Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06282
Subject:
NM_138595.2
Aligned Length:
3076
Identities:
2659
Gaps:
17

Alignment

Query    1  ATGCAGTCCTGTGCCAGGGCGTGGGGGCTGCGCCTGGGCCGCGGGGTCGGGGGCGGCCGCCGCCTGGCTGGGGG  74
            ||||||...|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGCAGCTGTGTGCCAGGGCATGGGGGCTGCGCCTGGGCCGCGGAGCCGGGGGCGGCCACCGCCTGGCTCGGGG  74

Query   75  ATCGGGGCCGTGCTGGGCGCCGCGGAGCCGGGACAGCAGCAGTGGC---------------GGCGGGGACAGCG  133
            ..|.||...|.|.|||||||.|||.|||||||||||||||.|.|||               |||||||||.|||
Sbjct   75  CACCGGCTTGAGTTGGGCGCAGCGAAGCCGGGACAGCAGCGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGGGACCGCG  148

Query  134  CCGCGGCTGGGGCCTCGCGCCTCCTGGAGCGCCTTCTGCCCAGACACGACGACTTCGCTCGGAGGCACATCGGC  207
            .|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct  149  GCGCGGCTGGGGCCTCGCGCCTTCTGGAGCGCCTCCTGCCCAGACACGATGACTTCTCCCGGAGACACATCGGC  222

Query  208  CCTGGGGACAAAGACCAGAGAGAGATGCTGCAGACCTTGGGACTGGCGAGCATTGATGAATTGATCGAGAAGAC  281
            ||.||.||||||||||.|||.||||||||||||.|..||||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||
Sbjct  223  CCCGGAGACAAAGACCGGAGGGAGATGCTGCAGGCGCTGGGGCTGGCGAGCATTGATGAGCTCATCGAGAAGAC  296

Query  282  GGTCCCTGCCAACATCCGTTTGAAAAGACCCTTGAAAATGGAAGACCCTGTTTGTGAAAATGAAATCCTTGCAA  355
            ||||||.||||.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|..|
Sbjct  297  GGTCCCCGCCAGCATCCGCTTGAAGAGACCCTTGAAAATGGAAGACCCTATTTGTGAGAATGAAATCCTCGAGA  370

Query  356  CTCTGCATGCCATTTCAAGCAAAAACCAGATCTGGAGATCGTATATTGGCATGGGCTATTATAACTGCTCAGTG  429
            ||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  371  CTCTGCATGCCATTGCAAGCAAGAACCAGATCTGGAGGTCGTATATTGGCATGGGCTATTACAACTGCTCGGTG  444

Query  430  CCACAGACGATTTTGCGGAACTTACTGGAGAACTCAGGATGGATCACCCAGTATACTCCATACCAGCCTGAGGT  503
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct  445  CCCCAGACCATTTTGCGGAACTTACTGGAGAATTCTGGATGGGTCACCCAGTACACTCCGTATCAGCCAGAGGT  518

Query  504  GTCTCAGGGGAGGCTGGAGAGTTTACTCAACTACCAGACCATGGTGTGTGACATCACAGGCCTGGACATGGCCA  577
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  519  GTCCCAGGGGAGGCTGGAGAGTTTACTCAACTACCAGACCATGGTGTCTGACATCACAGGCTTGGACATGGCCA  592

Query  578  ATGCATCCCTGCTGGATGAGGGGACTGCAGCCGCAGAGGCACTGCAGCTGTGCTACAGACACAACAAGAGGAGG  651
            |.||.||||||||||||||||..||.||.||.||||||||..||||.||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct  593  ACGCTTCCCTGCTGGATGAGGCAACCGCGGCTGCAGAGGCGATGCAACTGTGCCACAGACACAACAAGAGGAAG  666

Query  652  AAATTTCTCGTTGATCCCCGTTGCCACCCACAGACAATAGCTGTTGTCCAGACTCGAGCCAAATATACTGGAGT  725
            ||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||.||
Sbjct  667  AAATTTTTCGTTGATCCTCGTTGTCACCCACAGACGATAGCTGTTGTCCAGACTCGAGCCAAATATAGGGGGGT  740

