Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06282
- Subject:
- NM_138595.2
- Aligned Length:
- 3076
- Identities:
- 2659
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGCAGTCCTGTGCCAGGGCGTGGGGGCTGCGCCTGGGCCGCGGGGTCGGGGGCGGCCGCCGCCTGGCTGGGGG 74
||||||...|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 1 ATGCAGCTGTGTGCCAGGGCATGGGGGCTGCGCCTGGGCCGCGGAGCCGGGGGCGGCCACCGCCTGGCTCGGGG 74
Query 75 ATCGGGGCCGTGCTGGGCGCCGCGGAGCCGGGACAGCAGCAGTGGC---------------GGCGGGGACAGCG 133
..|.||...|.|.|||||||.|||.|||||||||||||||.|.||| |||||||||.|||
Sbjct 75 CACCGGCTTGAGTTGGGCGCAGCGAAGCCGGGACAGCAGCGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGGGACCGCG 148
Query 134 CCGCGGCTGGGGCCTCGCGCCTCCTGGAGCGCCTTCTGCCCAGACACGACGACTTCGCTCGGAGGCACATCGGC 207
.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct 149 GCGCGGCTGGGGCCTCGCGCCTTCTGGAGCGCCTCCTGCCCAGACACGATGACTTCTCCCGGAGACACATCGGC 222
Query 208 CCTGGGGACAAAGACCAGAGAGAGATGCTGCAGACCTTGGGACTGGCGAGCATTGATGAATTGATCGAGAAGAC 281
||.||.||||||||||.|||.||||||||||||.|..||||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||
Sbjct 223 CCCGGAGACAAAGACCGGAGGGAGATGCTGCAGGCGCTGGGGCTGGCGAGCATTGATGAGCTCATCGAGAAGAC 296
Query 282 GGTCCCTGCCAACATCCGTTTGAAAAGACCCTTGAAAATGGAAGACCCTGTTTGTGAAAATGAAATCCTTGCAA 355
||||||.||||.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|..|
Sbjct 297 GGTCCCCGCCAGCATCCGCTTGAAGAGACCCTTGAAAATGGAAGACCCTATTTGTGAGAATGAAATCCTCGAGA 370
Query 356 CTCTGCATGCCATTTCAAGCAAAAACCAGATCTGGAGATCGTATATTGGCATGGGCTATTATAACTGCTCAGTG 429
||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCTGCATGCCATTGCAAGCAAGAACCAGATCTGGAGGTCGTATATTGGCATGGGCTATTACAACTGCTCGGTG 444
Query 430 CCACAGACGATTTTGCGGAACTTACTGGAGAACTCAGGATGGATCACCCAGTATACTCCATACCAGCCTGAGGT 503
||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 445 CCCCAGACCATTTTGCGGAACTTACTGGAGAATTCTGGATGGGTCACCCAGTACACTCCGTATCAGCCAGAGGT 518
Query 504 GTCTCAGGGGAGGCTGGAGAGTTTACTCAACTACCAGACCATGGTGTGTGACATCACAGGCCTGGACATGGCCA 577
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 519 GTCCCAGGGGAGGCTGGAGAGTTTACTCAACTACCAGACCATGGTGTCTGACATCACAGGCTTGGACATGGCCA 592
Query 578 ATGCATCCCTGCTGGATGAGGGGACTGCAGCCGCAGAGGCACTGCAGCTGTGCTACAGACACAACAAGAGGAGG 651
|.||.||||||||||||||||..||.||.||.||||||||..||||.||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct 593 ACGCTTCCCTGCTGGATGAGGCAACCGCGGCTGCAGAGGCGATGCAACTGTGCCACAGACACAACAAGAGGAAG 666
Query 652 AAATTTCTCGTTGATCCCCGTTGCCACCCACAGACAATAGCTGTTGTCCAGACTCGAGCCAAATATACTGGAGT 725
||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||.||
Sbjct 667 AAATTTTTCGTTGATCCTCGTTGTCACCCACAGACGATAGCTGTTGTCCAGACTCGAGCCAAATATAGGGGGGT 740
Query 726 CCTCACTGAGCTGAAGTTACCCTGTGAAATGGACTTCAGTGGAAAAGATGTCAGTGGAGTGTTGTTCCAGTACC 799
.||....|||||||||||||||...||||||||.||||||||.|||||.|||.||||.|||.||||||||||||
Sbjct 741 GCTTGTCGAGCTGAAGTTACCCCACGAAATGGATTTCAGTGGCAAAGACGTCTGTGGGGTGCTGTTCCAGTACC 814
Query 800 CAGACACGGAGGGGAAGGTGGAAGACTTTACGGAACTCGTGGAGAGAGCTCATCAGAGTGGGAGCCTGGCCTGC 873
|||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 815 CAGACACTGAGGGGAAGGTGGAGGACTTCACAGAACTTGTAGACAGAGCCCATCAGACTGGGAGCCTGACCTGC 888
Query 874 TGTGCTACTGACCTTTTAGCTTTGTGCATCTTGAGGCCACCTGGAGAATTTGGGGTAGACATCGCCCTGGGCAG 947
|||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||.
