Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06611
• Subject: NM_033375.5
• Aligned Length: 3084
• Identities: 3082
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGAGTGCGCTCACCGCCCGTGACCGGGTGGGGGTGCAGGATTTCGTGCTGCTGGAGAACTTCACCAGCGA  74
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Sbjct    1  ATGGAGAGTGCGCTCACCGCCCGTGACCGGGTGGGGGTGCAGGATTTCGTGCTGCTGGAGAACTTCACCAGCGA  74

Query   75  GGCCGCCTTCATCGAGAACCTGCGGCGGCGATTTCGGGAGAATCTCATCTACACCTACATTGGCCCCGTCCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCGCCTTCATCGAGAACCTGCGGCGGCGATTTCGGGAGAATCTCATCTACACCTACATTGGCCCCGTCCTGG  148

Query  149  TCTCTGTCAATCCCTACCGGGACCTGCAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAGCGTTACCGTGGCGTCAGCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCTGTCAATCCCTACCGGGACCTGCAGATCTACAGCCGGCAGCATATGGAGCGTTACCGTGGCGTCAGCTTC  222

Query  223  TATGAAGTGCCCCCTCACCTGTTTGCCGTGGCGGACACTGTGTACCGAGCACTGCGCACGGAGCGTCGGGACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGAAGTGCCCCCTCACCTGTTTGCCGTGGCGGACACTGTGTACCGAGCACTGCGCACGGAGCGTCGGGACCA  296

Query  297  GGCTGTGATGATCTCTGGGGAGAGCGGGGCAGGCAAGACCGAGGCCACCAAGAGGCTGCTGCAGTTCTATGCAG  370
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Sbjct  297  GGCTGTGATGATCTCTGGGGAGAGCGGGGCAGGCAAGACCGAGGCCACCAAGAGGCTGCTGCAGTTCTATGCAG  370

Query  371  AGACCTGCCCAGCCCCCGAGCGCGGAGGTGCCGTGCGGGACCGGCTGCTACAGAGCAACCCGGTGCTGGAGGCC  444
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Sbjct  371  AGACCTGCCCAGCCCCCGAGCGCGGAGGTGCCGTGCGGGACCGGCTGCTACAGAGCAACCCGGTGCTGGAGGCC  444

Query  445  TTTGGAAATGCCAAGACCCTCCGGAACGATAACTCCAGCAGGTTCGGGAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTT  518
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Sbjct  445  TTTGGAAATGCCAAGACCCTCCGGAACGATAACTCCAGCAGGTTCGGGAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTT  518

Query  519  CAAGGGTGCCCCCGTGGGTGGCCACATCCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCACGAGTGGTGCACCAGAATCATG  592
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Sbjct  519  CAAGGGTGCCCCCGTGGGTGGCCACATCCTCAGTTACCTCCTGGAAAAGTCACGAGTGGTGCACCAGAATCATG  592

Query  593  GGGAGCGGAACTTCCACATCTTCTACCAGCTGCTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTTCGCAGGCTGGGCTTG  666
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Sbjct  593  GGGAGCGGAACTTCCACATCTTCTACCAGCTGCTGGAGGGGGGCGAGGAGGAGACTCTTCGCAGGCTGGGCTTG  666

Query  667  GAACGGAACCCCCAGAGCTACCTGTACCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAAGTCTCCTCCATCAACGACAAGAG  740
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Sbjct  667  GAACGGAACCCCCAGAGCTACCTGTACCTGGTGAAGGGCCAGTGTGCCAAAGTCTCCTCCATCAACGACAAGAG  740

Query  741  TGACTGGAAGGTCGTCAGGAAGGCTCTGACAGTCATTGATTTCACCGAGGATGAAGTGGAGGACCTGCTGAGCA  814
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Sbjct  741  TGACTGGAAGGTCGTCAGGAAGGCTCTGACAGTCATTGATTTCACCGAGGATGAAGTGGAGGACCTGCTGAGCA  814

Query  815  TCGTGGCCAGCGTCCTTCATTTGGGCAACATCCACTTTGCTGCCAACGAGGAGAGCAATGCCCAGGTCACCACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGTGGCCAGCGTCCTTCATTTGGGCAACATCCACTTTGCTGCCAACGAGGAGAGCAATGCCCAGGTCACCACC  888

Query  889  GAGAACCAGCTCAAGTATCTGACCAGGCTCCTCAGCGTGGAAGGCTCGACGCTGCGAGAAGCCCTGACACACAG  962
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Sbjct  889  GAGAACCAGCTCAAGTATCTGACCAGGCTCCTCAGCGTGGAAGGCTCGACGCTGCGAGAAGCCCTGACACACAG  962

Query  963  GAAGATCATCGCCAAGGGGGAGGAGCTCCTGAGCCCGCTGAACCTGGAGCAGGCCGCGTACGCACGAGACGCCC  1036
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Sbjct  963  GAAGATCATCGCCAAGGGGGAGGAGCTCCTGAGCCCGCTGAACCTGGAGCAGGCCGCGTACGCACGAGACGCCC  1036

