Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06611
• Subject: XM_006532429.3
• Aligned Length: 3189
• Identities: 2737
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCACTCCAAGTAGAACTGATACCAACGGGAGAGATCATCCGTGTGGTCCATCCCCACAGGCCATGCAAACT  74

Query    1  -------------------------------ATGGAGAGTGCGCTCACCGCCCGTGACCGGGTGGGGGTGCAGG  43
                                           ||||||||.||..|.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CGCCCTGGGCAGTGACGGGGTTCGAGTGACCATGGAGAGCGCCTTGACTGCCCGAGACCGGGTAGGGGTGCAGG  148

Query   44  ATTTCGTGCTGCTGGAGAACTTCACCAGCGAGGCCGCCTTCATCGAGAACCTGCGGCGGCGATTTCGGGAGAAT  117
            |.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  149  ACTTTGTCCTGCTGGAGAATTTCACCAGTGAGGCTGCCTTCATTGAGAACCTCCGGCGGCGGTTCCGGGAGAAC  222

Query  118  CTCATCTACACCTACATTGGCCCCGTCCTGGTCTCTGTCAATCCCTACCGGGACCTGCAGATCTACAGCCGGCA  191
            |||||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCATTTATACCTACATCGGTCCTGTCCTAGTCTCTGTCAATCCCTACCGAGACCTACAGATCTACAGCCGGCA  296

Query  192  GCATATGGAGCGTTACCGTGGCGTCAGCTTCTATGAAGTGCCCCCTCACCTGTTTGCCGTGGCGGACACTGTGT  265
            |||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||..|||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  297  GCATATGGAACGCTACCGTGGTGTCAGTTTCTATGAAGTACCACCTCATTTGTTTGCAGTGGCTGACACTGTAT  370

Query  266  ACCGAGCACTGCGCACGGAGCGTCGGGACCAGGCTGTGATGATCTCTGGGGAGAGCGGGGCAGGCAAGACCGAG  339
            ||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  ACCGGGCACTTCGTACTGAGCGTCGGGACCAGGCAGTGATGATTTCTGGAGAGAGTGGGGCAGGCAAGACAGAG  444

Query  340  GCCACCAAGAGGCTGCTGCAGTTCTATGCAGAGACCTGCCCAGCCCCCGAGCGCGGAGGTGCCGTGCGGGACCG  413
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  445  GCCACCAAGAGACTGCTCCAGTTCTATGCAGAGACCTGCCCAGCCCCTGAACGGGGTGGCGCAGTGCGAGACCG  518

Query  414  GCTGCTACAGAGCAACCCGGTGCTGGAGGCCTTTGGAAATGCCAAGACCCTCCGGAACGATAACTCCAGCAGGT  487
            .|||.|.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct  519  CCTGTTGCAGAGCAACCCCGTGTTAGAGGCCTTTGGGAATGCCAAGACTCTCCGCAACGATAACTCCAGCCGGT  592

Query  488  TCGGGAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTTCAAGGGTGCCCCCGTGGGTGGCCACATCCTCAGTTACCTCCTG  561
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  TTGGAAAGTACATGGATGTGCAGTTTGACTTCAAGGGTGCCCCCGTGGGAGGCCACATTCTCAGTTACCTCCTG  666

Query  562  GAAAAGTCACGAGTGGTGCACCAGAATCATGGGGAGCGGAACTTCCACATCTTCTACCAGCTGCTGGAGGGGGG  635
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GAAAAGTCCCGGGTGGTGCACCAAAATCACGGAGAGCGGAACTTCCACGTCTTTTACCAGCTACTGGAGGGGGG  740

Query  636  CGAGGAGGAGACTCTTCGCAGGCTGGGCTTGGAACGGAACCCCCAGAGCTACCTGTACCTGGTGAAGGGCCAGT  709
            |||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGAGGAGGAGACTCTCCGTCGGCTGGGCTTGGAACGGAACCCCCAGAGCTACTTGTACCTGGTGAAGGGCCAGT  814

