Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06611
• Subject: NM_001080950.2
• Aligned Length: 3132
• Identities: 3082
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGGAGAGTGCGCTCACCGCCCGTGA  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCTACCGGGCGTCGGCCCTGGGCAGTGACGGGGTTCGGGTGACCATGGAGAGTGCGCTCACCGCCCGTGA  74

Query   27  CCGGGTGGGGGTGCAGGATTTCGTGCTGCTGGAGAACTTCACCAGCGAGGCCGCCTTCATCGAGAACCTGCGGC  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGGTGGGGGTGCAGGATTTCGTGCTGCTGGAGAACTTCACCAGCGAGGCCGCCTTCATCGAGAACCTGCGGC  148

Query  101  GGCGATTTCGGGAGAATCTCATCTACACCTACATTGGCCCCGTCCTGGTCTCTGTCAATCCCTACCGGGACCTG  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCGATTTCGGGAGAATCTCATCTACACCTACATTGGCCCCGTCCTGGTCTCTGTCAATCCCTACCGGGACCTG  222

Query  175  CAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAGCGTTACCGTGGCGTCAGCTTCTATGAAGTGCCCCCTCACCTGTTTGC  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAGCGTTACCGTGGCGTCAGCTTCTATGAAGTGCCCCCTCACCTGTTTGC  296

Query  249  CGTGGCGGACACTGTGTACCGAGCACTGCGCACGGAGCGTCGGGACCAGGCTGTGATGATCTCTGGGGAGAGCG  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTGGCGGACACTGTGTACCGAGCACTGCGCACGGAGCGTCGGGACCAGGCTGTGATGATCTCTGGGGAGAGCG  370

Query  323  GGGCAGGCAAGACCGAGGCCACCAAGAGGCTGCTGCAGTTCTATGCAGAGACCTGCCCAGCCCCCGAGCGCGGA  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCAGGCAAGACCGAGGCCACCAAGAGGCTGCTGCAGTTCTATGCAGAGACCTGCCCAGCCCCCGAGCGCGGA  444

Query  397  GGTGCCGTGCGGGACCGGCTGCTACAGAGCAACCCGGTGCTGGAGGCCTTTGGAAATGCCAAGACCCTCCGGAA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTGCCGTGCGGGACCGGCTGCTACAGAGCAACCCGGTGCTGGAGGCCTTTGGAAATGCCAAGACCCTCCGGAA  518

Query  471  CGATAACTCCAGCAGGTTCGGGAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTTCAAGGGTGCCCCCGTGGGTGGCCACA  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGATAACTCCAGCAGGTTCGGGAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTTCAAGGGTGCCCCCGTGGGTGGCCACA  592

Query  545  TCCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCACGAGTGGTGCACCAGAATCATGGGGAGCGGAACTTCCACATCTTCTAC  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCACGAGTGGTGCACCAGAATCATGGGGAGCGGAACTTCCACATCTTCTAC  666

Query  619  CAGCTGCTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTTCGCAGGCTGGGCTTGGAACGGAACCCCCAGAGCTACCTGTA  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCTGCTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTTCGCAGGCTGGGCTTGGAACGGAACCCCCAGAGCTACCTGTA  740

Query  693  CCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAAGTCTCCTCCATCAACGACAAGAGTGACTGGAAGGTCGTCAGGAAGGCTC  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAAGTCTCCTCCATCAACGACAAGAGTGACTGGAAGGTCGTCAGGAAGGCTC  814

Query  767  TGACAGTCATTGATTTCACCGAGGATGAAGTGGAGGACCTGCTGAGCATCGTGGCCAGCGTCCTTCATTTGGGC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGACAGTCATTGATTTCACCGAGGATGAAGTGGAGGACCTGCTGAGCATCGTGGCCAGCGTCCTTCATTTGGGC  888

Query  841  AACATCCACTTTGCTGCCAACGAGGAGAGCAATGCCCAGGTCACCACCGAGAACCAGCTCAAGTATCTGACCAG  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACATCCACTTTGCTGCCAACGAGGAGAGCAATGCCCAGGTCACCACCGAGAACCAGCTCAAGTATCTGACCAG  962

Query  915  GCTCCTCAGCGTGGAAGGCTCGACGCTGCGAGAAGCCCTGACACACAGGAAGATCATCGCCAAGGGGGAGGAGC  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTCCTCAGCGTGGAAGGCTCGACGCTGCGAGAAGCCCTGACACACAGGAAGATCATCGCCAAGGGGGAGGAGC  1036

Query  989  TCCTGAGCCCGCTGAACCTGGAGCAGGCCGCGTACGCACGAGACGCCCTCGCCAAGGCTGTGTACAGCCGCACT  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCTGAGCCCGCTGAACCTGGAGCAGGCCGCGTACGCACGAGACGCCCTCGCCAAGGCTGTGTACAGCCGCACT  1110

