Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06570
• Subject: NM_006739.4
• Aligned Length: 2202
• Identities: 2200
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCGGGATTCGACGATCCTGGCATTTTCTACAGCGACAGCTTCGGGGGCGACGCCCAGGCCGACGAGGGGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGATTCGACGATCCTGGCATTTTCTACAGCGACAGCTTCGGGGGCGACGCCCAGGCCGACGAGGGGCA  74

Query   75  GGCCCGCAAATCGCAGCTGCAGAGGCGCTTCAAGGAGTTCCTGCGGCAGTACCGAGTGGGCACCGACCGCACGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCCGCAAATCGCAGCTGCAGAGGCGCTTCAAGGAGTTCCTGCGGCAGTACCGAGTGGGCACCGACCGCACGG  148

Query  149  GCTTCACCTTCAAATACAGGGATGAACTCAAGCGGCATTACAACCTGGGGGAGTACTGGATTGAGGTGGAGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTCACCTTCAAATACAGGGATGAACTCAAGCGGCATTACAACCTGGGGGAGTACTGGATTGAGGTGGAGATG  222

Query  223  GAGGATCTGGCCAGCTTTGATGAGGACCTGGCCGACTACTTGTACAAGCAGCCAGCCGAGCACCTGCAGCTGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGATCTGGCCAGCTTTGATGAGGACCTGGCCGACTACTTGTACAAGCAGCCAGCCGAGCACCTGCAGCTGCT  296

Query  297  GGAGGAAGCTGCCAAGGAGGTAGCTGATGAGGTGACCCGGCCCCGGCCTTCTGGGGAGGAGGTGCTCCAGGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGGAAGCTGCCAAGGAGGTAGCTGATGAGGTGACCCGGCCCCGGCCTTCTGGGGAGGAGGTGCTCCAGGACA  370

Query  371  TCCAGGTCATGCTCAAGTCGGACGCCAGCCCTTCCAGCATTCGTAGCCTGAAGTCGGACATGATGTCACACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCAGGTCATGCTCAAGTCGGACGCCAGCCCTTCCAGCATTCGTAGCCTGAAGTCGGACATGATGTCACACCTG  444

Query  445  GTGAAGATCCCTGGCATCATCATCGCGGCCTCTGCGGTCCGTGCCAAGGCCACCCGCATCTCTATCCAGTGCCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGAAGATCCCTGGCATCATCATCGCGGCCTCTGCGGTCCGTGCCAAGGCCACCCGCATCTCTATCCAGTGCCG  518

Query  519  CAGCTGCCGCAACACCCTCACCAACATTGCCATGCGCCCTGGCCTCGAGGGCTATGCCCTGCCCAGGAAGTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGCTGCCGCAACACCCTCACCAACATTGCCATGCGCCCTGGCCTCGAGGGCTATGCCCTGCCCAGGAAGTGCA  592

Query  593  ACACAGATCAGGCTGGGCGCCCCAAATGCCCATTGGACCCGTACTTCATCATGCCCGACAAATGCAAATGCGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACACAGATCAGGCTGGGCGCCCCAAATGCCCATTGGACCCGTACTTCATCATGCCCGACAAATGCAAATGCGTG  666

Query  667  GACTTCCAGACCCTGAAGCTGCAGGAGCTGCCTGATGCAGTCCCCCACGGGGAGATGCCCAGACACATGCAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTTCCAGACCCTGAAGCTGCAGGAGCTGCCTGATGCAGTCCCCCACGGGGAGATGCCCAGACACATGCAGCT  740

Query  741  CTACTGCGACAGGTACCTGTGTGACAAGGTCGTCCCTGGGAACAGGGTTACCATCATGGGCATCTACTCCATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTACTGCGACAGGTACCTGTGTGACAAGGTCGTCCCTGGGAACAGGGTTACCATCATGGGCATCTACTCCATCA  814

Query  815  AGAAGTTTGGCCTGACCACCAGCAGGGGCCGTGACAGGGTGGGCGTGGGCATCCGAAGCTCCTACATCCGTGTC  888
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGTTTGGCCTGACTACCAGCAGGGGCCGTGACAGGGTGGGCGTGGGCATCCGAAGCTCCTACATCCGTGTC  888

Query  889  CTGGGCATCCAGGTGGACACAGATGGCTCTGGCCGCAGCTTTGCTGGGGCCGTGAGCCCCCAGGAGGAGGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGGCATCCAGGTGGACACAGATGGCTCTGGCCGCAGCTTTGCTGGGGCCGTGAGCCCCCAGGAGGAGGAGGA  962

Query  963  GTTCCGTCGCCTGGCTGCCCTCCCAAATGTCTATGAGGTCATCTCCAAGAGCATCGCCCCCTCCATCTTTGGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCCGTCGCCTGGCTGCCCTCCCAAATGTCTATGAGGTCATCTCCAAGAGCATCGCCCCCTCCATCTTTGGGG  1036

Query 1037  GCACAGACATGAAGAAGGCCATTGCCTGCCTGCTCTTTGGGGGCTCCCGAAAGAGGCTCCCTGATGGACTTACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCACAGACATGAAGAAGGCCATTGCCTGCCTGCTCTTTGGGGGCTCCCGAAAGAGGCTCCCTGATGGACTTACT  1110

