Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06446
• Subject: XM_011541384.2
• Aligned Length: 2586
• Identities: 2424
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGCACATACTTTTAGAGGATGCTCATTGGCATTTATGTTTATAATCACGTGGCTGTTGATTAAAGCAAAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCACATACTTTTAGAGGATGCTCATTGGCATTTATGTTTATAATCACGTGGCTGTTGATTAAAGCAAAAAT  74

Query   75  AGATGCGTGCAAGAGAGGCGATGTGACTGTGAAGCCTTCCCATGTAATTTTACTTGGATCCACTGTCAATATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATGCGTGCAAGAGAGGCGATGTGACTGTGAAGCCTTCCCATGTAATTTTACTTGGATCCACTGTCAATATTA  148

Query  149  CATGCTCTTTGAAGCCCAGACAAGGCTGCTTTCACTATTCCAGACGTAACAAGTTAATCCTGTACAAGTTTGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CATGCTCTTTGAAGCCCAGACAAGGCTGCTTTCACTATTCCAGACGTAACAAGTTAATCCTGTACAAGTTTGAC  222

Query  223  AGAAGAATCAATTTTCACCATGGCCACTCCCTCAATTCTCAAGTCACAGGTCTTCCCCTTGGTACAACCTTGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAGAATCAATTTTCACCATGGCCACTCCCTCAATTCTCAAGTCACAGGTCTTCCCCTTGGTACAACCTTGTT  296

Query  297  TGTCTGCAAACTGGCCTGTATCAATAGTGATGAAATTCAAATATGTGGAGCAGAGATCTTCGTTGGTGTTGCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTCTGCAAACTGGCCTGTATCAATAGTGATGAAATTCAAATATGTGGAGCAGAGATCTTCGTTGGTGTTGCTC  370

Query  371  CAGAACAGCCTCAAAATTTATCCTGCATACAGAAGGGAGAACAGGGGACTGTGGCCTGCACCTGGGAAAGAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAACAGCCTCAAAATTTATCCTGCATACAGAAGGGAGAACAGGGGACTGTGGCCTGCACCTGGGAAAGAGGA  444

Query  445  CGAGACACCCACTTATACACTGAGTATACTCTACAGCTAAGTGGACCAAAAAATTTAACCTGGCAGAAGCAATG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGAGACACCCACTTATACACTGAGTATACTCTACAGCTAAGTGGACCAAAAAATTTAACCTGGCAGAAGCAATG  518

Query  519  TAAAGACATTTATTGTGACTATTTGGACTTTGGAATCAACCTCACCCCTGAATCACCTGAATCCAATTTCACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAAGACATTTATTGTGACTATTTGGACTTTGGAATCAACCTCACCCCTGAATCACCTGAATCCAATTTCACAG  592

Query  593  CCAAGGTTACTGCTGTCAATAGTCTTGGAAGCTCCTCTTCACTTCCATCCACATTCACATTCTTGGACATAGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAAGGTTACTGCTGTCAATAGTCTTGGAAGCTCCTCTTCACTTCCATCCACATTCACATTCTTGGACATAGTG  666

Query  667  AGGCCTCTTCCTCCGTGGGACATTAGAATCAAATTTCAAAAGGCTTCCGTGAGCAGATGTACCCTTTATTGGAG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGCCTCTTCCTCCGTGGGACATTAGAATCAAATTTCAAAAGGCTTCTGTGAGCAGATGTACCCTTTATTGGAG  740

Query  741  AGATGAGGGACTGGTACTGCTTAATCGACTCAGATATCGGCCCAGTAACAGCAGGCTCTGGAATATGGTTAATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGATGAGGGACTGGTACTGCTTAATCGACTCAGATATCGGCCCAGTAACAGCAGGCTCTGGAATATGGTTAATG  814

Query  815  TTACAAAGGCCAAAGGAAGACATGATTTGCTGGATCTGAAACCATTTACAGAATATGAATTTCAGATTTCCTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTACAAAGGCCAAAGGAAGACATGATTTGCTGGATCTGAAACCATTTACAGAATATGAATTTCAGATTTCCTCT  888

