Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06292
- Subject:
- NM_001282619.2
- Aligned Length:
- 1084
- Identities:
- 985
- Gaps:
- 86
Alignment
Query 1 -------AT---GGGCTGCACCGTG--AGC---GCCGAGGACAAGGCGGCGGCCGAGCGCTCTAAGATGATCGA 59
|| ||||..|..|.|| ||| |||.|||.|| || || ||.|.
Sbjct 1 ATGGAGTATGCAGGGCATCTTCCTGCCAGCTCTGCCCAGGGCA---------CC------------AT-ATTGG 52
Query 60 CAAGAACCTGCGGGAGGACGGAGAGAAGGCGGCGCGGGAGGTGAAGTTGCTGCTGTTG----GGTGCTGTGGAG 129
||.|.|||.|| || |||||||.||||
Sbjct 53 CATGCACCAGC---------------------------------------------TGCACAGGTGCTGGGGAG 81
Query 130 TCAGGGAAGAGCACCATCGTCAAGCAGATGAAGATCATCCACGAGGATGGCTACTCCGAGGAGGAATGCCGGCA 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 TCAGGGAAGAGCACCATCGTCAAGCAGATGAAGATCATCCACGAGGATGGCTACTCCGAGGAGGAATGCCGGCA 155
Query 204 GTACCGGGCGGTTGTCTACAGCAACACCATCCAGTCCATCATGGCCATTGTCAAAGCCATGGGCAACCTGCAGA 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 GTACCGGGCGGTTGTCTACAGCAACACCATCCAGTCCATCATGGCCATTGTCAAAGCCATGGGCAACCTGCAGA 229
Query 278 TCGACTTTGCCGACCCCTCCAGAGCGGACGACGCCAGGCAGCTATTTGCACTGTCCTGCACCGCCGAGGAGCAA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 TCGACTTTGCCGACCCCTCCAGAGCGGACGACGCCAGGCAGCTATTTGCACTGTCCTGCACCGCCGAGGAGCAA 303
Query 352 GGCGTGCTCCCTGATGACCTGTCCGGCGTCATCCGGAGGCTCTGGGCTGACCATGGTGTGCAGGCCTGCTTTGG 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 GGCGTGCTCCCTGATGACCTGTCCGGCGTCATCCGGAGGCTCTGGGCTGACCATGGTGTGCAGGCCTGCTTTGG 377
Query 426 CCGCTCAAGGGAATACCAGCTCAACGACTCAGCTGCCTACTACCTGAACGACCTGGAGCGTATTGCACAGAGTG 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 CCGCTCAAGGGAATACCAGCTCAACGACTCAGCTGCCTACTACCTGAACGACCTGGAGCGTATTGCACAGAGTG 451
Query 500 ACTACATCCCCACACAGCAAGATGTGCTACGGACCCGCGTAAAGACCACGGGGATCGTGGAGACACACTTCACC 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 ACTACATCCCCACACAGCAAGATGTGCTACGGACCCGCGTAAAGACCACGGGGATCGTGGAGACACACTTCACC 525
Query 574 TTCAAGGACCTACACTTCAAGATGTTTGATGTGGGTGGTCAGCGGTCTGAGCGGAAGAAGTGGATCCACTGCTT 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 TTCAAGGACCTACACTTCAAGATGTTTGATGTGGGTGGTCAGCGGTCTGAGCGGAAGAAGTGGATCCACTGCTT 599
Query 648 TGAGGGCGTCACAGCCATCATCTTCTGCGTAGCCTTGAGCGCCTATGACTTGGTGCTAGCTGAGGACGAGGAGA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TGAGGGCGTCACAGCCATCATCTTCTGCGTAGCCTTGAGCGCCTATGACTTGGTGCTAGCTGAGGACGAGGAGA 673
Query 722 TGAACCGCATGCATGAGAGCATGAAGCTATTCGATAGCATCTGCAACAACAAGTGGTTCACAGACACGTCCATC 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674 TGAACCGCATGCATGAGAGCATGAAGCTATTCGATAGCATCTGCAACAACAAGTGGTTCACAGACACGTCCATC 747
Query 796 ATCCTCTTCCTCAACAAGAAGGACCTGTTTGAGGAGAAGATCACACACAGTCCCCTGACCATCTGCTTCCCTGA 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748 ATCCTCTTCCTCAACAAGAAGGACCTGTTTGAGGAGAAGATCACACACAGTCCCCTGACCATCTGCTTCCCTGA 821
Query 870 GTACACAGGGGCCAACAAATATGATGAGGCAGCCAGCTACATCCAGAGTAAGTTTGAGGACCTGAATAAGCGCA 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 GTACACAGGGGCCAACAAATATGATGAGGCAGCCAGCTACATCCAGAGTAAGTTTGAGGACCTGAATAAGCGCA 895
Query 944 AAGACACCAAGGAGATCTACACGCACTTCACGTGCGCCACCGACACCAAGAACGTGCAGTTCGTGTTTGACGCC 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 AAGACACCAAGGAGATCTACACGCACTTCACGTGCGCCACCGACACCAAGAACGTGCAGTTCGTGTTTGACGCC 969
Query 1018 GTCACCGATGTCATCATCAAGAACAACCTGAAGGACTGCGGCCTCTTC 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 GTCACCGATGTCATCATCAAGAACAACCTGAAGGACTGCGGCCTCTTC 1017