Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06611
• Subject: NM_001080779.2
• Aligned Length: 1063
• Identities: 1026
• Gaps: 35

Alignment

Query    1  -----------------------------------MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFREN  39
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MALQVELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFREN  74

Query   40  LIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTE  113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTE  148

Query  114  ATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLL  187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLL  222

Query  188  EKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDF  261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  EKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDF  296

Query  262  TEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLN  335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLN  370

Query  336  LEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEK  409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  LEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEK  444

Query  410  LQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVK  483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  LQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVK  518

Query  484  HHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELS  557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  HHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELS  592

Query  558  DKKRPETVATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRR  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  DKKRPETVATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRR  666

Query  632  KYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATK  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  KYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATK  740

Query  706  IQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRT  779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  IQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRT  814

Query  780  SFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNY  853
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  SFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNY  888

Query  854  PQSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYA  927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  PQSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYA  962

Query  928  NLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTID  1001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  NLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTID  1036

Query 1002  FTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR  1028
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  FTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR  1063