Query  726  CCTCACTGAGCTGAAGTTACCCTGTGAAATGGACTTCAGTGGAAAAGATGTCAGTGGAGTGTTGTTCCAGTACC  799
            .||....|||||||||||||||...||||||||.||||||||.|||||.|||.||||.|||.||||||||||||
Sbjct  741  GCTTGTCGAGCTGAAGTTACCCCACGAAATGGATTTCAGTGGCAAAGACGTCTGTGGGGTGCTGTTCCAGTACC  814

Query  800  CAGACACGGAGGGGAAGGTGGAAGACTTTACGGAACTCGTGGAGAGAGCTCATCAGAGTGGGAGCCTGGCCTGC  873
            |||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  815  CAGACACTGAGGGGAAGGTGGAGGACTTCACAGAACTTGTAGACAGAGCCCATCAGACTGGGAGCCTGACCTGC  888

Query  874  TGTGCTACTGACCTTTTAGCTTTGTGCATCTTGAGGCCACCTGGAGAATTTGGGGTAGACATCGCCCTGGGCAG  947
            |||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||.
Sbjct  889  TGTGCTACTGACCTTTTAGCTCTGTGTATTTTGAGGCCACCTGGAGAGTTTGGAGTGGACATTGCCCTGGGCAA  962

Query  948  CTCCCAGAGATTTGGAGTGCCACTGGGCTATGGGGGACCCCATGCAGCATTTTTTGCTGTCCGAGAAAGCTTGG  1021
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||..|||||.|.|||
Sbjct  963  CTCCCAGAGATTTGGAGTGCCACTGGGCTATGGGGGACCGCATGCGGCCTTCTTTGCTGTCAAAGAAAACCTGG  1036

Query 1022  TGAGAATGATGCCTGGAAGAATGGTGGGGGTAACAAGAGATGCCACTGGGAAAGAAGTGTATCGTCTTGCTCTT  1095
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TGAGGATGATGCCTGGAAGGATGGTGGGGGTGACAAGGGATGCCACAGGGAAGGAAGTGTATCGCCTCGCTCTC  1110

Query 1096  CAAACCAGGGAGCAACACATTCGGAGAGACAAGGCTACCAGCAACATCTGTACAGCTCAGGCCCTCTTGGCGAA  1169
            ||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111  CAGACCAGAGAACAACACATCCGGAGAGACAAAGCCACCAGCAACATCTGCACGGCTCAGGCCCTTTTAGCCAA  1184

Query 1170  TATGGCTGCCATGTTTGCAATCTACCATGGTTCCCATGGGCTGGAGCATATTGCTAGGAGGGTACATAATGCCA  1243
            .||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||..|||||.||||||||.|
Sbjct 1185  CATGGCTGCCATGTTCGCCATTTACCATGGATCCCAGGGGCTGAAGCACATTGCTAAAAGGGTTCATAATGCTA  1258

Query 1244  CTTTGATTTTGTCAGAAGGTCTCAAGCGAGCAGGGCATCAACTCCAGCATGACCTGTTCTTTGATACCTTGAAG  1317
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259  CTTTGATTTTGTCTGAAGGGCTCAAGCGAGCAGGACACCAACTCCAGCATGACCTGTTCTTTGACACTTTGAAG  1332

Query 1318  ATTCAGTGTGGCTGCTCAGTGAAGGAGGTCTTGGGCAGGGCCGCTCAGCGGCAGATCAATTTTCGGCTTTTTGA  1391
            .||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||.||||||.||||.|||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1333  GTTCAGTGTGGCTGCTCAGTGAAGGAGGTGCTGGGCAGAGCAGCTCAGAGGCAAATCAACTTTCGACTCTTCGA  1406

Query 1392  GGATGGCACACTTGGTATTTCTCTTGATGAAACAGTCAATGAAAAAGATCTGGACGATTTGTTGTGGATCTTTG  1465
            .||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||..||||||||||.|
Sbjct 1407  TGACGGCACACTTGGCATTTCTTTGGATGAAACAGTCACTGAGAAAGATCTGGATGATTTACTGTGGATCTTCG  1480

Query 1466  GTTGTGAGTCATCTGCAGAACTGGTTGCTGAAAGCATGGGAGAGGAGTGCAGAGGTATTCCAGGGTCTGTGTTC  1539
            |.||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|||||||...|||
Sbjct 1481  GCTGTGAGTCATCTGCAGAATTAGTTGCTGAAGGCATGGGAGAGGAGCGGAGAGGTCTTCTAGGGTCTTCATTC  1554