Query 1037  TCGCCAAGGCTGTGTACAGCCGCACTTTTACCTGGCTCGTCGGGAAGATCAACAGGTCGCTGGCCTCCAAGGAC  1110
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Sbjct 1037  TCGCCAAGGCTGTGTACAGCCGCACTTTTACCTGGCTCGTCGGGAAGATCAACAGGTCGCTGGCCTCCAAGGAC  1110

Query 1111  GTGGAGAGCCCCAGCTGGCGGAGCACCACGGTTCTCGGGCTCCTGGATATTTATGGCTTTGAAGTGTTTCAGCA  1184
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Sbjct 1111  GTGGAGAGCCCCAGCTGGCGGAGCACCACGGTTCTCGGGCTCCTGGATATTTATGGCTTTGAAGTGTTTCAGCA  1184

Query 1185  TAACAGCTTTGAGCAGTTCTGCATCAATTACTGCAACGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTCACGCTCA  1258
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Sbjct 1185  TAACAGCTTTGAGCAGTTCTGCATCAATTACTGCAACGAGAAGCTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTCACGCTCA  1258

Query 1259  AGTCGGAGCAGGAGGAGTACGAGGCAGAGGGCATCGCGTGGGAGCCCGTCCAGTATTTCAACAACAAAATCATC  1332
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Sbjct 1259  AGTCGGAGCAGGAGGAGTACGAGGCAGAGGGCATCGCGTGGGAGCCCGTCCAGTATTTCAACAACAAAATCATC  1332

Query 1333  TGTGATCTGGTGGAGGAGAAGTTTAAGGGCATCATCTCGATTTTGGATGAGGAGTGTCTGCGCCCCGGGGAGGC  1406
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Sbjct 1333  TGTGATCTGGTGGAGGAGAAGTTTAAGGGCATCATCTCGATTTTGGATGAGGAGTGTCTGCGCCCCGGGGAGGC  1406

Query 1407  CACAGACCTGACCTTCCTGGAGAAGCTGGAGGATACTGTCAAGCACCATCCACACTTCCTGACGCACAAGCTGG  1480
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Sbjct 1407  CACAGACCTGACCTTCCTGGAGAAGCTGGAGGATACTGTCAAGCACCATCCACACTTCCTGACGCACAAGCTGG  1480

Query 1481  CTGACCAGCGGACCAGGAAATCTCTGGGCCGAGGGGAATTCCGCCTTCTGCACTATGCGGGGGAGGTGACCTAC  1554
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Sbjct 1481  CTGACCAGCGGACCAGGAAATCTCTGGGCCGAGGGGAATTCCGCCTTCTGCACTATGCGGGGGAGGTGACCTAC  1554

Query 1555  AGCGTGACCGGGTTTCTGGACAAAAACAATGACCTTCTCTTCCGGAACCTTAAGGAGACCATGTGTAGCTCAAA  1628
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Sbjct 1555  AGCGTGACCGGGTTTCTGGACAAAAACAATGACCTTCTCTTCCGGAACCTTAAGGAGACCATGTGTAGCTCAAA  1628

Query 1629  GAATCCCATTATGAGCCAGTGCTTTGACCGGAGCGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTCGCCACCC  1702
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Sbjct 1629  GAATCCCATTATGAGCCAGTGCTTTGACCGGAGCGAGCTCAGTGACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTCGCCACCC  1702

Query 1703  AGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTGGTGGAGATCCTGCAGTCTAAGGAGCCCGCCTACGTCCGCTGCATCAAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTGGTGGAGATCCTGCAGTCTAAGGAGCCCGCCTACGTCCGCTGCATCAAA  1776

Query 1777  CCCAATGATGCCAAACAGCCCGGCCGCTTTGACGAGGTGCTGATCCGCCACCAGGTGAAGTACCTGGGGCTGTT  1850
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Sbjct 1777  CCCAATGATGCCAAACAGCCCGGCCGCTTTGACGAGGTGCTGATCCGCCACCAGGTGAAGTACCTGGGGCTGTT  1850

Query 1851  GGAAAACCTGCGCGTGCGCAGAGCCGGCTTTGCCTATCGCCGCAAATACGAAGCTTTCCTGCAAAGGTACAAGT  1924
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Sbjct 1851  GGAAAACCTGCGCGTGCGCAGAGCCGGCTTTGCCTATCGCCGCAAATACGAAGCTTTCCTGCAAAGGTACAAGT  1924

Query 1925  CACTGTGCCCAGAGACGTGGCCCACGTGGGCAGGACGGCCGCAGGATGGGGTGGCTGTGCTGGTCCGACACCTG  1998
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Sbjct 1925  CACTGTGCCCAGAGACGTGGCCCACGTGGGCAGGACGGCCGCAGGATGGGGTGGCTGTGCTGGTCCGACACCTG  1998

Query 1999  GGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAGATGGGCAGGACCAAGATCTTCATCCGCTTCCCCAAGACCCTGTTTGCCAC  2072
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Sbjct 1999  GGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAGATGGGCAGGACCAAGATCTTCATCCGCTTCCCCAAGACCCTGTTTGCCAC  2072