Sbjct 889 TGTGCTACTGACCTTTTAGCTCTGTGTATTTTGAGGCCACCTGGAGAGTTTGGAGTGGACATTGCCCTGGGCAA 962
Query 948 CTCCCAGAGATTTGGAGTGCCACTGGGCTATGGGGGACCCCATGCAGCATTTTTTGCTGTCCGAGAAAGCTTGG 1021
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||..|||||.|.|||
Sbjct 963 CTCCCAGAGATTTGGAGTGCCACTGGGCTATGGGGGACCGCATGCGGCCTTCTTTGCTGTCAAAGAAAACCTGG 1036
Query 1022 TGAGAATGATGCCTGGAAGAATGGTGGGGGTAACAAGAGATGCCACTGGGAAAGAAGTGTATCGTCTTGCTCTT 1095
||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037 TGAGGATGATGCCTGGAAGGATGGTGGGGGTGACAAGGGATGCCACAGGGAAGGAAGTGTATCGCCTCGCTCTC 1110
Query 1096 CAAACCAGGGAGCAACACATTCGGAGAGACAAGGCTACCAGCAACATCTGTACAGCTCAGGCCCTCTTGGCGAA 1169
||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111 CAGACCAGAGAACAACACATCCGGAGAGACAAAGCCACCAGCAACATCTGCACGGCTCAGGCCCTTTTAGCCAA 1184
Query 1170 TATGGCTGCCATGTTTGCAATCTACCATGGTTCCCATGGGCTGGAGCATATTGCTAGGAGGGTACATAATGCCA 1243
.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||..|||||.||||||||.|
Sbjct 1185 CATGGCTGCCATGTTCGCCATTTACCATGGATCCCAGGGGCTGAAGCACATTGCTAAAAGGGTTCATAATGCTA 1258
Query 1244 CTTTGATTTTGTCAGAAGGTCTCAAGCGAGCAGGGCATCAACTCCAGCATGACCTGTTCTTTGATACCTTGAAG 1317
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259 CTTTGATTTTGTCTGAAGGGCTCAAGCGAGCAGGACACCAACTCCAGCATGACCTGTTCTTTGACACTTTGAAG 1332
Query 1318 ATTCAGTGTGGCTGCTCAGTGAAGGAGGTCTTGGGCAGGGCCGCTCAGCGGCAGATCAATTTTCGGCTTTTTGA 1391
.||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||.||||||.||||.|||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1333 GTTCAGTGTGGCTGCTCAGTGAAGGAGGTGCTGGGCAGAGCAGCTCAGAGGCAAATCAACTTTCGACTCTTCGA 1406
Query 1392 GGATGGCACACTTGGTATTTCTCTTGATGAAACAGTCAATGAAAAAGATCTGGACGATTTGTTGTGGATCTTTG 1465
.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||..||||||||||.|
Sbjct 1407 TGACGGCACACTTGGCATTTCTTTGGATGAAACAGTCACTGAGAAAGATCTGGATGATTTACTGTGGATCTTCG 1480
Query 1466 GTTGTGAGTCATCTGCAGAACTGGTTGCTGAAAGCATGGGAGAGGAGTGCAGAGGTATTCCAGGGTCTGTGTTC 1539
|.||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|||||||...|||
