Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06466
• Subject: XM_006532316.1
• Aligned Length: 2235
• Identities: 2003
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGATGAACCTGATGGAGCAGCCTATCAAGGTGACTGAGTGGCAGCAGACATACACCTACGACTCGGG  74
            |||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGATGAACCTTATTGAGCAGCCCATCAAGGTGACAGAGTGGCAACAGACATACACCTACGACTCGGG  74

Query   75  TATCCACTCGGGCGCCAACACCTGCGTGCCCTCCGTCAGCAGCAAGGGCATCATGGAGGAGGATGAGGCCTGCG  148
            .||||||||.||||.|||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct   75  CATCCACTCCGGCGTCAATACCTGTGTGCCCTCTGTAAGCAGCAAGGGCATCATGGATGAGGATGATGCCTGCG  148

Query  149  GGCGCCAGTACACGCTCAAGAAAACCACCACTTACACCCAGGGGGTGCCCCCCAGCCAAGGTGACCTGGAGTAC  222
            |..|.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|..|.|||||||||||||||.|||
Sbjct  149  GCAGACAGTACACACTCAAGAAGACTACCACCTATACACAAGGGGTGCCACAGAACCAAGGTGACCTGGAATAC  222

Query  223  CAGATGTCCACAACAGCCAGGGCCAAACGGGTGCGGGAGGCCATGTGCCCTGGTGTGTCAGGCGAGGACAGCTC  296
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGATGTCCACAACGGCCAGAGCCAAGCGGGTGCGGGAGGCCATGTGTCCAGGGGTCTCAGGCGAGGACAGTTC  296

Query  297  GCTTCTGCTGGCCACCCAGGTGGAGGGGCAGGCCACCAACCTGCAGCGACTGGCCGAGCCGTCCCAGCTGCTCA  370
            .||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||.||||||
Sbjct  297  TCTACTGCTGGCCACCCAGGTGGAGGGGCAGACAACCAATCTGCAGCGCCTGGCCGAACCATCCCAGTTGCTCA  370

Query  371  AGTCGGCCATTGTGCATCTCATCAACTACCAGGATGATGCCGAGCTGGCCACTCGCGCCCTGCCCGAGCTCACC  444
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  AGTCGGCCATCGTCCATCTCATCAACTACCAGGATGATGCAGAGCTGGCCACCCGGGCTCTGCCTGAGCTCACC  444

Query  445  AAACTGCTCAACGACGAGGACCCGGTGGTGGTGACCAAGGCGGCCATGATTGTGAACCAGCTGTCGAAGAAGGA  518
            ||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  AAGCTGCTCAACGATGAGGACCCGGTAGTGGTGACCAAGGCGGCTATGATCGTGAACCAGCTGTCCAAGAAGGA  518

Query  519  GGCGTCGCGGCGGGCCCTGATGGGCTCGCCCCAGCTGGTGGCCGCTGTCGTGCGTACCATGCAGAATACCAGCG  592
            |||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct  519  GGCATCCCGCCGGGCTCTAATGGGCTCGCCCCAGCTGGTGGCGGCGGTGGTGCGGACTATGCAGAACACCAGTG  592

Query  593  ACCTGGACACAGCCCGCTGCACCACCAGCATCCTGCACAACCTCTCCCACCACCGGGAGGGGCTGCTCGCCATC  666
            |||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||.
Sbjct  593  ACCTGGATACTGCCCGGTGTACCACCAGCATCCTGCACAACCTCTCTCACCACCGAGAGGGCTTGCTCGCCATA  666

Query  667  TTCAAGTCGGGTGGCATCCCTGCTCTGGTCCGCATGCTCAGCTCCCCTGTGGAGTCGGTCCTGTTCTATGCCAT  740
            ||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  TTCAAGTCTGGAGGCATCCCTGCCCTAGTCCGAATGCTCAGTTCCCCCGTAGAATCTGTCCTGTTCTACGCCAT  740