Query  710  GTGCCAAAGTCTCCTCCATCAACGACAAGAGTGACTGGAAGGTCGTCAGGAAGGCTCTGACAGTCATTGATTTC  783
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct  815  GTGCCAAGGTCTCCTCCATCAACGACAAGAGTGACTGGAAGGTTATGAGGAAGGCGCTGTCCGTCATTGACTTC  888

Query  784  ACCGAGGATGAAGTGGAGGACCTGCTGAGCATCGTGGCCAGCGTCCTTCATTTGGGCAACATCCACTTTGCTGC  857
            ||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGAGGATGAAGTGGAGGACTTGCTCAGCATCGTGGCCAGCGTCCTACATCTGGGCAACATCCACTTTGCTGC  962

Query  858  CAACGAGGAGAGCAATGCCCAGGTCACCACCGAGAACCAGCTCAAGTATCTGACCAGGCTCCTCAGCGTGGAAG  931
            ..|||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.|||||||
Sbjct  963  TGACGAGGACAGCAATGCCCAGGTTACTACTGAGAACCAGCTCAAATATCTGACCAGGCTCCTTGGTGTGGAAG  1036

Query  932  GCTCGACGCTGCGAGAAGCCCTGACACACAGGAAGATCATCGCCAAGGGGGAGGAGCTCCTGAGCCCGCTGAAC  1005
            |..|.||.||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  GTACAACACTTAGGGAAGCCCTGACCCACAGGAAGATCATCGCCAAGGGGGAAGAGCTCCTGAGCCCACTGAAC  1110

Query 1006  CTGGAGCAGGCCGCGTACGCACGAGACGCCCTCGCCAAGGCTGTGTACAGCCGCACTTTTACCTGGCTCGTCGG  1079
            ||.||.|||||.||.||.|||.|.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||.|
Sbjct 1111  CTTGAACAGGCGGCATATGCAAGGGATGCGCTTGCCAAGGCTGTGTACAGCCGGACATTCACCTGGCTGGTCAG  1184

Query 1080  GAAGATCAACAGGTCGCTGGCCTCCAAGGACGTGGAGAGCCCCAGCTGGCGGAGCACCACGGTTCTCGGGCTCC  1153
            .||||||||.|||||.||||||||.|||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1185  AAAGATCAATAGGTCACTGGCCTCTAAGGACGCTGAGAGCCCCAGCTGGCGAAGCACCACGGTTCTTGGGCTCC  1258

Query 1154  TGGATATTTATGGCTTTGAAGTGTTTCAGCATAACAGCTTTGAGCAGTTCTGCATCAATTACTGCAACGAGAAG  1227
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1259  TGGACATTTACGGCTTTGAAGTGTTTCAGCATAACAGCTTCGAGCAGTTCTGCATCAACTACTGCAATGAGAAG  1332

Query 1228  CTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTCACGCTCAAGTCGGAGCAGGAGGAGTACGAGGCAGAGGGCATCGCGTGGGA  1301
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCAGCAGCTCTTCATCGAGCTGACTCTCAAGTCGGAGCAGGAGGAATACGAGGCTGAGGGCATCGCGTGGGA  1406

Query 1302  GCCCGTCCAGTATTTCAACAACAAAATCATCTGTGATCTGGTGGAGGAGAAGTTTAAGGGCATCATCTCGATTT  1375
            .||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1407  ACCTGTCCAGTACTTCAACAACAAGATCATCTGTGACCTGGTAGAGGAGAAGTTCAAGGGCATCATCTCCATCT  1480

Query 1376  TGGATGAGGAGTGTCTGCGCCCCGGGGAGGCCACAGACCTGACCTTCCTGGAGAAGCTGGAGGATACTGTCAAG  1449
            |||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1481  TGGATGAAGAGTGCCTGCGTCCTGGGGAGGCCACGGACCTGACCTTTCTGGAGAAGTTGGAGGACACTGTCAAG  1554

Query 1450  CACCATCCACACTTCCTGACGCACAAGCTGGCTGACCAGCGGACCAGGAAATCTCTGGGCCGAGGGGAATTCCG  1523
            |.|||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 1555  CCCCACCCTCACTTCCTGACGCACAAGCTCGCTGACCAGAAGACCAGGAAATCTCTAGACCGAGGGGAGTTCCG  1628

