Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06575
• Subject: XM_011521590.2
• Aligned Length: 1517
• Identities: 893
• Gaps: 616

Alignment

Query    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74

Query   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148

Query  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222

Query  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC  296

Query  297  AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA  370

Query  371  ATATGATGCGGAATCATAAAATCGC------------ACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC  432
            |||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATGATGCGGAATCATAAAATCGCAGTGAGTACTAAACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC  444

Query  433  ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC  518

Query  507  AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG  592

Query  581  GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT  666

Query  655  GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG  740

Query  729  TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA  814

Query  803  GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAATACCCAA---  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||  ||||   
Sbjct  815  GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAGAT--CCAATCC  886

Query  874  AGGAT----CAGTAGTTCTCAAGCCACTCA-ACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTG  942
            |||||    ||.||  |.|..|| ||.||| ..|||||                                    
Sbjct  887  AGGATACCACATTA--TATTTAG-CAATCATGTCTCTT------------------------------------  921

Query  943  CCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCT  1016
                                                                                      
Sbjct  922  --------------------------------------------------------------------------  921

Query 1017  GTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACC  1090
                                                                                      
Sbjct  922  --------------------------------------------------------------------------  921

Query 1091  TAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACC  1164
                                                                                      
Sbjct  922  --------------------------------------------------------------------------  921

Query 1165  AACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCA  1238
                                                                                      
Sbjct  922  --------------------------------------------------------------------------  921

Query 1239  GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGC  1312
                                                                                      
Sbjct  922  --------------------------------------------------------------------------  921

Query 1313  CCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGG  1386
                                                                                      
Sbjct  922  --------------------------------------------------------------------------  921

Query 1387  GAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCC  1460
                                                                                      
Sbjct  922  --------------------------------------------------------------------------  921

Query 1461  TTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC  1497
                                                 
Sbjct  922  -------------------------------------  921