Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06611
Subject:
NM_008659.3
Aligned Length:
1028
Identities:
996
Gaps:
0

Alignment

Query    1  MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSF  74
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Sbjct    1  MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSF  74

Query   75  YEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEA  148
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Sbjct   75  YEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEA  148

Query  149  FGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGL  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  FGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHVFYQLLEGGEEETLRRLGL  222

Query  223  ERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  223  ERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVMRKALSVIDFTEDEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAADEDSNAQVTT  296

Query  297  ENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKD  370
            |||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  ENQLKYLTRLLGVEGTTLREALTHRKIIAKGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVRKINRSLASKD  370

Query  371  VESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKII  444
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AESPSWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKII  444

Query  445  CDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLLHYAGEVTY  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  445  CDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKPHPHFLTHKLADQKTRKSLDRGEFRLLHYAGEVTY  518

Query  519  SVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIK  592
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Sbjct  519  SVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSMNPIMAQCFDKSELSDKKRPETVATQFKMSLLQLVEILRSKEPAYIRCIK  592

Query  593  PNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHL  666
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  593  PNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLMENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPMWAGRPQDGVAVLVRHL  666

Query  667  GYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRR  740
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDSLEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRR  740

Query  741  KAAKRKWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPALREASELLRE  814
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Sbjct  741  KAAKRKWAAQTIRRLIRGFILRHSPRCPENAFFLDHVRASFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPALREASELLRE  814

Query  815  LCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQALGSEPIQYAV  888
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  815  LCMKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTEEISPRVLQSLGSEPIQYAV  888

Query  889  PVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSD  962
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Sbjct  889  PVVKYDRKGYKPRPRQLLLTPSAVVIVEDAKVKQRIDYANLTGISVSSLSDSLFVLHVQREDNKQKGDVVLQSD  962

Query  963  HVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR  1028
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Sbjct  963  HVIETLTKTALSADRVNNININQGSITFAGGPGRDGIIDFTSGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR  1028