Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06405
• Subject: NM_001164671.2
• Aligned Length: 1191
• Identities: 1097
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTGAAAGAAACAACTTACTACGATGTTTTGGGGGTCAAACCCAATGCTACTCAGGAAGAATTGAAAAAGGC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGAAAGAAACCACTTACTACGATGTTTTGGGGGTAAAACCCAATGCCACCCAGGAAGAATTGAAAAAGGC  74

Query   75  TTATAGGAAACTGGCCTTGAAGTACCATCCTGATAAGAACCCAAATGAAGGAGAGAAGTTTAAACAGATTTCTC  148
            .|||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATATAGAAAATTGGCCTTGAAGTACCACCCTGATAAGAATCCAAATGAAGGGGAAAAGTTTAAACAGATTTCTC  148

Query  149  AAGCTTACGAAGTTCTCTCTGATGCAAAGAAAAGGGAATTATATGACAAAGGAGGAGAACAGGCAATTAAAGAG  222
            |||||||.||||||||..|||||.|.||.|||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  149  AAGCTTATGAAGTTCTTGCTGATTCCAAAAAAAGGGAACTATATGATAAAGGAGGGGAGCAGGCGATTAAAGAG  222

Query  223  GGTGGAGCAGGTGGCGGTTTTGGCTCCCCCATGGACATCTTTGATATGTTTTTTGGAGGAGGAGGAAGGATGCA  296
            ||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GGCGGAGCAGGTGGTGGTTTTGGCTCACCCATGGATATCTTTGATATGTTCTTTGGAGGAGGAGGAAGAATGCA  296

Query  297  GAGAGAAAGGAGAGGTAAAAATGTTGTACATCAGCTCTCAGTAACCCTAGAAGACTTATATAATGGTGCAACAA  370
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGAAAGGAGAGGTAAAAATGTTGTTCATCAGCTCTCAGTGACCTTAGAAGACTTATATAATGGTGCAACAA  370

Query  371  GAAAACTGGCTCTGCAAAAGAATGTGATTTGTGACAAATGTGAAGGTAGAGGAGGTAAGAAAGGAGCAGTAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAAACTGGCTCTGCAAAAGAATGTGATTTGTGACAAATGTGAAGGCCGAGGTGGTAAGAAAGGAGCAGTAGAG  444

Query  445  TGCTGTCCCAATTGCCGAGGTACTGGAATGCAAATAAGAATTCATCAGATAGGACCTGGAATGGTTCAGCAAAT  518
            |||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTGTCCCAACTGCCGGGGGACAGGTATGCAGATAAGGATTCATCAGATTGGACCAGGAATGGTTCAGCAAAT  518

Query  519  TCAGTCTGTGTGCATGGAGTGCCAGGGCCATGGGGAGCGGATCAGTCCTAAAGATAGATGTAAAAGCTGCAACG  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCAGTCAGTGTGCATGGAGTGCCAGGGTCATGGAGAACGCATCAGTCCAAAAGACAGATGTAAAAGCTGCAATG  592

Query  593  GAAGGAAGATAGTTCGAGAGAAGAAAATTTTAGAAGTTCATATTGACAAAGGCATGAAAGATGGCCAGAAGATA  666
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GAAGAAAAATAGTTCGAGAGAAGAAAATTTTAGAAGTTCATATTGATAAAGGCATGAAAGATGGTCAGAAGATA  666

Query  667  ACATTCCATGGTGAAGGAGACCAAGAACCAGGACTGGAGCCAGGCGATATTATCATTGTGTTAGATCAGAAGGA  740
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACATTCCACGGTGAAGGAGACCAAGAACCAGGACTGGAGCCAGGAGATATTATCATTGTGTTAGATCAGAAGGA  740

Query  741  CCATGCTGTTTTTACTCGACGAGGAGAAGACCTTTTCATGTGTATGGACATACAGCTCGTTGAAGCACTGTGTG  814
            |||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|
Sbjct  741  CCATGCTGTTTTTACAAGGCGAGGAGAAGACCTTTTCATGTGTATGGACATACAGCTGGTTGAAGCATTGTGCG  814

Query  815  GCTTCCAGAAGCCAATATCTACTCTTGACAACCGAACCATCGTCATCACCTCTCATCCAGGTCAGATTGTCAAG  888
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTTCCAAAAGCCAATATCTACTCTTGACAACCGAACCATAGTCATCACCTCTCATCCAGGTCAGATTGTCAAG  888

Query  889  CATGGAGATATCAAGTGTGTACTAAATGAAGGCATGCCAATTTATCGTAGACCATATGAAAAGGGTCGCCTAAT  962
            |||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||.|.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CATGGGGATATAAAATGTGTGCTAAATGAAGGTATGCCAATATACCGTCGGCCATATGAAAAGGGACGTCTAAT  962

Query  963  CATCGAATTTAAGGTAAACTTTCCTGAGAATGGCTTTCTCTCTCCTGATAAACTGTCTTTGCTGGAAAAACTCC  1036
            |||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATTGAGTTTAAGGTAAACTTTCCTGAAAATGGCTTTCTCTCTCCTGATAAACTCTCTTTGCTGGAAAAACTCC  1036

Query 1037  TACCCGAGAGGAAGGAAGTGGAAGAGACTGATGAGATGGACCAAGTAGAACTGGTGGACTTTGATCCAAATCAG  1110
            |.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCCTGAAAGGAAGGAAGTAGAAGAGACTGATGAAATGGATCAGGTAGAACTGGTGGACTTTGATCCAAATCAG  1110

Query 1111  GAAAGACGGCGCCACTACAATGGAGAAGCATATGAGGATGATGAACATCATCCCAGAGGTGGTGTTCAGTGTCA  1184
            |||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  GAAAGACGGCGTCATTATAATGGAGAAGCGTATGAGGATGATGAACATCACCCCAGAGGTGGCGTTCAGTGTCA  1184

Query 1185  GACCTCT  1191
            |||||||
Sbjct 1185  GACCTCT  1191