Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06284
• Subject: NM_001146040.2
• Aligned Length: 1371
• Identities: 1369
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTACAGCTTCAATACTCTTCGACTCTACCTTTGGGAGACCATTGTATTCTTCAGCCTTGCTGCTTCTAAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTACAGCTTCAATACTCTTCGACTCTACCTTTGGGAGACCATTGTATTCTTCAGCCTTGCTGCTTCTAAGGA  74

Query   75  GGCTGAAGCTGCTCGATCCGCACCCAAGCCTATGTCACCCTCGGATTTCCTGGATAAGCTAATGGGGAGAACCT  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGAAGCTGCTCGCTCCGCACCCAAGCCTATGTCACCCTCGGATTTCCTGGATAAGCTAATGGGGAGAACCT  148

Query  149  CCGGATATGATGCCAGGATCAGGCCCAATTTTAAAGGTCCCCCAGTGAACGTGAGCTGCAACATTTTCATCAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGGATATGATGCCAGGATCAGGCCCAATTTTAAAGGTCCCCCAGTGAACGTGAGCTGCAACATTTTCATCAAC  222

Query  223  AGCTTTGGTTCCATTGCTGAGACAACCATGGACTATAGGGTCAACATCTTCCTGCGGCAGCAATGGAACGACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTTTGGTTCCATTGCTGAGACAACCATGGACTATAGGGTCAACATCTTCCTGCGGCAGCAATGGAACGACCC  296

Query  297  CCGCCTGGCCTATAATGAATACCCTGACGACTCTCTGGACCTGGACCCATCCATGCTGGACTCCATCTGGAAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCCTGGCCTATAATGAATACCCTGACGACTCTCTGGACCTGGACCCATCCATGCTGGACTCCATCTGGAAAC  370

Query  371  CTGACCTGTTCTTTGCCAACGAGAAGGGGGCCCACTTCCATGAGATCACCACAGACAACAAATTGCTAAGGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGACCTGTTCTTTGCCAACGAGAAGGGGGCCCACTTCCATGAGATCACCACAGACAACAAATTGCTAAGGATC  444

Query  445  TCCCGGAATGGGAATGTCCTCTACAGCATCAGAATCACCCTGACACTGGCCTGCCCCATGGACTTGAAGAATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCGGAATGGGAATGTCCTCTACAGCATCAGAATCACCCTGACACTGGCCTGCCCCATGGACTTGAAGAATTT  518

Query  519  CCCCATGGATGTCCAGACATGTATCATGCAACTGGAAAGCTTTGGATATACGATGAATGACCTCATCTTTGAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCATGGATGTCCAGACATGTATCATGCAACTGGAAAGCTTTGGATATACGATGAATGACCTCATCTTTGAGT  592

Query  593  GGCAGGAACAGGGAGCCGTGCAGGTAGCAGATGGACTAACTCTGCACCAGTTTATCTTGAAGGAAGAGAAGGAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCAGGAACAGGGAGCCGTGCAGGTAGCAGATGGACTAACTCTGCCCCAGTTTATCTTGAAGGAAGAGAAGGAC  666

Query  667  TTGAGATACTGCACCAAGCACTACAACACAGGTAAATTCACCTGCATTGAGGCCCGGTTCCACCTGGAGCGGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGAGATACTGCACCAAGCACTACAACACAGGTAAATTCACCTGCATTGAGGCCCGGTTCCACCTGGAGCGGCA  740

Query  741  GATGGGTTACTACCTGATTCAGATGTATATTCCCAGCCTGCTCATTGTCATCCTCTCATGGATCTCCTTCTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGGGTTACTACCTGATTCAGATGTATATTCCCAGCCTGCTCATTGTCATCCTCTCATGGATCTCCTTCTGGA  814

Query  815  TCAACATGGATGCTGCACCTGCTCGTGTGGGCCTAGGCATCACCACTGTGCTCACCATGACCACCCAGAGCTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAACATGGATGCTGCACCTGCTCGTGTGGGCCTAGGCATCACCACTGTGCTCACCATGACCACCCAGAGCTCC  888

Query  889  GGCTCTCGAGCATCTCTGCCCAAGGTGTCCTATGTGAAAGCCATTGACATTTGGATGGCAGTTTGCCTGCTCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTCTCGAGCATCTCTGCCCAAGGTGTCCTATGTGAAAGCCATTGACATTTGGATGGCAGTTTGCCTGCTCTT  962

Query  963  TGTGTTCTCAGCCCTATTAGAATATGCTGCCGTTAACTTTGTGTCTCGGCAACATAAGGAGCTGCTCCGATTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGTTCTCAGCCCTATTAGAATATGCTGCCGTTAACTTTGTGTCTCGGCAACATAAGGAGCTGCTCCGATTCA  1036

Query 1037  GGAGGAAGCGGAGACATCACAAGAGCCCCATGTTGAATCTATTCCAGGAGGATGAAGCTGGAGAAGGCCGCTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAGGAAGCGGAGACATCACAAGAGCCCCATGTTGAATCTATTCCAGGAGGATGAAGCTGGAGAAGGCCGCTTT  1110

Query 1111  AACTTCTCTGCCTATGGGATGGGCCCAGCCTGTCTACAGGCCAAGGATGGCATCTCAGTCAAGGGCGCCAACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTTCTCTGCCTATGGGATGGGCCCAGCCTGTCTACAGGCCAAGGATGGCATCTCAGTCAAGGGCGCCAACAA  1184

Query 1185  CAGTAACACCACCAACCCCCCTCCTGCACCATCTAAGTCCCCAGAGGAGATGCGAAAACTCTTCATCCAGAGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGTAACACCACCAACCCCCCTCCTGCACCATCTAAGTCCCCAGAGGAGATGCGAAAACTCTTCATCCAGAGGG  1258

Query 1259  CCAAGAAGATCGACAAAATATCCCGCATTGGCTTCCCCATGGCCTTCCTCATTTTCAACATGTTCTACTGGATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAAGAAGATCGACAAAATATCCCGCATTGGCTTCCCCATGGCCTTCCTCATTTTCAACATGTTCTACTGGATC  1332

Query 1333  ATCTACAAGATTGTCCGTAGAGAGGACGTCCACAACCAG  1371
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCTACAAGATTGTCCGTAGAGAGGACGTCCACAACCAG  1371