Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06575
- Subject:
- XM_017022196.1
- Aligned Length:
- 1533
- Identities:
- 1123
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATATGATGCGGAATCATAAAATCGC------------ACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC 432
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --ATGATGCGGAATCATAAAATCGCAGTGAGTACTAAACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTC 72
Query 433 ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 ACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGC 146
Query 507 AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 AGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTG 220
Query 581 GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 GAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAAT 294
Query 655 GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 GGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGG 368
Query 729 TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 TGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACA 442
Query 803 GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTA------------ 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 GTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTATCGGAGGAAGAG 516
Query 865 ------------AATACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGT 926
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GAATTGGAGTTGAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGT 590
Query 927 GACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCAC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCAC 664
Query 1001 TGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCC 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 TGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCC 738
Query 1075 TGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAA 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 TGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAA 812
Query 1149 TTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCC 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 TTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCC 886
Query 1223 CATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAA 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAA 960
Query 1297 CCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTA 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTA 1034
Query 1371 TGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTG 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTG 1108
Query 1445 AGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC 1497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1109 AGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1161