Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06462
• Subject: XM_011523825.3
• Aligned Length: 3651
• Identities: 3437
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGTGGCTCTTCCACACTCTGCT  23
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGTCGCACTCGCCTCGGCTCCCACACAGCCGCCTCTGCTCCAGCAAGGATGTGGCTCTTCCACACTCTGCT  74

Query   24  CTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCGGCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAG  97
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCGGCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAG  148

Query   98  GTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACCAGACCTGGCTCCTGGTCACCAGC  171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACCAGACCTGGCTCCTGGTCACCAGC  222

Query  172  CCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAGGATGAAATCCTTTGCCATCCTGT  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAGGATGAAATCCTTTGCCATCCTGT  296

Query  246  AGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCGGAGCCACCACGGTGTTTTGATAT  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCGGAGCCACCACGGTGTTTTGATAT  370

Query  320  GCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAGGCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCT  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAGGCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCT  444

Query  394  GACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTGGATCCAGATGCACGTGTGGACAC  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTGGATCCAGATGCACGTGTGGACAC  518

Query  468  TGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACACAGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGG  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACACAGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGG  592

Query  542  AGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAAGCTGGCACCGAGATTGCCATC  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAAGCTGGCACCGAGATTGCCATC  666

Query  616  ATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAAGACTTCATCTCCAACATGATGAG  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAAGACTTCATCTCCAACATGATGAG  740

Query  690  GAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGGAGGAGTGATCCAGACTGAGTTTG  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGGAGGAGTGATCCAGACTGAGTTTG  814

Query  764  ACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACATCACTCAAGTGGGGAGTGTCACC  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACATCACTCAAGTGGGGAGTGTCACC  888

Query  838  AAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGCCACGGCTCCAGGAGAAAGGCATC  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGCCACGGCTCCAGGAGAAAGGCATC  962

Query  912  CAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAACCTTACGACAGTCATCAACTCCC  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAACCTTACGACAGTCATCAACTCCC  1036

Query  986  CCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTAAGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAA  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTAAGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAA  1110

Query 1060  CTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACCAACTACATGGCGCTGGATGGGCT  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACCAACTACATGGCGCTGGATGGGCT  1184

Query 1134  GCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGACGCCCTTCACTACCAGCTGGCAC  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGACGCCCTTCACTACCAGCTGGCAC  1258

Query 1208  AGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCGCCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCC  1281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCGCCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCC  1332

Query 1282  GGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAACCAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGA  1355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAACCAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGA  1406

Query 1356  CGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCACAAGACCTGCAGCCTCTCCTACG  1429
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1407  CGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCACAAGACCTGCAGCCTCTCCTACA  1480

Query 1430  TCGCGGGGGCTCCACAGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGAAGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTC  1503
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCGCGGGGGCTCCACGGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGAAGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTC  1554

Query 1504  CTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTGTGCCCTGTGGACATTGACATGGA  1577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTGTGCCCTGTGGACATTGACATGGA  1628

Query 1578  TGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGGAGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGT  1651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGGAGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGT  1702

Query 1652  ACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTGGGCACCCCGGGTTCACCAATGCC  1725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTGGGCACCCCGGGTTCACCAATGCC  1776

Query 1726  CGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTCACAGATGTGGCCATCGGGGCCCC  1799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTCACAGATGTGGCCATCGGGGCCCC  1850

Query 1800  CCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATATCTACAATGGACACTGGGACGGCC  1873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATATCTACAATGGACACTGGGACGGCC  1924

Query 1874  TCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGACTCCAGTACTTCGGCATGTCCATG  1947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGACTCCAGTACTTCGGCATGTCCATG  1998

Query 1948  GCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGCACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTT  2021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGCACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTT  2072

Query 2022  CCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAGCGCACTGCCCATCGGCTTCAACG  2095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAGCGCACTGCCCATCGGCTTCAACG  2146

Query 2096  GCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCTCTGAGTCAGGCCTCCGTGAGGCA  2169
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147  GCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCTCTGAGTCAGGCCTCCGCGAGGCA  2220

Query 2170  CTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTGCAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTG  2243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTGCAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTG  2294

Query 2244  TCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCTCCTGCTCATGCCCACAGAGGGAG  2317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCTCCTGCTCATGCCCACAGAGGGAG  2368

Query 2318  AGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACCAGCTCCAGACCCCTGAGGGACAG  2391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACCAGCTCCAGACCCCTGAGGGACAG  2442

Query 2392  ACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATCTTCCAGCTGCCCTATGAGAAGGC  2465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATCTTCCAGCTGCCCTATGAGAAGGC  2516

Query 2466  CTGCAAGAATAAGCTGTTTTGTGTCGCAGAATTACAGTTGGCCACCACCGTCTCTCAGCAGGAGTTGGTGGTGG  2539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CTGCAAGAATAAGCTGTTTTGTGTCGCAGAATTACAGTTGGCCACCACCGTCTCTCAGCAGGAGTTGGTGGTGG  2590

