Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06482
Subject:
NM_002242.4
Aligned Length:
1080
Identities:
1077
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAGTAATTGCAAAGTTATTGCTCCTCTCCTAAGTCAAAGATACCGGAGGATGGTCACCAAGGATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAGCAGTAATTGCAAAGTTATTGCTCCTCTCCTAAGTCAAAGATACCGGAGGATGGTCACCAAGGATGG  74

Query   75  CCACAGCACACTTCAAATGGATGGCGCTCAAAGAGGTCTTGCATATCTTCGAGATGCTTGGGGAATCCTAATGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCACAGCACACTTCAAATGGATGGCGCTCAAAGAGGTCTTGCATATCTTCGAGATGCTTGGGGAATCCTAATGG  148

Query  149  ACATGCGCTGGCGTTGGATGATGTTGGTCTTTTCTGCTTCTTTTGTTGTCCACTGGCTTGTCTTTGCAGTGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATGCGCTGGCGTTGGATGATGTTGGTCTTTTCTGCTTCTTTTGTTGTCCACTGGCTTGTCTTTGCAGTGCTC  222

Query  223  TGGTATGTTCTGGCTGAGATGAATGGTGATCTGGAACTAGATCATGATGCCCCACCTGAAAACCACACTATCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGTATGTTCTGGCTGAGATGAATGGTGATCTGGAACTAGATCATGATGCCCCACCTGAAAACCACACTATCTG  296

Query  297  TGTCAAGTATATCACCAGTTTCACAGCTGCATTCTCCTTCTCCCTGGAGACACAACTCACAATTGGTTATGGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTCAAGTATATCACCAGTTTCACAGCTGCATTCTCCTTCTCCCTGGAGACACAACTCACAATTGGTTATGGTA  370

Query  371  CCATGTTCCCCAGTGGTGACTGTCCAAGTGCAATCGCCTTACTTGCCATACAAATGCTCCTAGGCCTCATGCTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATGTTCCCCAGTGGTGACTGTCCAAGTGCAATCGCCTTACTTGCCATACAAATGCTCCTAGGCCTCATGCTA  444

Query  445  GAGGCTTTTATCACAGGTGCTTTTGTGGCGAAGATTGCCCGGCCAAAAAATCGAGCTTTTTCAATTCGCTTTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGCTTTTATCACAGGTGCTTTTGTGGCGAAGATTGCCCGGCCAAAAAATCGAGCTTTTTCAATTCGCTTTAC  518

Query  519  TGACATAGCAGTAGTAGCTCACATGGATGGCAAACCTAATCTTATCTTCCAAGTGGCCAACACCCGACCTAGCC  592
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACACAGCAGTAGTAGCTCACATGGATGGCAAACCTAATCTTATCTTCCAAGTGGCCAACACCCGACCTAGCC  592

Query  593  CTCTAACCAGTGTCCGGGTCTCAGCTGTACTCTATCAGGAAAGAGAAAATGGCAAACTCTACCAGACCAGTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTAACCAGTGTCCGGGTCTCAGCTGTACTCTATCAGGAAAGAGAAAATGGCAAACTCTACCAGACCAGTGTG  666

Query  667  GATTTCCACCTTGATGGCATCAGTTCTGACGAATGTCCATTCTTCATCTTTCCACTAACGTACTATCACTCCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTTCCACCTTGATGGCATCAGTTCTGACGAATGTCCATTCTTCATCTTTCCACTAACGTACTATCACTCCAT  740

Query  741  TACACCATCAAGTCCTCTGGCTACTCTGCTCCAGCATGAAAATCCTTCTCACTTTGAATTAGTTGTATTCCTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TACACCATCAAGTCCTCTGGCTACTCTGCTCCAGCATGAAAATCCTTCTCACTTTGAATTAGTTGTATTCCTTT  814

Query  815  CAGCAATGCAGGAGGGCACTGGAGAAATATGCCAAAGGAGGACATCCTACCTACAGTCTGAAATCATGTTACAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCAATGCAGGAGGGCACTGGAGAAATATGCCAAAGGAGGACATCCTACCTACCGTCTGAAATCATGTTACAT  888

Query  889  CACTGTTTTGCATCTCTGTTGACCCGAGGTTCCAAATGTGAATATCAAATCAAGATGGAGAATTTTGACAAGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACTGTTTTGCATCTCTGTTGACCCGAGGTTCCAAAGGTGAATATCAAATCAAGATGGAGAATTTTGACAAGAC  962

Query  963  TGTCCCTGAATTTCCAACTCCTCTGGTTTCTAAAAGCCCAAACAGGACTGACCTGGATATCCACATCAATGGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTCCCTGAATTTCCAACTCCTCTGGTTTCTAAAAGCCCAAACAGGACTGACCTGGATATCCACATCAATGGAC  1036

Query 1037  AAAGCATTGACAATTTTCAGATCTCTGAAACAGGACTGACAGAA  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAGCATTGACAATTTTCAGATCTCTGAAACAGGACTGACAGAA  1080