Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06526
• Subject: NM_000236.3
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1493
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACACAAGTCCCCTGTGTTTCTCCATTCTGTTGGTTTTATGCATCTTTATCCAATCAAGTGCCCTTGGACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACACAAGTCCCCTGTGTTTCTCCATTCTGTTGGTTTTATGCATCTTTATCCAATCAAGTGCCCTTGGACA  74

Query   75  AAGCCTGAAACCAGAGCCATTTGGAAGAAGAGCTCAAGCTGTTGAAACAAACAAAACGCTGCATGAGATGAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCCTGAAACCAGAGCCATTTGGAAGAAGAGCTCAAGCTGTTGAAACAAACAAAACGCTGCATGAGATGAAGA  148

Query  149  CCAGATTCCTGCTCTTTGGAGAAACCAATCAGGGCTGTCAGATTCGAATCAATCATCCGGACACGTTACAGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGATTCCTGCTCTTTGGAGAAACCAATCAGGGCTGTCAGATTCGAATCAATCATCCGGACACGTTACAGGAG  222

Query  223  TGCGGCTTCAACTCCTCCCTGCCTCTGGTGATGATAATCCACGGGTGGTCGGTGGACGGCGTGCTAGAAAACTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCGGCTTCAACTCCTCCCTGCCTCTGGTGATGATAATCCACGGGTGGTCGGTGGACGGCGTGCTAGAAAACTG  296

Query  297  GATCTGGCAGATGGTGGCCGCGCTGAAGTCTCAGCCGGCCCAGCCAGTGAACGTGGGGCTGGTGGACTGGATCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCTGGCAGATGGTGGCCGCGCTGAAGTCTCAGCCGGCCCAGCCAGTGAACGTGGGGCTGGTGGACTGGATCA  370

Query  371  CCCTGGCCCACGACCACTACACCATCGCCGTCCGCAACACCCGCCTTGTGGGCAAGGAGGTCGCGGCTCTTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTGGCCCACGACCACTACACCATCGCCGTCCGCAACACCCGCCTTGTGGGCAAGGAGGTCGCGGCTCTTCTC  444

Query  445  CGGTGGCTGGAGGAATCTGTTCAACTCTCTCGAAGCCATGTTCACCTAATTGGGTACAGCCTGGGTGCACACGT  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGTGGCTGGAGGAATCTGTGCAACTCTCTCGAAGCCATGTTCACCTAATTGGGTACAGCCTGGGTGCACACGT  518

Query  519  GTCAGGATTTGCCGGCAGTTCCATCGGTGGAACGCACAAGATTGGGAGAATCACAGGGCTGGATGCCGCGGGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCAGGATTTGCCGGCAGTTCCATCGGTGGAACGCACAAGATTGGGAGAATCACAGGGCTGGATGCCGCGGGAC  592

Query  593  CTTTGTTTGAGGGAAGTGCCCCCAGCAATCGTCTTTCTCCAGATGATGCCAATTTTGTGGATGCCATTCATACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTTGTTTGAGGGAAGTGCCCCCAGCAATCGTCTTTCTCCAGATGATGCCAATTTTGTGGATGCCATTCATACC  666

Query  667  TTTACGCGGGAGCACATGGGCCTGAGCGTGGGCATCAAACAGCCCATAGGACACTATGACTTCTATCCCAACGG  740
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTACCCGGGAGCACATGGGCCTGAGCGTGGGCATCAAACAGCCCATAGGACACTATGACTTCTATCCCAACGG  740

Query  741  GGGCTCCTTCCAGCCTGGCTGCCACTTCCTAGAGCTCTACAGACATATTGCCCAGCACGGCTTCAATGCCATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGCTCCTTCCAGCCTGGCTGCCACTTCCTAGAGCTCTACAGACATATTGCCCAGCACGGCTTCAATGCCATCA  814

Query  815  CCCAGACCATAAAATGCTCCCACGAGCGATCGGTGCACCTTTTCATCGACTCCTTGCTGCACGCCGGCACGCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCAGACCATAAAATGCTCCCACGAGCGATCGGTGCACCTTTTCATCGACTCCTTGCTGCACGCCGGCACGCAG  888

Query  889  AGCATGGCCTACCCGTGTGGTGACATGAACAGCTTCAGCCAGGGCCTGTGCCTGAGCTGCAAGAAGGGCCGCTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCATGGCCTACCCGTGTGGTGACATGAACAGCTTCAGCCAGGGCCTGTGCCTGAGCTGCAAGAAGGGCCGCTG  962

Query  963  CAACACGCTGGGCTACCACGTCCGCCAGGAGCCGCGGAGCAAGAGCAAGAGGCTCTTCCTCGTAACGCGAGCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAACACGCTGGGCTACCACGTCCGCCAGGAGCCGCGGAGCAAGAGCAAGAGGCTCTTCCTCGTAACGCGAGCCC  1036

Query 1037  AGTCCCCCTTCAAAGTTTATCATTACCAGTTAAAGATCCAGTTCATCAACCAAACTGAGACGCCAATACAAACA  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  AGTCCCCCTTCAAAGTTTATCATTACCAGTTCAAGATCCAGTTCATCAACCAAACTGAGACACCAATACAAACA  1110

Query 1111  ACTTTTACCATGTCACTACTCGGAACAAAAGAGAAAATGCAGAAAATTCCCATCACTCTGGGCAAAGGAATTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTTTTACCATGTCACTACTCGGAACAAAAGAGAAAATGCAGAAAATTCCCATCACTCTGGGCAAAGGAATTGC  1184

Query 1185  TAGTAATAAAACGTATTCCTTTCTTATCACGCTGGATGTGGATATCGGCGAGCTGATCATGATCAAGTTCAAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGTAATAAAACGTATTCCTTTCTTATCACGCTGGATGTGGATATCGGCGAGCTGATCATGATCAAGTTCAAGT  1258

Query 1259  GGGAAAACAGTGCAGTGTGGGCCAATGTCTGGGACACGGTCCAGACCATCATCCCATGGAGCACAGGGCCGCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGAAAACAGTGCAGTGTGGGCCAATGTCTGGGACACGGTCCAGACCATCATCCCATGGAGCACAGGGCCGCGC  1332

Query 1333  CACTCAGGCCTCGTTCTGAAGACGATCAGAGTCAAAGCAGGAGAAACCCAGCAAAGAATGACATTTTGTTCAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACTCAGGCCTCGTTCTGAAGACGATCAGAGTCAAAGCAGGAGAAACCCAGCAAAGAATGACATTTTGTTCAGA  1406

Query 1407  AAACACAGATGACCTACTACTTCGCCCAACCCAGGAAAAAATCTTCGTGAAATGTGAAATAAAGTCTAAAACAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAACACAGATGACCTACTACTTCGCCCAACCCAGGAAAAAATCTTCGTGAAATGTGAAATAAAGTCTAAAACAT  1480

Query 1481  CAAAGCGAAAGATCAGA  1497
            |||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAAAGCGAAAGATCAGA  1497