Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06575
• Subject: XM_006540685.3
• Aligned Length: 1521
• Identities: 1348
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA  74

Query   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCTATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148

Query  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222
            |||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.
Sbjct  149  GCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGACAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAACGAG  222

Query  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC  296
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC  296

Query  297  AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA  370

Query  371  ATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  371  ATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGTCCCTGTG  444

Query  445  ACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAAC  518
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCAGCCCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCAGCTCAAC  518

Query  519  GTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGA  592
            .|||.|||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  519  ATTAGCAGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCTCCGCAGA  592

Query  593  GACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGC  666
            |||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..
Sbjct  593  GACCACCAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGCTGGAAAT  666

Query  667  AGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTT  740
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||.||
Sbjct  667  AGTCCTGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAAATAGTTT  740

Query  741  AGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  741  AGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGGAAACCAG  814

Query  815  ATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCAC------------------------TA  864
            ||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||                        |.
Sbjct  815  ATCTACGAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTTCGGAGGAAGAGGAATTGGAGTTG  888

Query  865  AATACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAG  938
            |||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  AATGCCCAAAGGATAAGCAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAG  962

Query  939  CTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTG  1012
            |||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGCCTCCACAGGGACTAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTG  1036

Query 1013  ACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCAC  1086
            |||||||.|||||.||||||||.|..||.||.|||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCTGTCTGCCCTGCAAGGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCAC  1110

Query 1087  CACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAA  1160
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  CATCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAA  1184

Query 1161  TACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCC  1234
            .||||||||.|||||||.|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1185  CACCAACCAGAACATCAACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCC  1258

Query 1235  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCC  1308
            |.||||||||||||||                     |||||.||.||||||.|.|||||||||.||.||||||
Sbjct 1259  AACAGCAGCAGCAGCA---------------------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCC  1311

Query 1309  CAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGA  1382
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  CAACCCCGGCAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGA  1385

Query 1383  TCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAA  1456
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1386  CCGGGAGGATCCACGGGGTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAA  1459

Query 1457  GCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC  1497
            |||||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||
Sbjct 1460  GCCCTTCTGTAAAACGCATGAGGATGGACACATGGGTGACC  1500