Query 1063  TTTACCTGGCTCGTCGGGAAGATCAACAGGTCGCTGGCCTCCAAGGACGTGGAGAGCCCCAGCTGGCGGAGCAC  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTACCTGGCTCGTCGGGAAGATCAACAGGTCGCTGGCCTCCAAGGACGTGGAGAGCCCCAGCTGGCGGAGCAC  1184

Query 1137  CACGGTTCTCGGGCTCCTGGATATTTATGGCTTTGAAGTGTTTCAGCATAACAGCTTTGAGCAGTTCTGCATCA  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACGGTTCTCGGGCTCCTGGATATTTATGGCTTTGAAGTGTTTCAGCATAACAGCTTTGAGCAGTTCTGCATCA  1258

Query 1211  ATTACTGCAACGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTCACGCTCAAGTCGGAGCAGGAGGAGTACGAGGCA  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTACTGCAACGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTCACGCTCAAGTCGGAGCAGGAGGAGTACGAGGCA  1332

Query 1285  GAGGGCATCGCGTGGGAGCCCGTCCAGTATTTCAACAACAAAATCATCTGTGATCTGGTGGAGGAGAAGTTTAA  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGGCATCGCGTGGGAGCCCGTCCAGTATTTCAACAACAAAATCATCTGTGATCTGGTGGAGGAGAAGTTTAA  1406

Query 1359  GGGCATCATCTCGATTTTGGATGAGGAGTGTCTGCGCCCCGGGGAGGCCACAGACCTGACCTTCCTGGAGAAGC  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGCATCATCTCGATTTTGGATGAGGAGTGTCTGCGCCCCGGGGAGGCCACAGACCTGACCTTCCTGGAGAAGC  1480

Query 1433  TGGAGGATACTGTCAAGCACCATCCACACTTCCTGACGCACAAGCTGGCTGACCAGCGGACCAGGAAATCTCTG  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGAGGATACTGTCAAGCACCATCCACACTTCCTGACGCACAAGCTGGCTGACCAGCGGACCAGGAAATCTCTG  1554

Query 1507  GGCCGAGGGGAATTCCGCCTTCTGCACTATGCGGGGGAGGTGACCTACAGCGTGACCGGGTTTCTGGACAAAAA  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCCGAGGGGAATTCCGCCTTCTGCACTATGCGGGGGAGGTGACCTACAGCGTGACCGGGTTTCTGGACAAAAA  1628

Query 1581  CAATGACCTTCTCTTCCGGAACCTTAAGGAGACCATGTGTAGCTCAAAGAATCCCATTATGAGCCAGTGCTTTG  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAATGACCTTCTCTTCCGGAACCTTAAGGAGACCATGTGTAGCTCAAAGAATCCCATTATGAGCCAGTGCTTTG  1702

Query 1655  ACCGGAGCGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTCGCCACCCAGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTG  1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCGGAGCGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTCGCCACCCAGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTG  1776

Query 1729  GTGGAGATCCTGCAGTCTAAGGAGCCCGCCTACGTCCGCTGCATCAAACCCAATGATGCCAAACAGCCCGGCCG  1802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGGAGATCCTGCAGTCTAAGGAGCCCGCCTACGTCCGCTGCATCAAACCCAATGATGCCAAACAGCCCGGCCG  1850

Query 1803  CTTTGACGAGGTGCTGATCCGCCACCAGGTGAAGTACCTGGGGCTGTTGGAAAACCTGCGCGTGCGCAGAGCCG  1876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTTGACGAGGTGCTGATCCGCCACCAGGTGAAGTACCTGGGGCTGTTGGAAAACCTGCGCGTGCGCAGAGCCG  1924

Query 1877  GCTTTGCCTATCGCCGCAAATACGAAGCTTTCCTGCAAAGGTACAAGTCACTGTGCCCAGAGACGTGGCCCACG  1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCTTTGCCTATCGCCGCAAATACGAAGCTTTCCTGCAAAGGTACAAGTCACTGTGCCCAGAGACGTGGCCCACG  1998

Query 1951  TGGGCAGGACGGCCGCAGGATGGGGTGGCTGTGCTGGTCCGACACCTGGGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAGAT  2024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGGGCAGGACGGCCGCAGGATGGGGTGGCTGTGCTGGTCCGACACCTGGGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAGAT  2072

Query 2025  GGGCAGGACCAAGATCTTCATCCGCTTCCCCAAGACCCTGTTTGCCACAGAGGATGCCCTGGAGGTCCGGCGGC  2098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGGCAGGACCAAGATCTTCATCCGCTTCCCCAAGACCCTGTTTGCCACAGAGGATGCCCTGGAGGTCCGGCGGC  2146

