Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06501
• Subject: NM_010655.3
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1387
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCCACCAACGAGAATGCTAATACACCAGCTGCCCGTCTTCACAGATTCAAGAACAAGGGAAAAGACAGTAC  74
            ||||||||.||||||||||||||...||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct    1  ATGTCCACGAACGAGAATGCTAACTTACCAGCTGCCCGACTTAACAGGTTCAAGAACAAGGGGAAGGACAGCAC  74

Query   75  AGAAATGAGGCGTCGCAGAATAGAGGTCAATGTGGAGCTGAGGAAAGCTAAGAAGGATGACCAGATGCTGAAGA  148
            |||||||.|.||.|||.|||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  AGAAATGCGTCGCCGCCGAATAGAAGTTAATGTGGAACTCAGGAAAGCTAAAAAAGATGAGCAGATGCTGAAAA  148

Query  149  GGAGAAATGTAAGCTCATTTCCTGATGATGCTACTTCTCCGCTGCAGGAAAACCGCAACAACCAGGGCACTGTA  222
            |.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  GAAGAAACGTCAGCTCCTTTCCTGATGATGCTACTTCTCCGCTACAGGAAAACCGGAACAACCAGGGTACTGTA  222

Query  223  AATTGGTCTGTTGATGACATTGTCAAAGGCATAAATAGCAGCAATGTGGAAAATCAGCTCCAAGCTACTCAAGC  296
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|.||||.||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATTGGTCTGTTGAGGACATTGTTAAAGGCATAAACAGTAACAATTTGGAAAGCCAGCTCCAAGCTACTCAAGC  296

Query  297  TGCCAGGAAACTACTTTCCAGAGAAAAACAGCCCCCCATAGACAACATAATCCGGGCTGGTTTGATTCCGAAAT  370
            |||..|||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  TGCTCGGAAATTGCTTTCTAGAGAGAAACAGCCTCCTATAGACAACATCATCCGGGCTGGTTTGATCCCAAAAT  370

Query  371  TTGTGTCCTTCTTGGGCAGAACTGATTGTAGTCCCATTCAGTTTGAATCTGCTTGGGCACTCACTAACATTGCT  444
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTGTGTCCTTCTTGGGCAAAACTGATTGTAGTCCTATTCAGTTTGAGTCTGCTTGGGCACTCACCAACATTGCT  444

Query  445  TCTGGGACATCAGAACAAACCAAGGCTGTGGTAGATGGAGGTGCCATCCGAGCATTCATTTCTCTGTTGGCATC  518
            |||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||.|||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  TCTGGAACATCTGAACAGACCAAAGCTGTGGTGGATGGAGGTGCTATCCCAGCGTTTATTTCTCTCTTGGCATC  518

Query  519  TCCCCATGCTCACATCAGTGAACAAGATGTCTGGGCTCTAGGAAACATTGCAGGTGATGGCTCAGTGTTCCGAG  592
            |||.||||||||||||||.||.||||.|||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||..|||||||
Sbjct  519  TCCTCATGCTCACATCAGCGAGCAAGCTGTTTGGGCTCTTGGAAACATTGCAGGTGATGGTTCAGCTTTCCGAG  592

Query  593  ACTTGGTTATTAAGTACGGTGCAGTTGACCCACTGTTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGATATGTCATCTTTAGCA  666
            ||||.|||||.||..|||||||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.||||..|.||.|||
Sbjct  593  ACTTAGTTATCAAACACGGTGCGATTGACCCACTGTTGGCACTTCTTGCAGTTCCCGATCTGTCTACCTTGGCA  666

Query  667  TGTGGCTACTTACGTAATCTTACCTGGACACTTTCTAATCTTTGCCGCAACAAGAATCCTGCACCCCCGATAGA  740
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.||..||||
Sbjct  667  TGTGGTTACTTACGTAATCTTACCTGGACACTTTCAAACCTTTGTCGAAACAAGAACCCTGCACCTCCCTTAGA  740

Query  741  TGCTGTTGAGCAGATTCTTCCTACCTTAGTTCGGCTCCTGCATCATGATGATCCAGAAGTGTTAGCAGATACCT  814
            .||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..|||||||||||||.||.||||||.|||
Sbjct  741  CGCCGTTGAGCAGATTCTTCCTACGTTAGTTCGACTCCTGCACCACAATGATCCAGAAGTATTGGCAGATTCCT  814