Query 1524  CCTTCTGCACTATGCGGGGGAGGTGACCTACAGCGTGACCGGGTTTCTGGACAAAAACAATGACCTTCTCTTCC  1597
            |||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  CCTTCTGCATTATGCTGGAGAGGTGACCTACAGTGTGACTGGGTTTCTGGATAAAAACAATGACCTCCTCTTCC  1702

Query 1598  GGAACCTTAAGGAGACCATGTGTAGCTCAAAGAATCCCATTATGAGCCAGTGCTTTGACCGGAGCGAGCTCAGT  1671
            |||||||.||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.|||..|||||||||||||..|||.|||||||||
Sbjct 1703  GGAACCTGAAGGAGACCATGTGCAGCTCAATGAACCCCATCATGGCCCAGTGCTTTGACAAGAGTGAGCTCAGT  1776

Query 1672  GACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTCGCCACCCAGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTGGTGGAGATCCTGCAGTC  1745
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||..|||
Sbjct 1777  GACAAGAAGCGGCCAGAGACGGTGGCCACCCAGTTCAAGATGAGCCTCCTGCAGCTCGTGGAGATCCTGAGGTC  1850

Query 1746  TAAGGAGCCCGCCTACGTCCGCTGCATCAAACCCAATGATGCCAAACAGCCCGGCCGCTTTGACGAGGTGCTGA  1819
            |||||||||.|||||..||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1851  TAAGGAGCCTGCCTATATCCGGTGCATCAAGCCAAACGACGCCAAGCAGCCGGGTCGCTTTGATGAGGTGCTCA  1924

Query 1820  TCCGCCACCAGGTGAAGTACCTGGGGCTGTTGGAAAACCTGCGCGTGCGCAGAGCCGGCTTTGCCTATCGCCGC  1893
            ||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1925  TCCGACATCAGGTGAAGTACCTGGGACTGATGGAGAATCTGCGCGTGCGCAGAGCTGGCTTTGCCTATCGTCGC  1998

Query 1894  AAATACGAAGCTTTCCTGCAAAGGTACAAGTCACTGTGCCCAGAGACGTGGCCCACGTGGGCAGGACGGCCGCA  1967
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1999  AAATATGAGGCTTTCCTGCAGAGGTACAAGTCACTGTGCCCAGAGACATGGCCCATGTGGGCAGGACGGCCCCA  2072

Query 1968  GGATGGGGTGGCTGTGCTGGTCCGACACCTGGGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAGATGGGCAGGACCAAGATCT  2041
            ||||||.|||||.|||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2073  GGATGGTGTGGCCGTGTTGGTCAGACACCTCGGCTACAAGCCAGAAGAGTACAAAATGGGCAGGACTAAGATCT  2146

Query 2042  TCATCCGCTTCCCCAAGACCCTGTTTGCCACAGAGGATGCCCTGGAGGTCCGGCGGCAGAGCCTGGCCACAAAG  2115
            |||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2147  TCATCCGATTTCCCAAGACCTTGTTTGCCACAGAGGACTCCCTGGAAGTCCGGCGGCAGAGTCTAGCCACCAAG  2220

Query 2116  ATCCAAGCTGCCTGGAGGGGCTTTCACTGGCGGCAGAAATTCCTCCGGGTGAAGAGATCAGCCATCTGCATCCA  2189
            |||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 2221  ATCCAGGCGGCCTGGAGGGGCTTTCATTGGCGACAGAAATTTCTCCGGGTGAAGCGATCAGCCATCTGTATCCA  2294

Query 2190  GTCGTGGTGGCGTGGAACACTGGGCCGGAGGAAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCGGCACAGACCATCCGGCGGC  2263
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct 2295  GTCATGGTGGCGTGGCACACTGGGCCGGAGGAAGGCAGCCAAGAGGAAGTGGGCAGCCCAGACCATCCGTCGAC  2368

Query 2264  TCATCCGAGGCTTCATCCTGCGCCACGCCCCCCGCTGCCCCGAGAACGCCTTCTTCCTGGACCATGTGCGCACC  2337
            |||||||.||||||||..|||||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|||||||.||||||.||
Sbjct 2369  TCATCCGTGGCTTCATTTTGCGCCATTCACCCCGGTGCCCTGAGAATGCCTTCTTCTTGGACCACGTGCGCGCC  2442