Query 1111  CGCCGAGGAGACATCAACCTGCTGATGCTAGGGGACCCTGGGACAGCCAAGTCCCAGCTTCTGAAGTTTGTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCCGAGGAGACATCAACCTGCTGATGCTAGGGGACCCTGGGACAGCCAAGTCCCAGCTTCTGAAGTTTGTGGA  1184

Query 1185  GAAGTGTTCTCCCATTGGGGTATACACGTCTGGGAAAGGCAGCAGCGCAGCTGGACTGACAGCCTCGGTGATGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGTGTTCTCCCATTGGGGTATACACGTCTGGGAAAGGCAGCAGCGCAGCTGGACTGACAGCCTCGGTGATGA  1258

Query 1259  GGGACCCTTCGTCCCGGAATTTCATCATGGAGGGCGGAGCCATGGTCCTGGCCGATGGTGGGGTCGTCTGTATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGACCCTTCGTCCCGGAATTTCATCATGGAGGGCGGAGCCATGGTCCTGGCCGATGGTGGGGTCGTCTGTATT  1332

Query 1333  GACGAGTTTGACAAGATGCGAGAAGATGACCGTGTGGCAATCCACGAAGCCATGGAGCAGCAGACCATCTCTAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACGAGTTTGACAAGATGCGAGAAGATGACCGTGTGGCAATCCACGAAGCCATGGAGCAGCAGACCATCTCTAT  1406

Query 1407  CGCCAAGGCTGGGATCACCACCACCCTGAACTCCCGCTGCTCCGTCCTGGCTGCTGCCAACTCAGTGTTCGGCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGCCAAGGCTGGGATCACCACCACCCTGAACTCCCGCTGCTCCGTCCTGGCTGCTGCCAACTCAGTGTTCGGCC  1480

Query 1481  GCTGGGATGAGACGAAGGGGGAGGACAACATTGACTTCATGCCCACCATCTTGTCGCGCTTCGACATGATCTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCTGGGATGAGACGAAGGGGGAGGACAACATTGACTTCATGCCCACCATCTTGTCGCGCTTCGACATGATCTTC  1554

Query 1555  ATCGTCAAGGATGAGCACAATGAGGAGAGGGATGTGATGCTGGCCAAGCATGTCATCACTCTGCACGTGAGCGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCGTCAAGGATGAGCACAATGAGGAGAGGGATGTGATGCTGGCCAAGCATGTCATCACTCTGCACGTGAGCGC  1628

Query 1629  ACTGACACAGACACAGGCTGTGGAGGGCGAGATTGACCTGGCCAAGCTGAAGAAGTTTATTGCCTACTGCCGAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACTGACACAGACACAGGCTGTGGAGGGCGAGATTGACCTGGCCAAGCTGAAGAAGTTTATTGCCTACTGCCGAG  1702

Query 1703  TGAAATGTGGCCCCCGGCTGTCAGCAGAGGCTGCAGAGAAACTGAAGAACCGCTACATCATCATGCGGAGCGGG  1776
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGAAGTGTGGCCCCCGGCTGTCAGCAGAGGCTGCAGAGAAACTGAAGAACCGCTACATCATCATGCGGAGCGGG  1776

Query 1777  GCCCGTCAGCACGAGAGGGACAGTGACCGCCGCTCCAGCATCCCCATCACTGTGCGGCAGCTGGAGGCCATTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCCGTCAGCACGAGAGGGACAGTGACCGCCGCTCCAGCATCCCCATCACTGTGCGGCAGCTGGAGGCCATTGT  1850

Query 1851  GCGCATCGCGGAAGCCCTCAGCAAGATGAAGCTGCAGCCCTTCGCCACAGAGGCAGATGTGGAGGAGGCCCTGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCGCATCGCGGAAGCCCTCAGCAAGATGAAGCTGCAGCCCTTCGCCACAGAGGCAGATGTGGAGGAGGCCCTGC  1924

Query 1925  GGCTCTTCCAAGTGTCCACGTTGGATGCTGCCTTGTCCGGTACCCTGTCAGGGGTGGAGGGCTTCACCAGCCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGCTCTTCCAAGTGTCCACGTTGGATGCTGCCTTGTCCGGTACCCTGTCAGGGGTGGAGGGCTTCACCAGCCAG  1998

Query 1999  GAGGACCAGGAGATGCTGAGCCGCATCGAGAAGCAGCTCAAGCGCCGCTTTGCCATTGGCTCCCAGGTGTCTGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGGACCAGGAGATGCTGAGCCGCATCGAGAAGCAGCTCAAGCGCCGCTTTGCCATTGGCTCCCAGGTGTCTGA  2072

Query 2073  GCACAGCATCATCAAGGACTTCACCAAGCAGAAATACCCGGAGCACGCCATCCACAAGGTGCTGCAGCTCATGC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCACAGCATCATCAAGGACTTCACCAAGCAGAAATACCCGGAGCACGCCATCCACAAGGTGCTGCAGCTCATGC  2146

Query 2147  TGCGGCGCGGCGAGATCCAGCATCGCATGCAGCGCAAGGTTCTCTACCGCCTCAAG  2202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCGGCGCGGCGAGATCCAGCATCGCATGCAGCGCAAGGTTCTCTACCGCCTCAAG  2202