Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06611
• Subject: NM_001080950.2
• Aligned Length: 1044
• Identities: 1026
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ----------------MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDL  58
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MRYRASALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDL  74

Query   59  QIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERG  132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  QIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERG  148

Query  133  GAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFY  206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFY  222

Query  207  QLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLG  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  QLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLG  296

Query  281  NIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRT  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  NIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRT  370

Query  355  FTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEA  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  FTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEA  444

Query  429  EGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSL  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  EGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSL  518

Query  503  GRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFKMSLLQL  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFKMSLLQL  592

Query  577  VEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPT  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  VEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPT  666

Query  651  WAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKR  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  WAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKR  740

Query  725  SAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSW  798
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  SAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSW  814

Query  799  PTPPPALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEIS  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  PTPPPALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEIS  888

Query  873  PRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHV  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  PRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHV  962

Query  947  QRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAV  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  QRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAV  1036

Query 1021  VAPRLNSR  1028
            ||||||||
Sbjct 1037  VAPRLNSR  1044