Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06259
• Subject: NM_008090.5
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1258
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGGCGCCGGAGCAGCCGCGCTGGATGGCGCACCCGGCCGTGCTGAATGCGCAGCACCCCGACTCACA  74
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGCGCCTGAGCAGCCTCGCTGGATGGCGCACCCCGCCGTATTGAATGCGCAGCACCCCGACTCGCA  74

Query   75  CCACCCGGGCCTGGCGCACAACTACATGGAACCCGCGCAGCTGCTGCCTCCAGACGAGGTGGACGTCTTCTTCA  148
            |||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CCATCCGGGCCTGGCGCATAACTACATGGAGCCAGCACAGCTGCTGCCTCCCGACGAGGTGGATGTCTTCTTCA  148

Query  149  ATCACCTCGACTCGCAGGGCAACCCCTACTATGCCAACCCCGCTCACGCGCGGGCGCGCGTCTCCTACAGCCCC  222
            |.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  ACCATCTCGACTCGCAGGGCAACCCTTACTACGCCAACCCGGCCCACGCGCGCGCGCGCGTTTCCTACAGCCCG  222

Query  223  GCGCACGCCCGCCTGACCGGAGGCCAGATGTGCCGCCCACACTTGTTGCACAGCCCGGGTTTGCCCTGGCTGGA  296
            |||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GCGCATGCCCGTCTCACCGGAGGCCAGATGTGCCGACCACACTTGTTGCACAGCCCAGGCTTGCCGTGGCTGGA  296

Query  297  CGGGGGCAAAGCAGCCCTCTCTGCCGCTGCGGCCCACCACCACAACCCCTGGACCGTGAGCCCCTTCTCCAAGA  370
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||..|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  CGGGGGCAAAGCAGCTCTCTCTGCCGCCGCTGCCCATCACCACAGTCCCTGGACCGTCAGCCCGTTCTCCAAGA  370

Query  371  CGCCACTGCACCCCTCAGCTGCTGGAGGCCCTGGAGGCCCACTCTCTGTGTACCCAGGGGCTGGGGGTGGGAGC  444
            |.||.||||||||||||||||||||||..||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct  371  CCCCGCTGCACCCCTCAGCTGCTGGAGCACCCGGAGGGCCTCTGTCTGTTTACCCAGGGGCTGCGGGTGGGAGC  444

Query  445  GGGGGAGGCAGCGGGAGCTCAGTGGCCTCCCTCACCCCTACAGCAGCCCACTCTGGCTCCCACCTTTTCGGCTT  518
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  GGGGGAGGCAGTGGGAGCTCCGTGGCCTCCCTCACCCCCACTGCAGCCCACTCGGGCTCCCATCTCTTCGGCTT  518

Query  519  CCCACCCACGCCACCCAAAGAAGTGTCTCCTGACCCTAGCACCACGGGGGCTGCGTCTCCAGCCTCATCTTCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  519  CCCACCCACGCCACCCAAAGAAGTGTCTCCAGACCCCAGCACAACAGGAGCTGCTTCCCCGGCCTCTTCTTCTG  592

Query  593  CGGGGGGTAGTGCAGCCCGAGGAGAGGACAAGGACGGCGTCAAGTACCAGGTGTCACTGACGGAGAGCATGAAG  666
            |.||||||||||.||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||
Sbjct  593  CAGGGGGTAGTGTAGCCCGGGGTGAGGACAAGGATGGCGTCAAGTACCAAGTGTCACTCTCCGAGAGCATGAAG  666

Query  667  ATGGAAAGTGGCAGTCCCCTGCGCCCAGGCCTAGCTACTATGGGCACCCAGCCTGCTACACACCACCCCATCCC  740
            ||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  667  ATGGAAGGCGGCAGTCCCCTGCGCCCGGGCCTAGCTACCATGGGCACCCAGCCTGCAACACACCACCCGATACC  740

Query  741  CACCTACCCCTCCTATGTGCCGGCGGCTGCCCACGACTACAGCAGCGGACTCTTCCACCCCGGAGGCTTCCTGG  814
            ||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..|||||.|.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  CACCTATCCCTCCTATGTGCCCGCCGCAGCTCATGACTATGGCAGCAGTCTCTTCCATCCAGGAGGCTTCCTGG  814

Query  815  GGGGACCGGCCTCCAGCTTCACCCCTAAGCAGCGCAGCAAGGCTCGTTCCTGTTCAGAAGGCCGGGAGTGTGTC  888
            |.||.||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGCCCCGCCTCCAGCTTCACCCCTAAGCAGAGAAGCAAGGCTCGCTCCTGCTCAGAAGGCCGGGAGTGTGTC  888

Query  889  AACTGTGGGGCCACAGCCACCCCTCTCTGGCGGCGGGACGGCACCGGCCACTACCTGTGCAATGCCTGTGGCCT  962
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AACTGTGGTGCCACAGCCACCCCTCTCTGGCGACGAGATGGCACGGGCCACTACCTGTGCAATGCCTGTGGGCT  962

Query  963  CTACCACAAGATGAATGGGCAGAACCGACCACTCATCAAGCCCAAGCGAAGACT--------------------  1016
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||                    
Sbjct  963  CTACCACAAGATGAATGGACAGAACCGGCCGCTCATCAAGCCCAAGCGGAGGCTGTCTGCTGCCAGAAGAGCGG  1036

Query 1017  ----------------------GACGACAACCACCACCTTATGGCGCCGAAACGCCAACGGGGACCCTGTCTGC  1068
                                  |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  GCACCTGTTGTGCAAATTGTCAGACGACAACCACCACCTTATGGCGCCGGAACGCCAACGGGGACCCTGTGTGC  1110

Query 1069  AACGCCTGTGGCCTCTACTACAAGCTGCACAATGTTAACAGGCCACTGACCATGAAGAAGGAAGGGATCCAGAC  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACGCCTGTGGCCTCTACTACAAGCTGCACAATGTTAACAGGCCACTGACCATGAAGAAGGAAGGGATCCAGAC  1184

Query 1143  TCGGAACCGGAAGATGTCCAACAAGTCCAAGAAGAGCAAGAAAGGGGCGGAGTGCTTCGAGGAGCTGTCAAAGT  1216
            .|||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  CCGGAATCGGAAGATGTCCAGCAAATCCAAGAAGAGCAAGAAAGGGGCTGAATGTTTCGAGGAGCTCTCCAAGT  1258

Query 1217  GCATGCAGGAGAAGTCATCCCCCTTCAGTGCAGCTGCCCTGGCTGGACACATGGCACCTGTGGGCCACCTCCCG  1290
            |||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259  GCATGCAAGAGAAGTCACCGCCCTTCAGTGCGGCTGCCCTGGCTGGACACATGGCACCTGTGGGACACCTCCCA  1332

Query 1291  CCCTTCAGCCACTCCGGACACATCCTGCCCACTCCGACGCCCATCCACCCCTCCTCCAGCCTCTCCTTCGGCCA  1364
            ||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1333  CCTTTTAGTCACTCTGGACACATCCTACCCACGCCCACGCCTATCCACCCTTCCTCCAGTCTCTCTTTTGGCCA  1406

Query 1365  CCCCCACCCGTCCAGCATGGTGACCGCCATGGGC  1398
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1407  CCCCCACCCGTCCAGCATGGTGACTGCCATGGGC  1440