Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06575
• Subject: XM_006540686.3
• Aligned Length: 1538
• Identities: 1288
• Gaps: 85

Alignment

Query    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA  74

Query   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCTATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148

Query  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222
            |||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.
Sbjct  149  GCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGACAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAACGAG  222

Query  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAA----CACAGAGGGTGCGACA  292
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|..|    |||||.|||    |..|..||.||.||.|
Sbjct  223  CCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGACGTT----AAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGA  292

Query  293  GCCCAGACCCTGA----TACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGA  362
            ||||.||..||||    |||||    ||.||..|.|||||...|.||.||.|.||..|..|||.|.|||||.||
Sbjct  293  GCCCTGATGCTGACGATTACTT----TGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGA  362

Query  363  -----ATTTGAT----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGT  427
                 ||||.||    || |.||.|              |.|.|||||..||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  363  TAGTGATTTTATTTTCAA-ACGAGG--------------CCCTCCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGT  421

Query  428  CTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCT  501
            ||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct  422  CTGTCACAGTCCCTGTGACCAGCCCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCT  495

Query  502  TTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTC  575
            |||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||
Sbjct  496  TTGGCAGCCAGCTCAACATTAGCAGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTC  569

Query  576  TCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGC  649
            .||.||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  570  CCCAGGAGCTCCGCAGAGACCACCAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGC  643

Query  650  CAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCT  723
            |||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|
Sbjct  644  CAAATGGAGCTGGAAATAGTCCTGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAAT  717

Query  724  ACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAAT  797
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  718  ACTGGTGCAAATAGTTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAAT  791

Query  798  GAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCAC---------  862
            |||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||         
Sbjct  792  GAACAGTCGGAAACCAGATCTACGAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTTCGGAGG  865

Query  863  ---------------TAAATACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTG  921
                           |.|||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  866  AAGAGGAATTGGAGTTGAATGCCCAAAGGATAAGCAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTG  939

Query  922  TCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTA  995
            |||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  940  TCTGTGACAACTCCGAGCTTGCCTCCACAGGGACTAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTA  1013

Query  996  TTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGT  1069
            .|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|..||.||.|||||||||||.|||||.||||..|
Sbjct 1014  CTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCTGCCCTGCAAGGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTT  1087

Query 1070  CGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGT  1143
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  CAGCCTGGCAGCAGCACCATCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGT  1161

Query 1144  TCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTAT  1217
            ||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.||
Sbjct 1162  TCAAATTTGTCCATTAACACCAACCAGAACATCAACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAAT  1235

Query 1218  GACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGC  1291
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||                     |||||.||.||||||.|.||
Sbjct 1236  GACCCCATCAGGCTTCCAACAGCAGCAGCAGCA---------------------GCCACAACAGCAGCCACCGC  1288

Query 1292  CACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGC  1365
            |||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1289  CACAACCTCCACAGCCCCAACCCCGGCAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGC  1362

Query 1366  TCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAA  1439
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1363  TCCTATGATGGCAGTGACCGGGAGGATCCACGGGGTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAA  1436

Query 1440  CACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC  1497
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||
Sbjct 1437  TACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAACGCATGAGGATGGACACATGGGTGACC  1494