Query 2099  AGAGCCTGGCCACAAAGATCCAAGCTGCCTGGAGGGGCTTTCACTGGCGGCAGAAATTCCTCCGGGTGAAGAGA  2172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGAGCCTGGCCACAAAGATCCAAGCTGCCTGGAGGGGCTTTCACTGGCGGCAGAAATTCCTCCGGGTGAAGAGA  2220

Query 2173  TCAGCCATCTGCATCCAGTCGTGGTGGCGTGGAACACTGGGCCGGAGGAAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCGGC  2246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCAGCCATCTGCATCCAGTCGTGGTGGCGTGGAACACTGGGCCGGAGGAAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCGGC  2294

Query 2247  ACAGACCATCCGGCGGCTCATCCGAGGCTTCATCCTGCGCCACGCCCCCCGCTGCCCCGAGAACGCCTTCTTCC  2320
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ACAGACCATCCGGCGGCTCATCCGAGGCTTCGTCCTGCGCCACGCCCCCCGCTGCCCCGAGAACGCCTTCTTCC  2368

Query 2321  TGGACCATGTGCGCACCTCTTTTTTGCTAAACCTGAGGCGGCAGCTGCCCCGGAATGTCCTGGACACCTCGTGG  2394
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGACCATGTGCGCACCTCTTTTTTGCTAAACCTGAGGCGGCAGCTGCCCCAGAATGTCCTGGACACCTCGTGG  2442

Query 2395  CCCACGCCCCCACCTGCCCTGCGTGAGGCCTCAGAGCTTCTGCGGGAGTTGTGCATAAAGAACATGGTGTGGAA  2468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCCACGCCCCCACCTGCCCTGCGTGAGGCCTCAGAGCTTCTGCGGGAGTTGTGCATAAAGAACATGGTGTGGAA  2516

Query 2469  ATACTGCCGGAGTATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAGAAGGCCGTGGCTAGTGAGATCTTCAAGG  2542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ATACTGCCGGAGTATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAGAAGGCCGTGGCTAGTGAGATCTTCAAGG  2590

Query 2543  GCAAGAAGGATAATTACCCTCAGAGTGTACCCAGGCTCTTCATCAGCACTCGGCTTGGTACAGATGAGATCAGC  2616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GCAAGAAGGATAATTACCCTCAGAGTGTACCCAGGCTCTTCATCAGCACTCGGCTTGGTACAGATGAGATCAGC  2664

Query 2617  CCCCGAGTGCTGCAGGCCTTGGGCTCTGAGCCCATTCAGTATGCGGTGCCTGTTGTGAAATACGACCGCAAGGG  2690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CCCCGAGTGCTGCAGGCCTTGGGCTCTGAGCCCATTCAGTATGCGGTGCCTGTTGTGAAATACGACCGCAAGGG  2738

Query 2691  CTACAAGCCTCGCTCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAACGCCGTCGTCATCGTGGAGGACGCCAAAGTCAAGC  2764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CTACAAGCCTCGCTCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAACGCCGTCGTCATCGTGGAGGACGCCAAAGTCAAGC  2812

Query 2765  AGAGGATTGATTACGCCAACCTGACCGGAATCTCTGTCAGCAGCCTGAGCGACAGTCTTTTTGTGCTTCATGTA  2838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGAGGATTGATTACGCCAACCTGACCGGAATCTCTGTCAGCAGCCTGAGCGACAGTCTTTTTGTGCTTCATGTA  2886

Query 2839  CAGCGTGCGGACAATAAGCAAAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGACCACGTGATTGAGACGCTGACCAAGAC  2912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CAGCGTGCGGACAATAAGCAAAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGACCACGTGATTGAGACGCTGACCAAGAC  2960

Query 2913  AGCCCTCAGTGCCAACCGCGTGAACAGCATCAACATCAACCAGGGCAGCATCACGTTTGCAGGGGGCCCCGGCA  2986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AGCCCTCAGTGCCAACCGCGTGAACAGCATCAACATCAACCAGGGCAGCATCACGTTTGCAGGGGGCCCCGGCA  3034

Query 2987  GGGATGGCACCATTGACTTCACACCCGGCTCGGAGCTGCTCATCACCAAGGCCAAGAACGGGCACCTGGCTGTG  3060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GGGATGGCACCATTGACTTCACACCCGGCTCGGAGCTGCTCATCACCAAGGCCAAGAACGGGCACCTGGCTGTG  3108

Query 3061  GTCGCCCCACGGCTGAATTCTCGG  3084
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GTCGCCCCACGGCTGAATTCTCGG  3132