Query 1540  AAGAGGACCAGCCCGTTCCTCACCCATCAAGTGTTCAACAGCTACCACTCTGAAACAAACATTGTCCGGTACAT  1613
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||
Sbjct 1555  AAGAGAACCAGCCCGTTCCTCACTCATCAGGTGTTCAACAGCTATCACTCAGAAACTAATCTTGTCCGGTATAT  1628

Query 1614  GAAGAAACTGGAAAATAAAGACATTTCCCTTGTTCACAGCATGATTCCACTGGGATCCTGCACCATGAAACTGA  1687
            ||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1629  GAAGAAACTGGAGAACAAAGACATCTCCCTCGTTCACAGCATGATCCCACTGGGATCCTGCACCATGAAGCTCA  1702

Query 1688  ACAGTTCGTCTGAACTCGCACCTATCACATGGAAAGAATTTGCAAACATCCACCCCTTTGTGCCTCTGGATCAA  1761
            |.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1703  ATAGCTCCTCCGAACTTGCACCCATCACCTGGAGAGAATTTGCCAACATCCACCCCTTTGTGCCGCTGGACCAA  1776

Query 1762  GCTCAAGGATATCAGCAGCTTTTCCGAGAGCTTGAGAAGGATTTGTGTGAACTCACAGGTTATGACCAGGTCTG  1835
            ||.||.|||||.||.||||||||||.||.|||.|||||||||.|||||||..|||||||.||.||||..||||.
Sbjct 1777  GCCCAGGGATACCAACAGCTTTTCCAAGGGCTGGAGAAGGATCTGTGTGAGATCACAGGCTACGACCGAGTCTC  1850

Query 1836  TTTCCAGCCAAACAGCGGAGCCCAGGGAGAATATGCTGGACTGGCCACTATCCGAGCCTACTTAAACCAGAAAG  1909
            .||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||.||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1851  ATTCCAGCCAAACAGCGGAGCGCAGGGGGAGTACGCCGGACTGGCCACCATCAGAGCGTACTTAGACCAGAAAG  1924

Query 1910  GAGAGGGGCACAGAACGGTTTGCCTCATTCCGAAATCAGCACATGGGACCAACCCAGCAAGTGCCCACATGGCA  1983
            |||||.|.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1925  GAGAGAGACACAGAACAGTCTGTCTCATTCCTAAGTCAGCACATGGAACGAATCCAGCAAGCGCTCACATGGCG  1998

Query 1984  GGCATGAAGATTCAGCCTGTGGAGGTGGATAAATATGGGAATATCGATGCAGTTCACCTCAAGGCCATGGTGGA  2057
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||.|||||.|||||||..|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGCATGAAGATCCAGCCTGTGGAGGTGGACAGATACGGGAACATCGATGTGGCTCACCTCAAGGCCATGGTGGA  2072

Query 2058  TAAGCACAAGGAGAACCTAGCAGCTATCATGATTACATACCCATCCACCAATGGGGTGTTTGAAGAGAACATCA  2131
            ..|.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.
Sbjct 2073  CCAACACAAGGAGAACCTGGCCGCCATCATGATCACGTATCCATCTACCAATGGTGTATTTGAAGAGAATATCG  2146

Query 2132  GTGACGTGTGTGACCTCATCCATCAACATGGAGGACAGGTCTACCTAGACGGGGCAAATATGAATGCTCAGGTG  2205
            |.||.|||||.|.|||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 2147  GCGATGTGTGCGCCCTGATTCACCAACACGGAGGACAGGTCTACCTCGACGGGGCGAACATGAATGCCCAGGTG  2220

Query 2206  GGAATCTGTCGCCCTGGAGACTTCGGGTCTGATGTCTCGCACCTAAATCTTCACAAGACCTTCTGCATTCCCCA  2279
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGAATCTGCCGCCCTGGGGACTTTGGGTCAGACGTCTCTCACCTAAATCTTCACAAGACCTTCTGCATTCCCCA  2294

