888
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Sbjct  815  GGGGACCGGCCTCCAGCTTCACCCCTAAGCAGCGCAGCAAGGCTCGTTCCTGTTCAGAAGGCCGGGAGTGTGTC  888

Query  889  AACTGTGGGGCCACAGCCACCCCTCTCTGGCGGCGGGACGGCACCGGCCACTACCTGTGCAATGCCTGTGGCCT  962
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Sbjct  889  AACTGTGGGGCCACAGCCACCCCTCTCTGGCGGCGGGACGGCACCGGCCACTACCTGTGCAATGCCTGTGGCCT  962

Query  963  CTACCACAAGATGAATGGGCAGAACCGACCACTCATCAAGCCCAAGCGAAGACTGTCGGCCGCCAGAAGAGCCG  1036
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Sbjct  963  CTACCACAAGATGAATGGGCAGAACCGACCACTCATCAAGCCCAAGCGAAGACT--------------------  1016

Query 1037  GCACCTGTTGTGCAAATTGTCAGACGACAACCACCACCTTATGGCGCCGAAACGCCAACGGGGACCCTGTCTGC  1110
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Sbjct 1017  ----------------------GACGACAACCACCACCTTATGGCGCCGAAACGCCAACGGGGACCCTGTCTGC  1068

Query 1111  AACGCCTGTGGCCTCTACTACAAGCTGCACAATGTTAACAGGCCACTGACCATGAAGAAGGAAGGGATCCAGAC  1184
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Sbjct 1069  AACGCCTGTGGCCTCTACTACAAGCTGCACAATGTTAACAGGCCACTGACCATGAAGAAGGAAGGGATCCAGAC  1142

Query 1185  TCGGAACCGGAAGATGTCCAACAAGTCCAAGAAGAGCAAGAAAGGGGCGGAGTGCTTCGAGGAGCTGTCAAAGT  1258
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Sbjct 1143  TCGGAACCGGAAGATGTCCAACAAGTCCAAGAAGAGCAAGAAAGGGGCGGAGTGCTTCGAGGAGCTGTCAAAGT  1216

Query 1259  GCATGCAGGAGAAGTCATCCCCCTTCAGTGCAGCTGCCCTGGCTGGACACATGGCACCTGTGGGCCACCTCCCG  1332
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Sbjct 1217  GCATGCAGGAGAAGTCATCCCCCTTCAGTGCAGCTGCCCTGGCTGGACACATGGCACCTGTGGGCCACCTCCCG  1290

Query 1333  CCCTTCAGCCACTCCGGACACATCCTGCCCACTCCGACGCCCATCCACCCCTCCTCCAGCCTCTCCTTCGGCCA  1406
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Sbjct 1291  CCCTTCAGCCACTCCGGACACATCCTGCCCACTCCGACGCCCATCCACCCCTCCTCCAGCCTCTCCTTCGGCCA  1364

Query 1407  CCCCCACCCGTCCAGCATGGTGACAGCCATGGGC  1440
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Sbjct 1365  CCCCCACCCGTCCAGCATGGTGACCGCCATGGGC  1398