Query  815  GCTGGGCTATTTCCTACCTTACTGATGGTCCAAATGAACGAATTGGCATGGTGGTGAAAACAGGAGTTGTGCCC  888
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||..|||||.|||||.|.|||||||||.|||
Sbjct  815  GCTGGGCCATTTCCTACCTGACTGATGGTCCAAATGAGCGCATTGAGATGGTTGTGAAGAAAGGAGTTGTTCCC  888

Query  889  CAACTTGTGAAGCTTCTAGGAGCTTCTGAATTGCCAATTGTGACTCCTGCCCTAAGAGCCATAGGGAATATTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAACTTGTGAAGCTTCTAGGAGCTACTGAACTGCCCATTGTGACTCCCGCACTAAGAGCCATAGGGAATATTGT  962

Query  963  CACTGGTACAGATGAACAGACTCAGGTTGTGATTGATGCAGGAGCACTCGCCGTCTTTCCCAGCCTGCTCACCA  1036
            ||||||.||||||||.|||||||||...|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  CACTGGAACAGATGAGCAGACTCAGAAAGTGATCGATGCAGGAGCACTTGCAGTCTTTCCCAGCCTGCTAACAA  1036

Query 1037  ACCCCAAAACTAACATTCAGAAGGAAGCTACGTGGACAATGTCAAACATCACAGCCGGCCGCCAGGACCAGATA  1110
            |||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCCCAAAACTAATATTCAGAAGGAGGCCACATGGACAATGTCGAACATTACAGCTGGACGCCAGGACCAGATA  1110

Query 1111  CAGCAAGTTGTGAATCATGGATTAGTCCCATTCCTTGTCAGTGTTCTCTCTAAGGCAGATTTTAAGACACAAAA  1184
            |||||||||||||||||.||..|||||||.||.|||||..||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  CAGCAAGTTGTGAATCACGGCCTAGTCCCCTTTCTTGTTGGTGTCCTCTCTAAGGCGGACTTTAAGACACAGAA  1184

Query 1185  GGAAGCTGTGTGGGCCGTGACCAACTATACCAGTGGTGGAACAGTTGAACAGATTGTGTACCTTGTTCACTGTG  1258
            |||.||.|.||||||..|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGCCGCGTGGGCTATAACCAACTATACCAGCGGTGGGACTGTTGAGCAGATTGTGTATCTCGTTCACTGTG  1258

Query 1259  GCATAATAGAACCGTTGATGAACCTCTTAACTGCAAAAGATACCAAGATTATTCTGGTTATCCTGGATGCCATT  1332
            |.|||||||||||.||||||||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.||||||
Sbjct 1259  GGATAATAGAACCTTTGATGAACCTCCTGAGTGCAAAAGATACCAAGATTATTCAGGTTATTCTTGACGCCATT  1332

Query 1333  TCAAATATCTTTCAGGCTGCTGAGAAACTAGGTGAAACTGAGAAACTTAGTATAATGATTGAAGAATGTGGAGG  1406
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  TCAAATATCTTTCAGGCTGCAGAGAAACTAGGTGAGACAGAAAAGCTCAGTATAATGATTGAAGAGTGTGGAGG  1406

Query 1407  CTTAGACAAAATTGAAGCTCTACAAAACCATGAAAATGAGTCTGTGTATAAGGCTTCGTTAAGCTTAATTGAGA  1480
            |||.||.|||||||||||.|||||.|..||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|.|||||||||||
Sbjct 1407  CTTGGATAAAATTGAAGCACTACAGAGGCATGAAAACGAGTCTGTATACAAGGCCTCATTGAACTTAATTGAGA  1480

Query 1481  AGTATTTCTCTGTAGAGGAAGAGGAAGATCAAAACGTTGTACCAGAAACTACCTCTGAAGGCTACACTTTCCAA  1554
            ||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||.|.|.||||||
Sbjct 1481  AGTACTTCTCAGTGGAGGAAGAGGAAGATCAAAATGTGGTGCCAGAAACTACCTCTGAAGGCTTCGCCTTCCAA  1554

Query 1555  GTTCAGGATGGGGCTCCTGGGACCTTTAACTTT  1587
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1555  GTTCAGGATGGAGCTCCTGGGACCTTTAACTTC  1587