Query  889  AAGCTACATCTTTATAAGGGAAGTTGGAGTGATTGGAGTGAATCATTGAGAGCACAAACACCAGAAGAAGAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCTACATCTTTATAAGGGAAGTTGGAGTGATTGGAGTGAATCATTGAGAGCACAAACACCAGAAGAAGAGCC  962

Query  963  TACTGGGATGTTAGATGTCTGGTACATGAAACGGCACATTGACTACAGTAGACAACAGATTTCTCTTTTCTGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACTGGGATGTTAGATGTCTGGTACATGAAACGGCACATTGACTACAGTAGACAACAGATTTCTCTTTTCTGGA  1036

Query 1037  AGAATCTGAGTGTCTCAGAGGCAAGAGGAAAAATTCTCCACTATCAGGTGACCTTGCAGGAGCTGACAGGAGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATCTGAGTGTCTCAGAGGCAAGAGGAAAAATTCTCCACTATCAGGTGACCTTGCAGGAGCTGACAGGAGGG  1110

Query 1111  AAAGCCATGACACAGAACATCACAGGACACACCTCCTGGACCACAGTCATTCCTAGAACCGGAAATTGGGCTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCCATGACACAGAACATCACAGGACACACCTCCTGGACCACAGTCATTCCTAGAACCGGAAATTGGGCTGT  1184

Query 1185  GGCTGTGTCTGCAGCAAATTCAAAAGGCAGTTCTCTGCCCACTCGTATTAACATAATGAACCTGTGTGAGGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTGTGTCTGCAGCAAATTCAAAAGGCAGTTCTCTGCCCACTCGTATTAACATAATGAACCTGTGTGAGGCAG  1258

Query 1259  GGTTGCTGGCTCCTCGCCACGTCTCTGCAAACTCAGAGGGCATGGACAACATTCTGGTGACTTGGCAGCCTCCC  1332
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTTGCTGGCTCCTCGCCAGGTCTCTGCAAACTCAGAGGGCATGGACAACATTCTGGTGACTTGGCAGCCTCCC  1332

Query 1333  AGGAAAGATCCCTCTGCTGTTCAGGAGTACGTGGTGGAATGGAGAGAGCTCCATCCAGGGGGTGACACACAGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGAAAGATCCCTCTGCTGTTCAGGAGTACGTGGTGGAATGGAGAGAGCTCCATCCAGGGGGTGACACACAGGT  1406

Query 1407  CCCTCTAAACTGGCTACGGAGTCGACCCTACAATGTGTCTGCTCTGATTTCAGAGAACATAAAATCCTACATCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCTCTAAACTGGCTACGGAGTCGACCCTACAATGTGTCTGCTCTGATTTCAGAGAACATAAAATCCTACATCT  1480

Query 1481  GTTATGAAATCCGTGTGTATGCACTCTCAGGGGATCAAGGAGGATGCAGCTCCATCCTGGGTAACTCTAAGCAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTATGAAATCCGTGTGTATGCACTCTCAGGGGATCAAGGAGGATGCAGCTCCATCCTGGGTAACTCTAAGCAC  1554

Query 1555  AAAGCACCACTGAGTGGCCCCCACATTAATGCCATCACAGAGGAAAAGGGGAGCATTTTAATTTCATGGAACAG  1628
            |||                                                                       
Sbjct 1555  AAA-----------------------------------------------------------------------  1557

Query 1629  CATTCCAGTCCAGGAGCAAATGGGCTGCCTCCTCCATTATAGGATATACTGGAAGGAACGGGACTCCAACTCCC  1702
                                                                                      
Sbjct 1558  --------------------------------------------------------------------------  1557

Query 1703  AGCCTCAGCTCTGTGAAATTCCCTACAGAGTCTCCCAAAATTCACATCCAATAAACAGCCTGCAGCCCCGAGTG  1776
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558  --------------GAAATTCCCTACAGAGTCTCCCAAAATTCACATCCAATAAACAGCCTGCAGCCCCGAGTG  1617