Query 2073  AGAGGATGCCCTGGAGGTCCGGCGGCAGAGCCTGGCCACAAAGATCCAAGCTGCCTGGAGGGGCTTTCACTGGC  2146
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Sbjct 2073  AGAGGATGCCCTGGAGGTCCGGCGGCAGAGCCTGGCCACAAAGATCCAAGCTGCCTGGAGGGGCTTTCACTGGC  2146

Query 2147  GGCAGAAATTCCTCCGGGTGAAGAGATCAGCCATCTGCATCCAGTCGTGGTGGCGTGGAACACTGGGCCGGAGG  2220
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Sbjct 2147  GGCAGAAATTCCTCCGGGTGAAGAGATCAGCCATCTGCATCCAGTCGTGGTGGCGTGGAACACTGGGCCGGAGG  2220

Query 2221  AAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCGGCACAGACCATCCGGCGGCTCATCCGAGGCTTCATCCTGCGCCACGCCCC  2294
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2221  AAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCGGCACAGACCATCCGGCGGCTCATCCGAGGCTTCGTCCTGCGCCACGCCCC  2294

Query 2295  CCGCTGCCCCGAGAACGCCTTCTTCCTGGACCATGTGCGCACCTCTTTTTTGCTAAACCTGAGGCGGCAGCTGC  2368
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Sbjct 2295  CCGCTGCCCCGAGAACGCCTTCTTCCTGGACCATGTGCGCACCTCTTTTTTGCTAAACCTGAGGCGGCAGCTGC  2368

Query 2369  CCCGGAATGTCCTGGACACCTCGTGGCCCACGCCCCCACCTGCCCTGCGTGAGGCCTCAGAGCTTCTGCGGGAG  2442
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCCAGAATGTCCTGGACACCTCGTGGCCCACGCCCCCACCTGCCCTGCGTGAGGCCTCAGAGCTTCTGCGGGAG  2442

Query 2443  TTGTGCATAAAGAACATGGTGTGGAAATACTGCCGGAGTATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAGAA  2516
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Sbjct 2443  TTGTGCATAAAGAACATGGTGTGGAAATACTGCCGGAGTATCAGCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAGAA  2516

Query 2517  GGCCGTGGCTAGTGAGATCTTCAAGGGCAAGAAGGATAATTACCCTCAGAGTGTACCCAGGCTCTTCATCAGCA  2590
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Sbjct 2517  GGCCGTGGCTAGTGAGATCTTCAAGGGCAAGAAGGATAATTACCCTCAGAGTGTACCCAGGCTCTTCATCAGCA  2590

Query 2591  CTCGGCTTGGTACAGATGAGATCAGCCCCCGAGTGCTGCAGGCCTTGGGCTCTGAGCCCATTCAGTATGCGGTG  2664
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Sbjct 2591  CTCGGCTTGGTACAGATGAGATCAGCCCCCGAGTGCTGCAGGCCTTGGGCTCTGAGCCCATTCAGTATGCGGTG  2664

Query 2665  CCTGTTGTGAAATACGACCGCAAGGGCTACAAGCCTCGCTCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAACGCCGTCGT  2738
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Sbjct 2665  CCTGTTGTGAAATACGACCGCAAGGGCTACAAGCCTCGCTCCCGGCAGCTGCTGCTCACGCCCAACGCCGTCGT  2738

Query 2739  CATCGTGGAGGACGCCAAAGTCAAGCAGAGGATTGATTACGCCAACCTGACCGGAATCTCTGTCAGCAGCCTGA  2812
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Sbjct 2739  CATCGTGGAGGACGCCAAAGTCAAGCAGAGGATTGATTACGCCAACCTGACCGGAATCTCTGTCAGCAGCCTGA  2812

Query 2813  GCGACAGTCTTTTTGTGCTTCATGTACAGCGTGCGGACAATAAGCAAAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGAC  2886
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Sbjct 2813  GCGACAGTCTTTTTGTGCTTCATGTACAGCGTGCGGACAATAAGCAAAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGAC  2886

Query 2887  CACGTGATTGAGACGCTGACCAAGACAGCCCTCAGTGCCAACCGCGTGAACAGCATCAACATCAACCAGGGCAG  2960
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Sbjct 2887  CACGTGATTGAGACGCTGACCAAGACAGCCCTCAGTGCCAACCGCGTGAACAGCATCAACATCAACCAGGGCAG  2960

Query 2961  CATCACGTTTGCAGGGGGCCCCGGCAGGGATGGCACCATTGACTTCACACCCGGCTCGGAGCTGCTCATCACCA  3034
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Sbjct 2961  CATCACGTTTGCAGGGGGCCCCGGCAGGGATGGCACCATTGACTTCACACCCGGCTCGGAGCTGCTCATCACCA  3034

Query 3035  AGGCCAAGAACGGGCACCTGGCTGTGGTCGCCCCACGGCTGAATTCTCGG  3084
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Sbjct 3035  AGGCCAAGAACGGGCACCTGGCTGTGGTCGCCCCACGGCTGAATTCTCGG  3084