Sbjct 1481 GCTGTGAGTCATCTGCAGAATTAGTTGCTGAAGGCATGGGAGAGGAGCGGAGAGGTCTTCTAGGGTCTTCATTC 1554
Query 1540 AAGAGGACCAGCCCGTTCCTCACCCATCAAGTGTTCAACAGCTACCACTCTGAAACAAACATTGTCCGGTACAT 1613
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||
Sbjct 1555 AAGAGAACCAGCCCGTTCCTCACTCATCAGGTGTTCAACAGCTATCACTCAGAAACTAATCTTGTCCGGTATAT 1628
Query 1614 GAAGAAACTGGAAAATAAAGACATTTCCCTTGTTCACAGCATGATTCCACTGGGATCCTGCACCATGAAACTGA 1687
||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1629 GAAGAAACTGGAGAACAAAGACATCTCCCTCGTTCACAGCATGATCCCACTGGGATCCTGCACCATGAAGCTCA 1702
Query 1688 ACAGTTCGTCTGAACTCGCACCTATCACATGGAAAGAATTTGCAAACATCCACCCCTTTGTGCCTCTGGATCAA 1761
|.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1703 ATAGCTCCTCCGAACTTGCACCCATCACCTGGAGAGAATTTGCCAACATCCACCCCTTTGTGCCGCTGGACCAA 1776
Query 1762 GCTCAAGGATATCAGCAGCTTTTCCGAGAGCTTGAGAAGGATTTGTGTGAACTCACAGGTTATGACCAGGTCTG 1835
||.||.|||||.||.||||||||||.||.|||.|||||||||.|||||||..|||||||.||.||||..||||.
Sbjct 1777 GCCCAGGGATACCAACAGCTTTTCCAAGGGCTGGAGAAGGATCTGTGTGAGATCACAGGCTACGACCGAGTCTC 1850
Query 1836 TTTCCAGCCAAACAGCGGAGCCCAGGGAGAATATGCTGGACTGGCCACTATCCGAGCCTACTTAAACCAGAAAG 1909
.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||.||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1851 ATTCCAGCCAAACAGCGGAGCGCAGGGGGAGTACGCCGGACTGGCCACCATCAGAGCGTACTTAGACCAGAAAG 1924
Query 1910 GAGAGGGGCACAGAACGGTTTGCCTCATTCCGAAATCAGCACATGGGACCAACCCAGCAAGTGCCCACATGGCA 1983
|||||.|.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1925 GAGAGAGACACAGAACAGTCTGTCTCATTCCTAAGTCAGCACATGGAACGAATCCAGCAAGCGCTCACATGGCG 1998
Query 1984 GGCATGAAGATTCAGCCTGTGGAGGTGGATAAATATGGGAATATCGATGCAGTTCACCTCAAGGCCATGGTGGA 2057
|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||.|||||.|||||||..|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGCATGAAGATCCAGCCTGTGGAGGTGGACAGATACGGGAACATCGATGTGGCTCACCTCAAGGCCATGGTGGA 2072
Query 2058 TAAGCACAAGGAGAACCTAGCAGCTATCATGATTACATACCCATCCACCAATGGGGTGTTTGAAGAGAACATCA 2131
..|.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.