Query  741  CACCACGCTGCACAACCTGCTCCTGTACCAGGAGGGCGCCAAGATGGCCGTGCGCCTGGCCGACGGGCTGCAAA  814
            ||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  741  CACCACACTGCACAACCTGCTGCTCTATCAGGAGGGCGCCAAGATGGCGGTGCGTCTGGCAGACGGGCTGCAGA  814

Query  815  AGATGGTGCCCCTGCTCAACAAGAACAACCCCAAGTTCCTGGCCATCACCACCGACTGCCTGCAGCTCCTGGCC  888
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGATGGTGCCCCTACTCAACAAGAACAACCCTAAGTTCCTGGCCATCACTACTGACTGCCTGCAGCTCCTGGCC  888

Query  889  TACGGCAACCAGGAGAGCAAGCTGATCATCCTGGCCAATGGTGGGCCCCAGGCCCTCGTGCAGATCATGCGTAA  962
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|..||.||||||||||||.|.||
Sbjct  889  TATGGCAACCAGGAGAGCAAGCTGATCATCCTGGCCAATGGGGGACCCCAAGGGCTTGTGCAGATCATGAGGAA  962

Query  963  CTACAGTTATGAAAAGCTGCTCTGGACCACCAGTCGTGTGCTCAAGGTGCTATCCGTGTGTCCCAGCAATAAGC  1036
            ||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  963  CTACAGCTACGAGAAGCTTCTGTGGACCACCAGCCGTGTGCTCAAGGTGCTCTCCGTGTGTCCTAGCAACAAGC  1036

Query 1037  CTGCCATTGTGGAGGCTGGTGGGATGCAGGCCCTGGGCAAGCACCTGACCAGCAACAGCCCCCGCCTGGTGCAG  1110
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGCCATCGTGGAGGCTGGTGGGATGCAGGCTCTGGGCAAGCACTTGACAAGCAACAGTCCCCGCCTGGTGCAG  1110

Query 1111  AACTGCCTGTGGACCCTGCGCAACCTCTCAGATGTGGCCACCAAGCAGGAGGGCCTGGAGAGTGTGCTGAAGAT  1184
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTGCCTGTGGACTCTGCGCAATCTCTCGGATGTAGCCACCAAGCAGGAGGGCCTGGAGAGTGTGCTGAAGAT  1184

Query 1185  TCTGGTGAATCAGCTGAGTGTGGATGACGTCAACGTCCTCACCTGTGCCACGGGCACACTCTCCAACCTGACAT  1258
            .|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CCTGGTCAACCAACTGAGTGTAGATGACGTCAACGTCCTCACCTGTGCCACGGGCACCCTCTCCAACCTGACCT  1258

Query 1259  GCAACAACAGCAAGAACAAGACGCTGGTGACACAGAACAGCGGTGTGGAGGCTCTCATCCATGCCATCCTGCGT  1332
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.
Sbjct 1259  GCAACAACAGCAAAAACAAGACGCTGGTGACACAGAACAGTGGCGTGGAGGCGCTCATCCACGCCATCCTGAGA  1332

Query 1333  GCTGGTGACAAGGACGACATCACGGAGCCTGCCGTCTGCGCTCTGCGCCACCTCACTAGCCGCCACCCTGAGGC  1406
            ||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1333  GCCGGAGACAAAGATGACATCACAGAGCCCGCTGTCTGTGCCCTGCGCCACCTTACCAGCCGTCACCCCGAGGC  1406

Query 1407  CGAGATGGCCCAGAACTCTGTGCGTCTCAACTATGGCATCCCAGCCATCGTGAAGCTGCTCAACCAGCCCAACC  1480
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  TGAGATGGCCCAGAACTCTGTGCGCCTCAACTATGGAATCCCGGCCATTGTGAAACTGCTCAACCAGCCAAACC  1480

