Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06611
• Subject: NM_001363855.1
• Aligned Length: 1039
• Identities: 1026
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  -----------MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSR  63
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSR  74

Query   64  QHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRD  137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  QHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRD  148

Query  138  RLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEG  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  RLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEG  222

Query  212  GEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFA  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFA  296

Query  286  ANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLV  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLV  370

Query  360  GKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAW  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAW  444

Query  434  EPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEF  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  EPVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEF  518

Query  508  RLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFKMSLLQLVEILQ  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  RLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFKMSLLQLVEILQ  592

Query  582  SKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRP  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  SKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRP  666

Query  656  QDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICI  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  QDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICI  740

Query  730  QSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPP  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  741  QSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPP  814

Query  804  ALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQ  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQ  888

Query  878  ALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADN  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADN  962

Query  952  KQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRL  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  KQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRL  1036

Query 1026  NSR  1028
            |||
Sbjct 1037  NSR  1039