Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06462
• Subject: XM_011523827.3
• Aligned Length: 3588
• Identities: 3434
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGTGGCTCTTCCACACTCTGCT  23
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGTCGCACTCGCCTCGGCTCCCACACAGCCGCCTCTGCTCCAGCAAGGATGTGGCTCTTCCACACTCTGCT  74

Query   24  CTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCGGCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAG  97
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCGGCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAG  148

Query   98  GTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACCAGACCTGGCTCCTGGTCACCAGC  171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACCAGACCTGGCTCCTGGTCACCAGC  222

Query  172  CCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAGGATGAAATCCTTTGCCATCCTGT  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAGGATGAAATCCTTTGCCATCCTGT  296

Query  246  AGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCGGAGCCACCACGGTGTTTTGATAT  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCGGAGCCACCACGGTGTTTTGATAT  370

Query  320  GCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAGGCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCT  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAGGCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCT  444

Query  394  GACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTGGATCCAGATGCACGTGTGGACAC  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTGGATCCAGATGCACGTGTGGACAC  518

Query  468  TGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACACAGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGG  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACACAGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGG  592

Query  542  AGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAAGCTGGCACCGAGATTGCCATC  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAAGCTGGCACCGAGATTGCCATC  666

Query  616  ATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAAGACTTCATCTCCAACATGATGAG  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAAGACTTCATCTCCAACATGATGAG  740

Query  690  GAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGGAGGAGTGATCCAGACTGAGTTTG  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGGAGGAGTGATCCAGACTGAGTTTG  814

Query  764  ACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACATCACTCAAGTGGGGAGTGTCACC  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACATCACTCAAGTGGGGAGTGTCACC  888

Query  838  AAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGCCACGGCTCCAGGAGAAAGGCATC  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGCCACGGCTCCAGGAGAAAGGCATC  962

Query  912  CAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAACCTTACGACAGTCATCAACTCCC  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAACCTTACGACAGTCATCAACTCCC  1036

Query  986  CCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTAAGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAA  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTAAGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAA  1110

Query 1060  CTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACCAACTACATGGCGCTGGATGGGCT  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACCAACTACATGGCGCTGGATGGGCT  1184

Query 1134  GCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGACGCCCTTCACTACCAGCTGGCAC  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGACGCCCTTCACTACCAGCTGGCAC  1258

Query 1208  AGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCGCCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCC  1281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCGCCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCC  1332

Query 1282  GGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAACCAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGA  1355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAACCAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGA  1406

Query 1356  CGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCACAAGACCTGCAGCCTCTCCTACG  1429
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1407  CGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCACAAGACCTGCAGCCTCTCCTACA  1480

Query 1430  TCGCGGGGGCTCCACAGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGAAGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTC  1503
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCGCGGGGGCTCCACGGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGAAGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTC  1554

Query 1504  CTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTGTGCCCTGTGGACATTGACATGGA  1577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTGTGCCCTGTGGACATTGACATGGA  1628

Query 1578  TGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGGAGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGT  1651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGGAGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGT  1702

Query 1652  ACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTGGGCACCCCGGGTTCACCAATGCC  1725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTGGGCACCCCGGGTTCACCAATGCC  1776

Query 1726  CGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTCACAGATGTGGCCATCGGGGCCCC  1799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTCACAGATGTGGCCATCGGGGCCCC  1850

Query 1800  CCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATATCTACAATGGACACTGGGACGGCC  1873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATATCTACAATGGACACTGGGACGGCC  1924

Query 1874  TCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGACTCCAGTACTTCGGCATGTCCATG  1947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGACTCCAGTACTTCGGCATGTCCATG  1998

Query 1948  GCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGCACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTT  2021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGCACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTT  2072

Query 2022  CCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAGCGCACTGCCCATCGGCTTCAACG  2095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAGCGCACTGCCCATCGGCTTCAACG  2146

Query 2096  GCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCTCTGAGTCAGGCCTCCGTGAGGCA  2169
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147  GCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCTCTGAGTCAGGCCTCCGCGAGGCA  2220

Query 2170  CTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTGCAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTG  2243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTGCAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTG  2294

Query 2244  TCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCTCCTGCTCATGCCCACAGAGGGAG  2317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCTCCTGCTCATGCCCACAGAGGGAG  2368

Query 2318  AGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACCAGCTCCAGACCCCTGAGGGACAG  2391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACCAGCTCCAGACCCCTGAGGGACAG  2442

Query 2392  ACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATCTTCCAGCTGCCCTATGAGAAGGC  2465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATCTTCCAGCTGCCCTATGAGAAGGC  2516

Query 2466  CTGCAAGAATAAGCTGTTTTGTGTCGCAGAATTACAGTTGGCCACCACCGTCTCTCAGCAGGAGTTGGTGGTGG  2539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CTGCAAGAATAAGCTGTTTTGTGTCGCAGAATTACAGTTGGCCACCACCGTCTCTCAGCAGGAGTTGGTGGTGG  2590