Query 1481  AGTGGCCACTGGTCAAGGCAACCATCGGCTTGATCAGGAATCTGGCCCTGTGCCCAGCCAACCATGCCCCGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481  AGTGGCCACTGGTCAAGGCAACTATTGGCCTGATCCGGAACCTGGCTCTGTGCCCAGCCAACCATGCCCCTCTG  1554

Query 1555  CAGGAGGCAGCGGTCATCCCCCGCCTCGTCCAACTGCTGGTGAAGGCCCACCAGGATGCCCAGCGCCACGTAGC  1628
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1555  CAGGAGGCCGCGGTCATTCCCCGCCTCGTCCAGCTGTTGGTCAAGGCCCACCAGGACGCCCAGCGCCATGTGGC  1628

Query 1629  TGCAGGCACACAGCAGCCCTACACGGATGGTGTGAGGATGGAGGAGATTGTGGAGGGCTGCACCGGAGCACTGC  1702
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  TGCAGGCACCCAGCAGCCCTACACGGATGGTGTGAGGATGGAGGAGATCGTGGAAGGCTGCACCGGAGCCCTGC  1702

Query 1703  ACATCCTCGCCCGGGACCCCATGAACCGCATGGAGATCTTCCGGCTCAACACCATTCCCCTGTTTGTGCAGCTC  1776
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  ACATCCTCGCCCGGGATCCCATGAACCGCATGGAGATCTTCCGGCTCAACACCATTCCCCTGTTTGTCCAGCTC  1776

Query 1777  CTGTACTCGTCGGTGGAGAACATCCAGCGCGTGGCTGCCGGGGTGCTGTGTGAGCTGGCCCAGGACAAGGAGGC  1850
            ||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGTACTCCTCTGTGGAGAACATCCAGCGTGTGGCTGCGGGAGTGCTCTGCGAGCTGGCCCAGGACAAGGAGGC  1850

Query 1851  GGCCGACGCCATTGATGCAGAGGGGGCCTCGGCCCCACTCATGGAGTTGCTGCACTCCCGCAACGAGGGCACTG  1924
            .|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1851  TGCCGACGCCATTGATGCGGAGGGCGCCTCTGCCCCTCTCATGGAGCTACTCCATTCCCGCAATGAGGGCACCG  1924

Query 1925  CCACCTACGCTGCTGCCGTCCTGTTCCGCATCTCCGAGGACAAGAACCCAGACTACCGGAAGCGCGTGTCCGTG  1998
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1925  CGACCTACGCTGCTGCTGTCCTGTTCCGCATCTCTGAGGACAAGAACCCAGATTACCGTAAGCGAGTGTCTGTG  1998

Query 1999  GAGCTCACCAACTCCCTCTTCAAGCATGACCCGGCTGCCTGGGAGGCTGCCCAGAGCATGATTCCCATCAATGA  2072
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1999  GAGCTCACCAATTCCCTCTTCAAGCATGACCCAGCTGCCTGGGAGGCTGCCCAGAGTATGATCCCGATCAACGA  2072

Query 2073  GCCCTATGGAGATGACTTGGATGCCACCTACCGCCCCATGTACTCCAGCGATGTGCCCCTTGACCCGCTGGAGA  2146
            .|||||||.|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 2073  ACCCTATGCAGACGACATGGATGCCACCTACCGCCCCATGTACTCCAGCGATGTGCCTCTGGACCCTCTGGACA  2146

Query 2147  TGCACATGGACATGGATGGAGACTACCCCATCGACACCTACAGCGACGGCCTCAGGCCCCCGTACCCCACTGCA  2220
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 2147  TGCACATGGACCTGGATGGAGACTACCCCATGGACACCTACAGTGACGGCCTGAGGCCTCCCTACCCCACTGCA  2220

Query 2221  AACCACATGCTGGCC  2235
            .||||||||||||||
Sbjct 2221  GACCACATGCTGGCC  2235