Query 2338  TCTTTTTTGCTAAACCTGAGGCGGCAGCTGCCCCGGAATGTCCTGGACACCTCGTGGCCCACGCCCCCACCTGC  2411
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2443  TCATTTTTGCTTAACCTGAGGCGGCAACTGCCCCGGAATGTTCTGGACACCTCCTGGCCCACACCCCCACCTGC  2516

Query 2412  CCTGCGTGAGGCCTCAGAGCTTCTGCGGGAGTTGTGCATAAAGAACATGGTGTGGAAATACTGCCGGAGTATCA  2485
            ||||.|.|||||||||||.||.||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2517  CCTGAGAGAGGCCTCAGAACTGCTACGGGAACTGTGCATGAAGAACATGGTGTGGAAGTACTGCCGGAGCATCA  2590

Query 2486  GCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAGAAGGCCGTGGCTAGTGAGATCTTCAAGGGCAAGAAGGATAATTAC  2559
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2591  GCCCTGAGTGGAAGCAGCAGCTGCAGCAAAAGGCGGTGGCTAGTGAAATTTTCAAGGGCAAGAAGGACAACTAC  2664

Query 2560  CCTCAGAGTGTACCCAGGCTCTTCATCAGCACTCGGCTTGGTACAGATGAGATCAGCCCCCGAGTGCTGCAGGC  2633
            ||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||..|
Sbjct 2665  CCCCAGAGTGTCCCCAGACTCTTCATTAGCACACGGCTTGGCACAGAGGAGATCAGCCCCAGAGTGCTTCAATC  2738

Query 2634  CTTGGGCTCTGAGCCCATTCAGTATGCGGTGCCTGTTGTGAAATACGACCGCAAGGGCTACAAGCCTCGCTCCC  2707
            ||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|||
Sbjct 2739  CTTGGGCTCTGAACCCATCCAGTATGCCGTGCCCGTGGTAAAATACGACCGTAAGGGTTACAAGCCTCGCCCCC  2812

Query 2708  GGCAGCTGCTGCTCACGCCCAACGCCGTCGTCATCGTGGAGGACGCCAAAGTCAAGCAGAGGATTGATTACGCC  2781
            |||||||||||||||||||||..||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2813  GGCAGCTGCTGCTCACGCCCAGTGCTGTGGTCATTGTGGAGGATGCTAAAGTCAAGCAGAGAATTGATTATGCC  2886

Query 2782  AACCTGACCGGAATCTCTGTCAGCAGCCTGAGCGACAGTCTTTTTGTGCTTCATGTACAGCGTGCGGACAATAA  2855
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||..|||||.||
Sbjct 2887  AACCTAACCGGAATCTCTGTCAGTAGCCTGAGTGATAGCCTATTTGTGCTTCACGTGCAGCGTGAAGACAACAA  2960

Query 2856  GCAAAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGACCACGTGATTGAGACGCTGACCAAGACAGCCCTCAGTGCCAACC  2929
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||..|||
Sbjct 2961  GCAGAAGGGAGATGTGGTGCTGCAGAGTGATCATGTGATCGAGACACTAACCAAGACGGCCCTCAGTGCTGACC  3034

Query 2930  GCGTGAACAGCATCAACATCAACCAGGGCAGCATCACGTTTGCAGGGGGCCCCGGCAGGGATGGCACCATTGAC  3003
            |||||||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct 3035  GCGTGAACAATATCAACATCAACCAGGGCAGCATAACGTTTGCAGGGGGTCCAGGCAGGGACGGCATCATTGAC  3108

Query 3004  TTCACACCCGGCTCGGAGCTGCTCATCACCAAGGCCAAGAACGGGCACCTGGCTGTGGTCGCCCCACGGCTGAA  3077
            ||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 3109  TTCACATCGGGCTCAGAGCTTCTCATCACCAAGGCTAAGAATGGCCACCTGGCTGTGGTGGCCCCACGGCTGAA  3182

Query 3078  TTCTCGG  3084
            |||||||
Sbjct 3183  TTCTCGG  3189