Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06482
• Subject: NM_001110227.2
• Aligned Length: 1080
• Identities: 971
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAGTAATTGCAAAGTTATTGCTCCTCTCCTAAGTCAAAGATACCGGAGGATGGTCACCAAGGATGG  74
            |||||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGACAGCAGTAATTGTAAAGTGAATGCTCCTCTCCTGAGTCAAAGACACCGGAGGATGGTCACAAAAGACGG  74

Query   75  CCACAGCACACTTCAAATGGATGGCGCTCAAAGAGGTCTTGCATATCTTCGAGATGCTTGGGGAATCCTAATGG  148
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||..|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCACAGCACACTTCAGATGGATGGTGCTCAAAGGGGCCTTGTGTATCTCCGAGATGCATGGGGAATCCTAATGG  148

Query  149  ACATGCGCTGGCGTTGGATGATGTTGGTCTTTTCTGCTTCTTTTGTTGTCCACTGGCTTGTCTTTGCAGTGCTC  222
            |||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  ACATGCGCTGGCGCTGGATGATGCTGGTCTTTTCTGCTTCTTTTGTTGTCCACTGGCTTGTCTTTGCAGTCCTC  222

Query  223  TGGTATGTTCTGGCTGAGATGAATGGTGATCTGGAACTAGATCATGATGCCCCACCTGAAAACCACACTATCTG  296
            |||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGTATGCTGTAGCTGAGATGAATGGTGATCTGGAAATAGACCACGACGTCCCACCTGAAAACCACACTATCTG  296

Query  297  TGTCAAGTATATCACCAGTTTCACAGCTGCATTCTCCTTCTCCCTGGAGACACAACTCACAATTGGTTATGGTA  370
            |||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGAAGCACATCACCAGCTTCACAGCTGCATTCTCCTTCTCTCTGGAGACACAACTTACAATTGGTTATGGTA  370

Query  371  CCATGTTCCCCAGTGGTGACTGTCCAAGTGCAATCGCCTTACTTGCCATACAAATGCTCCTAGGCCTCATGCTA  444
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATGTTTCCCAGTGGTGACTGTCCAAGTGCAATCGCCTTACTTGCCATACAAATGCTCCTAGGCCTCATGCTA  444

Query  445  GAGGCTTTTATCACAGGTGCTTTTGTGGCGAAGATTGCCCGGCCAAAAAATCGAGCTTTTTCAATTCGCTTTAC  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  GAGGCTTTTATCACAGGTGCCTTTGTGGCGAAGATTGCACGGCCAAAAAATAGAGCTTTCTCAATTCGATTCAC  518

Query  519  TGACATAGCAGTAGTAGCTCACATGGATGGCAAACCTAATCTTATCTTCCAAGTGGCCAACACCCGACCTAGCC  592
            ||||.|||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  519  TGACTTAGCAGTTGTAGCTCACAAAGATGGCAAACCTAATCTTATCTTCCAAGTGGCCAACACCCGGCCCAGCC  592

Query  593  CTCTAACCAGTGTCCGGGTCTCAGCTGTACTCTATCAGGAAAGAGAAAATGGCAAACTCTACCAGACCAGTGTG  666
            ||||.||||..||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTGACCAACGTTCGTGTCTCTGCTGTACTCTATCAGGAAAGAGAAAATGGTGAACTTTACCAGACCAGTGTG  666

Query  667  GATTTCCACCTTGATGGCATCAGTTCTGACGAATGTCCATTCTTCATCTTTCCACTAACGTACTATCACTCCAT  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||..|.||
Sbjct  667  GACTTCCACCTTGATGGCATCAGTTCTGAGGAATGTCCATTCTTCATCTTCCCGCTAACCTATTACCATACTAT  740

Query  741  TACACCATCAAGTCCTCTGGCTACTCTGCTCCAGCATGAAAATCCTTCTCACTTTGAATTAGTTGTATTCCTTT  814
            ..||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|.||||.|.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  CTCACCATCAAGTCCTCTAGCTACCCTGCTCCAACATGAGACTCCTCCACACTTTGAATTAGTTGTGTTCCTCT  814

Query  815  CAGCAATGCAGGAGGGCACTGGAGAAATATGCCAAAGGAGGACATCCTACCTACAGTCTGAAATCATGTTACAT  888
            ||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|..|||||.||||||||||||
Sbjct  815  CAGCAATGCAAGAAGGCACTGGGGAAATCTGCCAAAGGAGGACATCCTACCTGCCCTCTGAGATCATGTTACAT  888

Query  889  CACTGTTTTGCATCTCTGTTGACCCGAGGTTCCAAATGTGAATATCAAATCAAGATGGAGAATTTTGACAAGAC  962
            |||.|.||||||.||||..||||.||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACCGATTTGCAGCTCTAATGACTCGAGGTTCCAAAGGTGAGTATCAAGTCAAGATGGAGAATTTTGACAAGAC  962

Query  963  TGTCCCTGAATTTCCAACTCCTCTGGTTTCTAAAAGCCCAAACAGGACTGACCTGGATATCCACATCAATGGAC  1036
            |||.||||||..||||||.|||.||||.|||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  963  TGTTCCTGAACATCCAACACCTGTGGTCTCTAAGAGTCCACACAGGACTGACCTAGATATTCATATCAATGGAC  1036

Query 1037  AAAGCATTGACAATTTTCAGATCTCTGAAACAGGACTGACAGAA  1080
            ||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  AAAGCATTGACAATTTCCAGATTGCTGAAACAGGGCTGACAGAA  1080