Query 2540  GTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACATTAACCTAACTAACTCCGGGGAAGATTCCTACATGACAAGCATGGCC  2613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACATTAACCTAACTAACTCCGGGGAAGATTCCTACATGACAAGCATGGCC  2664

Query 2614  TTGAATTACCCCAGAAACCTGCAGTTGAAGAGGATGCAAAAGCCTCCCTCTCCAAACATTCAGTGTGATGACCC  2687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TTGAATTACCCCAGAAACCTGCAGTTGAAGAGGATGCAAAAGCCTCCCTCTCCAAACATTCAGTGTGATGACCC  2738

Query 2688  TCAGCCGGTTGCTTCTGTCCTGATCATGAACTGCAGGATTGGTCACCCCGTCCTCAAGAGGTCATCT-------  2754
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 2739  TCAGCCGGTTGCTTCTGTCCTGATCATGAACTGCAGGATTGGTCACCCCGTCCTCAAGAGGTCATCTGTGAGTC  2812

Query 2755  --------------------------------------------------------GCTCATGTTTCAGTCGTT  2772
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GGTTTGGACTGATTCGCTCTTCTCACCACCCTGCAGTTGGCGTCTTCTGCATCTTGGCTCATGTTTCAGTCGTT  2886

Query 2773  TGGCAGCTAGAGGAGAATGCCTTTCCAAACAGGACAGCAGACATCACTGTGACTGTCACCAATTCCAATGAAAG  2846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TGGCAGCTAGAGGAGAATGCCTTTCCAAACAGGACAGCAGACATCACTGTGACTGTCACCAATTCCAATGAAAG  2960

Query 2847  ACGGTCTTTGGCCAACGAGACCCACACCCTTCAATTCAGGCATGGCTTCGTTGCAGTTCTGTCCAAACCATCCA  2920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  ACGGTCTTTGGCCAACGAGACCCACACCCTTCAATTCAGGCATGGCTTCGTTGCAGTTCTGTCCAAACCATCCA  3034

Query 2921  TAATGTACGTGAACACAGGCCAGGGGCTTTCTCACCACAAAGAATTCCTCTTCCATGTACATGGGGAGAACCTC  2994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TAATGTACGTGAACACAGGCCAGGGGCTTTCTCACCACAAAGAATTCCTCTTCCATGTACATGGGGAGAACCTC  3108

Query 2995  TTTGGAGCAGAATACCAGTTGCAAATTTGCGTCCCAACCAAATTACGAGGTCTCCAGGTTGCAGCAGTGAAGAA  3068
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 3109  TTTGGAGCAGAATACCAGTTGCAAATTTGCGTCCCAACCAAATTACGAGGTCTCCAGGTTGTAGCAGTGAAGAA  3182

Query 3069  GCTGACGAGGACTCAGGCCTCCACGGTGTGCACCTGGAGTCAGGAGCGCGCTTGTGCGTACAGTTCGGTTCAGC  3142
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 3183  GCTGACGAGGACTCAGGCCTCCACGGTGTGCACCTGGAGTCAGGAGCGCGCTTGTGCGTACAGTTCGGTTC---  3253

Query 3143  ATGTGGAAGAATGGCATTCAGTGAGCTGTGTCATCGCTTCAGATAAAGAAAATGTCACCGTGGCTGCAGAGATC  3216
                                                                                      
Sbjct 3254  --------------------------------------------------------------------------  3253

Query 3217  TCCTGGGATCACTCTGAGGAGTTACTAAAAGATGTAACTGAACTGCAGATCCTTGGTGAAATATCTTTCAACAA  3290
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3254  -------------------AGTTACTAAAAGATGTAACTGAACTGCAGATCCTTGGTGAAATATCTTTCAACAA  3308

Query 3291  ATCTCTATATGAGGGACTGAATGCAGAGAACCACAGAACTAAGATCACTGTCGTCTTCCTGAAAGATGAGAAGT  3364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3309  ATCTCTATATGAGGGACTGAATGCAGAGAACCACAGAACTAAGATCACTGTCGTCTTCCTGAAAGATGAGAAGT  3382

Query 3365  ACCATTCTTTGCCTATCATCATTAAAGGCAGCGTTGGTGGACTTCTGGTGTTGATCGTGATTCTGGTCATCCTG  3438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3383  ACCATTCTTTGCCTATCATCATTAAAGGCAGCGTTGGTGGACTTCTGGTGTTGATCGTGATTCTGGTCATCCTG  3456

Query 3439  TTCAAGTGTGGCTTTTTTAAAAGAAAATATCAACAACTGAACTTGGAGAGCATCAGGAAGGCCCAGCTGAAATC  3512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3457  TTCAAGTGTGGCTTTTTTAAAAGAAAATATCAACAACTGAACTTGGAGAGCATCAGGAAGGCCCAGCTGAAATC  3530

Query 3513  AGAGAATCTGCTCGAAGAAGAGAAT  3537
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3531  AGAGAATCTGCTCGAAGAAGAGAAT  3555