Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06284
• Subject: NM_001292000.2
• Aligned Length: 1371
• Identities: 1097
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  ATGTACAGCTTCAATACTCTTCGACTCTACCTTTGGGAGACCATTGTATTCTTCAGCCTTGCTGCTTCTAAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCTGAAGCTGCTCGATCCGCACCCAAGCCTATGTCACCCTCGGATTTCCTGGATAAGCTAATGGGGAGAACCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCGGATATGATGCCAGGATCAGGCCCAATTTTAAAGGTCCCCCAGTGAACGTGAGCTGCAACATTTTCATCAAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGCTTTGGTTCCATTGCTGAGACAACCATGGACTATAGGGTCAACATCTTCCTGCGGCAGCAATGGAACGACCC  296
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------ATGGACTATAGGGTCAACATCTTCCTGCGGCAGCAATGGAACGACCC  47

Query  297  CCGCCTGGCCTATAATGAATACCCTGACGACTCTCTGGACCTGGACCCATCCATGCTGGACTCCATCTGGAAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  CCGCCTGGCCTATAATGAATACCCTGACGACTCTCTGGACCTGGACCCATCCATGCTGGACTCCATCTGGAAAC  121

Query  371  CTGACCTGTTCTTTGCCAACGAGAAGGGGGCCCACTTCCATGAGATCACCACAGACAACAAATTGCTAAGGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  CTGACCTGTTCTTTGCCAACGAGAAGGGGGCCCACTTCCATGAGATCACCACAGACAACAAATTGCTAAGGATC  195

Query  445  TCCCGGAATGGGAATGTCCTCTACAGCATCAGAATCACCCTGACACTGGCCTGCCCCATGGACTTGAAGAATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  TCCCGGAATGGGAATGTCCTCTACAGCATCAGAATCACCCTGACACTGGCCTGCCCCATGGACTTGAAGAATTT  269

Query  519  CCCCATGGATGTCCAGACATGTATCATGCAACTGGAAAGCTTTGGATATACGATGAATGACCTCATCTTTGAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  CCCCATGGATGTCCAGACATGTATCATGCAACTGGAAAGCTTTGGATATACGATGAATGACCTCATCTTTGAGT  343

Query  593  GGCAGGAACAGGGAGCCGTGCAGGTAGCAGATGGACTAACTCTGCACCAGTTTATCTTGAAGGAAGAGAAGGAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  GGCAGGAACAGGGAGCCGTGCAGGTAGCAGATGGACTAACTCTGCCCCAGTTTATCTTGAAGGAAGAGAAGGAC  417

Query  667  TTGAGATACTGCACCAAGCACTACAACACAGGTAAATTCACCTGCATTGAGGCCCGGTTCCACCTGGAGCGGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  TTGAGATACTGCACCAAGCACTACAACACAGGTAAATTCACCTGCATTGAGGCCCGGTTCCACCTGGAGCGGCA  491

Query  741  GATGGGTTACTACCTGATTCAGATGTATATTCCCAGCCTGCTCATTGTCATCCTCTCATGGATCTCCTTCTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GATGGGTTACTACCTGATTCAGATGTATATTCCCAGCCTGCTCATTGTCATCCTCTCATGGATCTCCTTCTGGA  565

Query  815  TCAACATGGATGCTGCACCTGCTCGTGTGGGCCTAGGCATCACCACTGTGCTCACCATGACCACCCAGAGCTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  TCAACATGGATGCTGCACCTGCTCGTGTGGGCCTAGGCATCACCACTGTGCTCACCATGACCACCCAGAGCTCC  639

Query  889  GGCTCTCGAGCATCTCTGCCCAAGGTGTCCTATGTGAAAGCCATTGACATTTGGATGGCAGTTTGCCTGCTCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  GGCTCTCGAGCATCTCTGCCCAAGGTGTCCTATGTGAAAGCCATTGACATTTGGATGGCAGTTTGCCTGCTCTT  713

Query  963  TGTGTTCTCAGCCCTATTAGAATATGCTGCCGTTAACTTTGTGTCTCGGCAACATAAGGAGCTGCTCCGATTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  TGTGTTCTCAGCCCTATTAGAATATGCTGCCGTTAACTTTGTGTCTCGGCAACATAAGGAGCTGCTCCGATTCA  787

Query 1037  GGAGGAAGCGGAGACATCACAAGAGCCCCATGTTGAATCTATTCCAGGAGGATGAAGCTGGAGAAGGCCGCTTT  1110
            |||||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  GGAGGAAGCGGAGACATCACA------------------------AGGAGGATGAAGCTGGAGAAGGCCGCTTT  837

Query 1111  AACTTCTCTGCCTATGGGATGGGCCCAGCCTGTCTACAGGCCAAGGATGGCATCTCAGTCAAGGGCGCCAACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838  AACTTCTCTGCCTATGGGATGGGCCCAGCCTGTCTACAGGCCAAGGATGGCATCTCAGTCAAGGGCGCCAACAA  911

Query 1185  CAGTAACACCACCAACCCCCCTCCTGCACCATCTAAGTCCCCAGAGGAGATGCGAAAACTCTTCATCCAGAGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  CAGTAACACCACCAACCCCCCTCCTGCACCATCTAAGTCCCCAGAGGAGATGCGAAAACTCTTCATCCAGAGGG  985

Query 1259  CCAAGAAGATCGACAAAATATCCCGCATTGGCTTCCCCATGGCCTTCCTCATTTTCAACATGTTCTACTGGATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  986  CCAAGAAGATCGACAAAATATCCCGCATTGGCTTCCCCATGGCCTTCCTCATTTTCAACATGTTCTACTGGATC  1059

Query 1333  ATCTACAAGATTGTCCGTAGAGAGGACGTCCACAACCAG  1371
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060  ATCTACAAGATTGTCCGTAGAGAGGACGTCCACAACCAG  1098