Query 2540  GTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACATTAACCTAACTAACTCCGGGGAAGATTCCTACATGACAAGCATGGCC  2613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACATTAACCTAACTAACTCCGGGGAAGATTCCTACATGACAAGCATGGCC  2664

Query 2614  TTGAATTACCCCAGAAACCTGCAGTTGAAGAGGATGCAAAAGCCTCCCTCTCCAAACATTCAGTGTGATGACCC  2687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct 2665  TTGAATTACCCCAGAAACCTGCAGTTGAAGAGGATGCAAAAG--------------------------------  2706

Query 2688  TCAGCCGGTTGCTTCTGTCCTGATCATGAACTGCAGGATTGGTCACCCCGTCCTCAAGAGGTCATCTGCTCATG  2761
                                                                               |||||||
Sbjct 2707  -------------------------------------------------------------------GCTCATG  2713

Query 2762  TTTCAGTCGTTTGGCAGCTAGAGGAGAATGCCTTTCCAAACAGGACAGCAGACATCACTGTGACTGTCACCAAT  2835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2714  TTTCAGTCGTTTGGCAGCTAGAGGAGAATGCCTTTCCAAACAGGACAGCAGACATCACTGTGACTGTCACCAAT  2787

Query 2836  TCCAATGAAAGACGGTCTTTGGCCAACGAGACCCACACCCTTCAATTCAGGCATGGCTTCGTTGCAGTTCTGTC  2909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2788  TCCAATGAAAGACGGTCTTTGGCCAACGAGACCCACACCCTTCAATTCAGGCATGGCTTCGTTGCAGTTCTGTC  2861

Query 2910  CAAACCATCCATAATGTACGTGAACACAGGCCAGGGGCTTTCTCACCACAAAGAATTCCTCTTCCATGTACATG  2983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862  CAAACCATCCATAATGTACGTGAACACAGGCCAGGGGCTTTCTCACCACAAAGAATTCCTCTTCCATGTACATG  2935

Query 2984  GGGAGAACCTCTTTGGAGCAGAATACCAGTTGCAAATTTGCGTCCCAACCAAATTACGAGGTCTCCAGGTTGCA  3057
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2936  GGGAGAACCTCTTTGGAGCAGAATACCAGTTGCAAATTTGCGTCCCAACCAAATTACGAGGTCTCCAGGTTGTA  3009

Query 3058  GCAGTGAAGAAGCTGACGAGGACTCAGGCCTCCACGGTGTGCACCTGGAGTCAGGAGCGCGCTTGTGCGTACAG  3131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010  GCAGTGAAGAAGCTGACGAGGACTCAGGCCTCCACGGTGTGCACCTGGAGTCAGGAGCGCGCTTGTGCGTACAG  3083

Query 3132  TTCGGTTCAGCATGTGGAAGAATGGCATTCAGTGAGCTGTGTCATCGCTTCAGATAAAGAAAATGTCACCGTGG  3205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3084  TTCGGTTCAGCATGTGGAAGAATGGCATTCAGTGAGCTGTGTCATCGCTTCAGATAAAGAAAATGTCACCGTGG  3157

Query 3206  CTGCAGAGATCTCCTGGGATCACTCTGAGGAGTTACTAAAAGATGTAACTGAACTGCAGATCCTTGGTGAAATA  3279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3158  CTGCAGAGATCTCCTGGGATCACTCTGAGGAGTTACTAAAAGATGTAACTGAACTGCAGATCCTTGGTGAAATA  3231

Query 3280  TCTTTCAACAAATCTCTATATGAGGGACTGAATGCAGAGAACCACAGAACTAAGATCACTGTCGTCTTCCTGAA  3353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3232  TCTTTCAACAAATCTCTATATGAGGGACTGAATGCAGAGAACCACAGAACTAAGATCACTGTCGTCTTCCTGAA  3305

Query 3354  AGATGAGAAGTACCATTCTTTGCCTATCATCATTAAAGGCAGCGTTGGTGGACTTCTGGTGTTGATCGTGATTC  3427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3306  AGATGAGAAGTACCATTCTTTGCCTATCATCATTAAAGGCAGCGTTGGTGGACTTCTGGTGTTGATCGTGATTC  3379

Query 3428  TGGTCATCCTGTTCAAGTGTGGCTTTTTTAAAAGAAAATATCAACAACTGAACTTGGAGAGCATCAGGAAGGCC  3501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3380  TGGTCATCCTGTTCAAGTGTGGCTTTTTTAAAAGAAAATATCAACAACTGAACTTGGAGAGCATCAGGAAGGCC  3453

Query 3502  CAGCTGAAATCAGAGAATCTGCTCGAAGAAGAGAAT  3537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3454  CAGCTGAAATCAGAGAATCTGCTCGAAGAAGAGAAT  3489