Query 1777  ACATATGTCCTGTGGATGACAGCTCTGACAGCTGCTGGTGAAAGTTCCCACGGAAATGAGAGGGAATTTTGTCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  ACATATGTCCTGTGGATGACAGCTCTGACAGCTGCTGGTGAAAGTTCCCACGGAAATGAGAGGGAATTTTGTCT  1691

Query 1851  GCAAGGTAAAGCCAATTGGATGGCGTTTGTGGCACCAAGCATTTGCATTGCTATCATCATGGTGGGCATTTTCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692  GCAAGGTAAAGCCAATTGGATGGCGTTTGTGGCACCAAGCATTTGCATTGCTATCATCATGGTGGGCATTTTCT  1765

Query 1925  CAACGCATTACTTCCAGCAAAAGGTGTTTGTTCTCCTAGCAGCCCTCAGACCTCAGTGGTGTAGCAGAGAAATT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  CAACGCATTACTTCCAGCAAAAGGTGTTTGTTCTCCTAGCAGCCCTCAGACCTCAGTGGTGTAGCAGAGAAATT  1839

Query 1999  CCAGATCCAGCAAATAGCACTTGCGCTAAGAAATATCCCATTGCAGAGGAGAAGACACAGCTGCCCTTGGACAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  CCAGATCCAGCAAATAGCACTTGCGCTAAGAAATATCCCATTGCAGAGGAGAAGACACAGCTGCCCTTGGACAG  1913

Query 2073  GCTCCTGATAGACTGGCCCACGCCTGAAGATCCTGAACCGCTGGTCATCAGTGAAGTCCTTCATCAAGTGACCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914  GCTCCTGATAGACTGGCCCACGCCTGAAGATCCTGAACCGCTGGTCATCAGTGAAGTCCTTCATCAAGTGACCC  1987

Query 2147  CAGTTTTCAGACATCCCCCCTGCTCCAACTGGCCACAAAGGGAAAAAGGAATCCAAGGTCATCAGGCCTCTGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988  CAGTTTTCAGACATCCCCCCTGCTCCAACTGGCCACAAAGGGAAAAAGGAATCCAAGGTCATCAGGCCTCTGAG  2061

Query 2221  AAAGACATGATGCACAGTGCCTCAAGCCCACCACCTCCAAGAGCTCTCCAAGCTGAGAGCAGACAACTGGTGGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062  AAAGACATGATGCACAGTGCCTCAAGCCCACCACCTCCAAGAGCTCTCCAAGCTGAGAGCAGACAACTGGTGGA  2135

Query 2295  TCTGTACAAGGTGCTGGAGAGCAGGGGCTCCGACCCAAAGCCAGAAAACCCAGCCTGTCCCTGGACGGTGCTCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136  TCTGTACAAGGTGCTGGAGAGCAGGGGCTCCGACCCAAAGCCCGAAAACCCAGCCTGTCCCTGGACGGTGCTCC  2209

Query 2369  CAGCAGGTGACCTTCCCACCCATGATGGCTACTTACCCTCCAACATAGATGACCTCCCCTCACATGAGGCACCT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210  CAGCAGGTGACCTTCCCACCCATGATGGCTACTTACCCTCCAACATAGATGACCTCCCCTCACATGAGGCACCT  2283

Query 2443  CTCGCTGACTCTCTGGAAGAACTGGAGCCTCAGCACATCTCCCTTTCTGTTTTCCCCTCAAGTTCTCTTCACCC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2284  CTCGCTGACTCTCTGGAAGAACTGGAGCCTCAGCACATCTCCCTTTCTGTTTTCCCCTCAAGTTCTCTTCACCC  2357

Query 2517  ACTCACCTTCTCCTGTGGTGATAAGCTGACTCTGGATCAGTTAAAGATGAGGTGTGACTCCCTCATGCTC  2586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2358  ACTCACCTTCTCCTGTGGTGATAAGCTGACTCTGGATCAGTTAAAGATGAGGTGTGACTCCCTCATGCTC  2427