Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06575
- Subject:
- NM_001352618.2
- Aligned Length:
- 1509
- Identities:
- 1495
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA 74
Query 75 GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA 148
Query 149 GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA 222
Query 223 CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC 296
Query 297 AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA 370
Query 371 ATATGATGCGGAATCATAAAATCGC------------ACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC 432
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATATGATGCGGAATCATAAAATCGCAGTGAGTACTAAACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC 444
Query 433 ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC 518
Query 507 AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG 592
Query 581 GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT 666
Query 655 GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG 740
Query 729 TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA 814
Query 803 GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAATACCCAAAGG 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAATACCCAGAGG 888
Query 877 ATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCA 962
Query 951 AGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCC 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCC 1036
Query 1025 TTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAA 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAA 1110
Query 1099 GCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAA 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAA 1184
Query 1173 CATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGC 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGC 1258
Query 1247 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAG 1332
Query 1321 GAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCC 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCC 1406
Query 1395 ACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAA 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAA 1480
Query 1469 AGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC 1497
|||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481 AGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1509