Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06575
• Subject: NM_001291192.1
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1348
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA  74

Query   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCTATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148

Query  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222
            |||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.
Sbjct  149  GCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGACAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAACGAG  222

Query  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC  296
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC  296

Query  297  AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA  370

Query  371  ATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  371  ATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGTCCCTGTG  444

Query  445  ACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAAC  518
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCAGCCCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCAGCTCAAC  518

Query  519  GTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGA  592
            .|||.|||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  519  ATTAGCAGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCTCCGCAGA  592

Query  593  GACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGC  666
            |||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..
Sbjct  593  GACCACCAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGCTGGAAAT  666

Query  667  AGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTT  740
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||.||
Sbjct  667  AGTCCTGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAAATAGTTT  740

Query  741  AGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  741  AGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGGAAACCAG  814

Query  815  ATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAATACCCAAAGGATCAGTAGTTCT  888
            ||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.||.||||||
Sbjct  815  ATCTACGAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTAATGCCCAAAGGATAAGCAGTTCT  888

Query  889  CAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTA  962
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  889  CAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAGCTTGCCTCCACAGGGACTAGTGTA  962

Query  963  CTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCA  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  963  CTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCTGCCCTGCAAGGCTTTA  1036

Query 1037  ACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGC  1110
            ..||.||.|||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCACCATCTAGGACAAGCAGCCCTCAGC  1110

Query 1111  TCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAA  1184
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||.||
Sbjct 1111  TCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAACACCAACCAGAACATCAACATTAA  1184

Query 1185  GTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC  1258
            |||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||        
Sbjct 1185  GTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCCAACAGCAGCAGCAGCA--------  1250

Query 1259  AGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGC  1332
                         |||||.||.||||||.|.|||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1251  -------------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCCCAACCCCGGCAGGAAATGGGGCGC  1311

Query 1333  TCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1312  TCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGACCGGGAGGATCCACGGGGTGACTT  1385

Query 1407  CCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGA  1480
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1386  CCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAACGCATGAGGA  1459

Query 1481  TGGACGCGTGGGTTACC  1497
            |||||.|.|||||.|||
Sbjct 1460  TGGACACATGGGTGACC  1476