Sbjct 2073 CCAACACAAGGAGAACCTGGCCGCCATCATGATCACGTATCCATCTACCAATGGTGTATTTGAAGAGAATATCG 2146
Query 2132 GTGACGTGTGTGACCTCATCCATCAACATGGAGGACAGGTCTACCTAGACGGGGCAAATATGAATGCTCAGGTG 2205
|.||.|||||.|.|||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 2147 GCGATGTGTGCGCCCTGATTCACCAACACGGAGGACAGGTCTACCTCGACGGGGCGAACATGAATGCCCAGGTG 2220
Query 2206 GGAATCTGTCGCCCTGGAGACTTCGGGTCTGATGTCTCGCACCTAAATCTTCACAAGACCTTCTGCATTCCCCA 2279
||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGAATCTGCCGCCCTGGGGACTTTGGGTCAGACGTCTCTCACCTAAATCTTCACAAGACCTTCTGCATTCCCCA 2294
Query 2280 CGGAGGAGGTGGTCCTGGCATGGGGCCCATCGGAGTGAAGAAACATCTC-GCCCCGTTTTTGCCCAATCATCCC 2352
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||| ||||| |||.||||||..||.|||
Sbjct 2295 CGGAGGGGGCGGTCCTGGCATGGGGCCCATCGGAGTGAAGAAGCACCTCAGCCCC-TTTCTGCCCAGCCACCCC 2367
Query 2353 GTCATTTCACTAAAGCGGAATGAGGATGCCTGTCCTGTGGGAACCGTCAGTGCGGCCCCATGGGGCTCCAGTTC 2426
||||||||..||||||..|.|||.|...||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2368 GTCATTTCCATAAAGCCAACTGAAGGCACCTGGCCCGTGGGCACTGTCAGTGCAGCCCCGTGGGGTTCCAGCTC 2441
Query 2427 CATCTTGCCCATTTCCTGGGCTTATATCAAGATGATGGGAGGCAAGGGTCTTAAACAAGCCACGGAAACTGCGA 2500
||||.||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||.|||||||.||||..||.|
Sbjct 2442 CATCCTGCCCATTTCATGGGCTTACATTAAGATGATGGGTGGAAAGGGCCTCAAAGAAGCCACAGAAATCGCCA 2515
Query 2501 TATTAAATGCCAACTACATGGCCAAGCGATTAGAAACACACTACAGAATTCTTTTCAGGGGTGCAAGAGGTTAT 2574
|..||||||||||||||||||||||.|||.||||.|.||||||||||.|.||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 2516 TTCTAAATGCCAACTACATGGCCAAACGACTAGAGAAACACTACAGAGTCCTCTTTAGAGGTGCAAGAGGGTAT 2589
Query 2575 GTGGGTCATGAATTTATTTTGGACACGAGACCCTTCAAAAAGTCTGCAAATATTGAGGCTGTGGATGTGGCCAA 2648
||||.||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2590 GTGGCTCATGAGTTTATCTTGGACACCCGACCCTTCAAAAAGTCTGCCAATGTTGAGGCTGTGGATGTTGCCAA 2663
Query 2649 GAGACTCCAGGATTATGGATTTCACGCCCCTACCATGTCCTGGCCTGTGGCAGGGACCCTCATGGTGGAGCCCA 2722
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 2664 GAGGCTCCAGGATTATGGATTTCACGCCCCTACCATGTCCTGGCCTGTGGCAGGGACTCTCATGATTGAGCCCA 2737
Query 2723 CTGAGTCGGAGGACAAGGCAGAGCTGGACAGATTCTGTGATGCCATGATCAGCATTCGGCAGGAAATTGCTGAC 2796
|.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||
Sbjct 2738 CCGAGTCAGAAGACAAGGCAGAGCTCGACAGATTCTGTGATGCTATGATCAGCATCAGGCAAGAAATCGCTGAC 2811
Query 2797 ATTGAGGAGGGCCGCATCGACCCCAGGGTCAATCCGCTGAAGATGTCTCCACACTCCCTGACCTGCGTTACATC 2870
||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 2812 ATAGAGGAGGGCCGCATCGACCCGAGGGTCAACCCCCTGAAGATGTCTCCACACTCCTTGACCTGTGTCACATC 2885
Query 2871 TTCCCACTGGGACCGGCCTTATTCCAGAGAGGTGGCAGCATTCCCACTCCCCTTCGTGAAACCAGAGAACAAAT 2944
.|||..||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2886 CTCCTGCTGGGATCGGCCGTATTCTAGAGAGGTAGCAGCATTTCCACTGCCCTTTGTGAAACCAGAGAACAAAT 2959
Query 2945 TCTGGCCAACGATTGCCCGGATTGATGACATATATGGAGATCAGCACCTGGTTTGTACCTGCCCACCCATGGAA 3018
||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 2960 TCTGGCCAACCATTGCCCGGATCGATGACATCTACGGAGATCAGCACTTGGTCTGCACCTGCCCGCCCATGGAG 3033
Query 3019 GTTTATGAGTCTCCATTTTCTGAACAAAAGAGGGCGTCTTCT 3060
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 3034 GTCTATGAGTCTCCATTTTCTGAACAGAAGAGGGCTTCTTCT 3075