Query 2280  CGGAGGAGGTGGTCCTGGCATGGGGCCCATCGGAGTGAAGAAACATCTC-GCCCCGTTTTTGCCCAATCATCCC  2352
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||| ||||| |||.||||||..||.|||
Sbjct 2295  CGGAGGGGGCGGTCCTGGCATGGGGCCCATCGGAGTGAAGAAGCACCTCAGCCCC-TTTCTGCCCAGCCACCCC  2367

Query 2353  GTCATTTCACTAAAGCGGAATGAGGATGCCTGTCCTGTGGGAACCGTCAGTGCGGCCCCATGGGGCTCCAGTTC  2426
            ||||||||..||||||..|.|||.|...||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2368  GTCATTTCCATAAAGCCAACTGAAGGCACCTGGCCCGTGGGCACTGTCAGTGCAGCCCCGTGGGGTTCCAGCTC  2441

Query 2427  CATCTTGCCCATTTCCTGGGCTTATATCAAGATGATGGGAGGCAAGGGTCTTAAACAAGCCACGGAAACTGCGA  2500
            ||||.||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||.|||||||.||||..||.|
Sbjct 2442  CATCCTGCCCATTTCATGGGCTTACATTAAGATGATGGGTGGAAAGGGCCTCAAAGAAGCCACAGAAATCGCCA  2515

Query 2501  TATTAAATGCCAACTACATGGCCAAGCGATTAGAAACACACTACAGAATTCTTTTCAGGGGTGCAAGAGGTTAT  2574
            |..||||||||||||||||||||||.|||.||||.|.||||||||||.|.||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 2516  TTCTAAATGCCAACTACATGGCCAAACGACTAGAGAAACACTACAGAGTCCTCTTTAGAGGTGCAAGAGGGTAT  2589

Query 2575  GTGGGTCATGAATTTATTTTGGACACGAGACCCTTCAAAAAGTCTGCAAATATTGAGGCTGTGGATGTGGCCAA  2648
            ||||.||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2590  GTGGCTCATGAGTTTATCTTGGACACCCGACCCTTCAAAAAGTCTGCCAATGTTGAGGCTGTGGATGTTGCCAA  2663

Query 2649  GAGACTCCAGGATTATGGATTTCACGCCCCTACCATGTCCTGGCCTGTGGCAGGGACCCTCATGGTGGAGCCCA  2722
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 2664  GAGGCTCCAGGATTATGGATTTCACGCCCCTACCATGTCCTGGCCTGTGGCAGGGACTCTCATGATTGAGCCCA  2737

Query 2723  CTGAGTCGGAGGACAAGGCAGAGCTGGACAGATTCTGTGATGCCATGATCAGCATTCGGCAGGAAATTGCTGAC  2796
            |.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||
Sbjct 2738  CCGAGTCAGAAGACAAGGCAGAGCTCGACAGATTCTGTGATGCTATGATCAGCATCAGGCAAGAAATCGCTGAC  2811

Query 2797  ATTGAGGAGGGCCGCATCGACCCCAGGGTCAATCCGCTGAAGATGTCTCCACACTCCCTGACCTGCGTTACATC  2870
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 2812  ATAGAGGAGGGCCGCATCGACCCGAGGGTCAACCCCCTGAAGATGTCTCCACACTCCTTGACCTGTGTCACATC  2885

Query 2871  TTCCCACTGGGACCGGCCTTATTCCAGAGAGGTGGCAGCATTCCCACTCCCCTTCGTGAAACCAGAGAACAAAT  2944
            .|||..||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2886  CTCCTGCTGGGATCGGCCGTATTCTAGAGAGGTAGCAGCATTTCCACTGCCCTTTGTGAAACCAGAGAACAAAT  2959

Query 2945  TCTGGCCAACGATTGCCCGGATTGATGACATATATGGAGATCAGCACCTGGTTTGTACCTGCCCACCCATGGAA  3018
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 2960  TCTGGCCAACCATTGCCCGGATCGATGACATCTACGGAGATCAGCACTTGGTCTGCACCTGCCCGCCCATGGAG  3033

Query 3019  GTTTATGAGTCTCCATTTTCTGAACAAAAGAGGGCGTCTTCT  3060
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 3034  GTCTATGAGTCTCCATTTTCTGAACAGAAGAGGGCTTCTTCT  3075