Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06446
Subject:
NM_001258215.1
Aligned Length:
862
Identities:
775
Gaps:
86

Alignment

Query   1  MAHTFRGCSLAFMFIITWLLIKAKIDACKRGDVTVKPSHVILLGSTVNITCSLKPRQGCFHYSRRNKLILYKFD  74
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Sbjct   1  MAHTFRGCSLAFMFIITWLLIKAKIDACKRGDVTVKPSHVILLGSTVNITCSLKPRQGCFHYSRRNKLILYKFD  74

Query  75  RRINFHHGHSLNSQVTGLPLGTTLFVCKLACINSDEIQICGAEIFVGVAPEQPQNLSCIQKGEQGTVACTWERG  148
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Sbjct  75  RRINFHHGHSLNSQVTGLPLGTTLFVCKLACINSDEIQICGAEIFVGVAPEQPQNLSCIQKGEQGTVACTWERG  148

Query 149  RDTHLYTEYTLQLSGPKNLTWQKQCKDIYCDYLDFGINLTPESPESNFTAKVTAVNSLGSSSSLPSTFTFLDIV  222
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Sbjct 149  RDTHLYTEYTLQLSGPKNLTWQKQCKDIYCDYLDFGINLTPESPESNFTAKVTAVNSLGSSSSLPSTFTFLDIV  222

Query 223  RPLPPWDIRIKFQKASVSRCTLYWRDEGLVLLNRLRYRPSNSRLWNMVNVTKAKGRHDLLDLKPFTEYEFQISS  296
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Sbjct 223  RPLPPWDIRIKFQKASVSRCTLYWRDEGLVLLNRLRYRPSNSRLWNMVNVTKAKGRHDLLDLKPFTEYEFQISS  296

Query 297  KLHLYKGSWSDWSESLRAQTPEEEPTGMLDVWYMKRHIDYSRQQISLFWKNLSVSEARGKILHYQVTLQELTGG  370
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Sbjct 297  KLHLYKGSWSDWSESLRAQTPEEEPTGMLDVWYMKRHIDYSRQQISLFWKNLSVSEARGKILHYQVTLQELTGG  370

Query 371  KAMTQNITGHTSWTTVIPRTGNWAVAVSAANSKGSSLPTRINIMNLCEAGLLAPRHVSANSEGMDNILVTWQPP  444
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Sbjct 371  KAMTQNITGHTSWTTVIPRTGNWAVAVSAANSKGSSLPTRINIMNLCEAGLLAPRQVSANSEGMDNILVTWQPP  444

Query 445  RKDPSAVQEYVVEWRELHPGGDTQVPLNWLRSRPYNVSALISENIKSYICYEIRVYALSGDQGGCSSILGNSKH  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct 445  RKDPSAVQEYVVEWRELHPGGDTQVPLNWLRSRPYNVSALIS--------------------------------  486

Query 519  KAPLSGPHINAITEEKGSILISWNSIPVQEQMGCLLHYRIYWKERDSNSQPQLCEIPYRVSQNSHPINSLQPRV  592
                                                                 ||||||||||||||||||||
Sbjct 487  ------------------------------------------------------EIPYRVSQNSHPINSLQPRV  506

Query 593  TYVLWMTALTAAGESSHGNEREFCLQGKANWMAFVAPSICIAIIMVGIFSTHYFQQKVFVLLAALRPQWCSREI  666
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Sbjct 507  TYVLWMTALTAAGESSHGNEREFCLQGKANWMAFVAPSICIAIIMVGIFSTHYFQQKVFVLLAALRPQWCSREI  580

Query 667  PDPANSTCAKKYPIAEEKTQLPLDRLLIDWPTPEDPEPLVISEVLHQVTPVFRHPPCSNWPQREKGIQGHQASE  740
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Sbjct 581  PDPANSTCAKKYPIAEEKTQLPLDRLLIDWPTPEDPEPLVISEVLHQVTPVFRHPPCSNWPQREKGIQGHQASE  654

Query 741  KDMMHSASSPPPPRALQAESRQLVDLYKVLESRGSDPKPENPACPWTVLPAGDLPTHDGYLPSNIDDLPSHEAP  814
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Sbjct 655  KDMMHSASSPPPPRALQAESRQLVDLYKVLESRGSDPKPENPACPWTVLPAGDLPTHDGYLPSNIDDLPSHEAP  728

Query 815  LADSLEELEPQHISLSVFPSSSLHPLTFSCGDKLTLDQLKMRCDSLML  862
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Sbjct 729  LADSLEELEPQHISLSVFPSSSLHPLTFSCGDKLTLDQLKMRCDSLML  776