Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06611
• Subject: NM_001080775.1
• Aligned Length: 1044
• Identities: 996
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ----------------MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDL  58
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MRYRASALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDL  74

Query   59  QIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERG  132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  QIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERG  148

Query  133  GAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFY  206
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  149  GAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHVFY  222

Query  207  QLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLG  280
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  QLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVMRKALSVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLG  296

Query  281  NIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRT  354
            ||||||.|.||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  NIHFAADEDSNAQVTTENQLKYLTRLLGVEGTTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRT  370

Query  355  FTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEA  428
            |||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  FTWLVRKINRSLASKDAESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEA  444

Query  429  EGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSL  502
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  445  EGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKPHPHFLTHKLADQKTRKSL  518

Query  503  GRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFKMSLLQL  576
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  DRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSMNPIMAQCFDKSELSDKKRPETVATQFKMSLLQL  592

Query  577  VEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPT  650
            ||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  VEILRSKEPAYIRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLMENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPM  666

Query  651  WAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKR  724
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  WAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDSLEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKR  740

Query  725  SAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSW  798
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  SAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFILRHSPRCPENAFFLDHVRASFLLNLRRQLPRNVLDTSW  814

Query  799  PTPPPALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEIS  872
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  PTPPPALREASELLRELCMKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTEEIS  888

Query  873  PRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHV  946
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  PRVLQSLGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRPRQLLLTPSAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHV  962

Query  947  QRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAV  1020
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  QREDNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSADRVNNININQGSITFAGGPGRDGIIDFTSGSELLITKAKNGHLAV  1036

Query 1021  VAPRLNSR  1028
            ||||||||
Sbjct 1037  VAPRLNSR  1044